Thermo Fisher، 551042، مصفوفة تحديد النمط الجيني Axiom™ Strawberry FanaSNP 50k، بتنسيق mini-96

مصفوفة Axiom™ Strawberry FanaSNP 50k لتحديد النمط الجيني، بتنسيق mini-96. توفر مصفوفة Axiom FanaSNP Strawberry 50K لتحديد النمط الجيني تغطية شاملة للجينوم للتغيرات النوكليوتيدية المفردة متعددة الأشكال (SNPs) عبر أنواع الفراولة المزروعة والبرية ثمانية الصبغيات. وهي جزء من حل Axiom Agrigenomics لتحديد النمط الجيني، حيث يتم تحضير الحمض النووي الجينومي المستهدف ومعالجته على جهاز GeneTitan متعدد القنوات. تشمل العملية الآلية تهجين الحمض النووي الجينومي مع هذه المصفوفة الدقيقة عالية الإنتاجية، يليه التلوين والغسل والتصوير، ثم إخراج بيانات تحديد النمط الجيني لمزيد من التحليل. تتوفر المصفوفة أيضًا بتنسيق 384-HT (رقم المنتج 551042).
تم تصميم مصفوفة Axiom FanaSNP Strawberry 50K Genotyping Array بواسطة برنامج تربية الفراولة بجامعة كاليفورنيا، ديفيس بالتعاون مع برنامج Affymetrix Expert Design Program1.
محتوى المصفوفة: محتوى شامل: 850,000 من المتغيرات النوكليوتيدية المفردة (SNPs) الخاصة بالجينومات الفرعية من سلالات فراولة ثمانية الصبغيات متنوعة من جميع أنحاء العالم. وقد أنتجت 446,644 من أصل 850,000 مجسًا من مجسات العلامات مجموعات من الأنماط الجينية للمتغيرات النوكليوتيدية المفردة متعددة الأشكال، والتي اجتازت اختبارات مراقبة الجودة، مما يدل على الانفصال ثنائي الصبغيات (متعدد الصبغيات). تتوفر المجموعة الكاملة من 446,644 مجسًا مُدقَّقًا للاستخدام العام.
تصميم المصفوفة على نطاق الإنتاج: تم اختبار مجموعة الـ 49,483 من المتغيرات الجينية أحادية النوكليوتيد (SNPs) الأكثر كفاءة والتحقق من صحتها للاستخدام في الأنشطة الإنتاجية. تم الاحتفاظ بـ 5,809 من المتغيرات الجينية أحادية النوكليوتيد (SNPs) من مصفوفة iStraw 35K لضمان الاتصال بالمنصات السابقة.
مرتبطة بجينومات مرجعية متعددة: تم تحديد مواقع تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) عن طريق محاذاة التسلسل الجينومي الكامل (WGS) مع الجينوم المرجعي Camarosav1، وتم تحديثها لتتوافق مع الجينوم المرجعي UCD Royal Royce (FaRR1). ممثلة وموثقة عالميًا: تم اكتشاف المتغيرات من خلال إعادة تسلسل WGS لـ 47 فردًا من F. x ananassa، و24 فردًا من F. chiloensis، و22 فردًا من F. virginiana. تم التحقق من صحة متغيرات أداء العلامات الخاصة بالجينوم الفرعي في عينة متنوعة وراثيًا من 384 سلالة من الفراولة ثمانية الصيغة الصبغية.
التطبيقات: أبحاث واستنتاجات علم الوراثة الجزيئية، اكتشاف مواقع الصفات الكمية (QTL) والارتباط على مستوى الجينوم، تحليل القرابة والنسب، التربية الجينومية والجزيئية، التنبؤ والاختيار الجينومي، الاختيار بمساعدة العلامات، إطلاق أصناف جديدة، تسريع وزيادة كفاءة تطوير الأصناف، تحديد وجود علامات مهمة في بلازما جرثومية الفراولة الحالية، استخدام المعلومات الوراثية لتحديد البلازما الجرثومية التي ستؤدي أداءً جيدًا في مناطق زراعية محددة، حماية الملكية الفكرية والتحقق منها، تأكيد المصدر النسيلي والنقاء، التحقق من صحة علاقات الآباء والأبناء. المنتجات المطلوبة: برنامج وحدة تحكم أوامر GeneChip، جهاز GeneTitan متعدد القنوات، برنامج Axiom Analysis Suite، أداة تصدير Axiom Long Format (AxLE). المراجع: Hardigan et al. 2020؛ https://doi.com/10.1016/010 ...
org/10.
3389/fpls.
2019.
01789Edger et al. 2019;https://doi.
org/10.
1038/s41588-019-0356-4هارديجان وآخرون 2022;https://doi.
org/10.
1101/2021.
11.
03.
467115؛ https://phytozome-next.
jgi.
أنثى الأيل.
gov/info/FxananassaRoyalRoyce_v1_0;https://datadryad.
org/stash/dataset/doi:10.
25338/B8TP7G الكمية: طبق واحد
المصفوفة: التنميط الجيني
التنسيق: لوحة مصفوفة صغيرة 96
عدد المصفوفات: 96 مصفوفة
النوع: فراولة
حجم الوحدة: طبق واحد