Thermo Fisher، 551186، مصفوفة تحديد النمط الجيني للروبيان والبلطي متعدد الأنواع Axiom™ (Axiom™ TilShrv1)، بتنسيق mini-96

مصفوفة Axiom™ لتحديد النمط الجيني للروبيان والبلطي متعدد الأنواع (Axiom™ TilShrv1)، بتنسيق mini-96. صُممت مصفوفة Axiom™ لتحديد النمط الجيني للروبيان والبلطي متعدد الأنواع (Axiom TilShrv1) بالتعاون مع جواو كامبوس وخوسيه فرناندو غارسيا من شركة Trigene في البرازيل، بدعم مالي من PIPE-FAPESP. تحتوي المصفوفة على 60,886 علامة SNP من البلطي و6,453 علامة SNP من الروبيان. وهي متوفرة أيضًا بتنسيق 384HT.
محتوى سمك البلطي
• يحتوي على 60886 من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) من سمك البلطي
• اثنا عشر سلالة مختلفة من سمك البلطي النيلي، بدءًا من عينات برية أفريقية وصولًا إلى سلالات GIFT و Chitralada و Stirling المستزرعة، وغيرها من السلالات التي تم الحصول عليها من أصول مختلفة في البرازيل وأمريكا الشمالية، والتي تمثل معظم تنوع سمك البلطي النيلي في العالم.
• تم تحديد ما مجموعه 16 مليون متغير بعد ربط القراءات من 158 عينة بالجينوم المرجعي لسمك البلطي النيلي (GCF001858045).
2 O. niloticus UMD-NMBU)
• بعد عملية الترشيح، تم فحص أكثر من مليوني متغير أحادي النوكليوتيد ثنائي الأليل لإدراجها في المصفوفة
• تم اختيار المتغيرات النوكليوتيدية المفردة عالية التعدد الشكلي التي لا تحتوي على تعدد أشكال مجاورة
• كان متوسط ​​المسافة بين المجموعة النهائية من SNPs هو 14 كيلو قاعدة على مجموعات الارتباط الـ 22 وتردد الأليل العالي، مع وجود عدد قليل فقط من SNPs التي يزيد تردد الأليل الثانوي فيها عن 0.
05- تطبيقات مصفوفة البلطي
• دراسات الارتباط على مستوى الجينوم
• التربية الجزيئية - رسم خرائط الارتباط والاختيار الجينومي
• علم الوراثة السكانية - التمييز بين أصول الأسماك
• التمييز بين سلالات مختلفة من سمك البلطي النيلي ومحتوى الروبيان
• يحتوي على 6453 من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) من الروبيان
• تم اختيار العلامات داخل جينوم L. vannamei من مجموعة بيانات تضم أكثر من 350,000 متغير محتمل (1,2)
• علامات متباعدة بانتظام - تطبيقات لمصفوفة الروبيان
• الانتقاء والتقييم الجينومي لتحديد العائلة ضمن الروبيان الأبيض في المحيط الهادئ (Litopenaeus vannamei) المراجع: 1. Du ZQ, Ciobanu DC, Onteru SK, Gorbach D, Mileham AJ, Jaramillo G, Rothschild MF. A gene-based SNP linkage map for pacific white shrimp, Litopenaeus vannamei. Anim Genet. 2010 Jun;41(3):286-94.
2. جونز دي بي، جيري دي آر، خاتكار إم إس، رادسما إتش دبليو، ستين إتش في، بروشاسكا جيه، فوريت إس، زنجر كيه آر. رابط مقارن متكامل قائم على الجينات وترتيب الموقع عن طريق خريطة اختلال التوازن للروبيان الأبيض في المحيط الهادئ، Litopenaeus vannamei. ممثل العلوم. 2017 4 سبتمبر؛7(1):10360.
المنتجات المطلوبة: برنامج وحدة تحكم GeneChip، جهاز GeneTitan متعدد القنوات، برنامج Axiom Analysis Suite، أداة تصدير البيانات بتنسيق طويل Axiom (AxLE)، الكمية: 96 مصفوفة
شروط الشحن: درجة حرارة الغرفة
المصفوفة: التنميط الجيني
التنسيق: لوحة مصفوفة صغيرة 96
عدد المصفوفات: 96 مصفوفة
الأنواع: أنواع متعددة: الروبيان والبلطي
حجم الوحدة: 96 مصفوفة