CST، 47538S، أوليغومرات متعددة لأنظمة Illumina (بادئات فهرسة مزدوجة) (ChIP-seq، CUT&RUN)

مجموعة أدوات ChIP للدراسة في مجال البحث. تخزين عند الاستلام، يجب إزالة غطاءي الأنبوبين رقم 54631 ورقم 70942 من علبة العدة وحفظهما في درجة حرارة الغرفة. يُحفظ باقي المكونات في درجة حرارة -20 درجة مئوية. يبقى هذا المنتج صالحًا لمدة 12 شهرًا عند تخزينه بشكل صحيح. بروتوكول البروتوكولات المتاحة: تسلسل الحمض النووي للكروماتين بتقنية IP، وتقنية CUT&RUN النوعية / الحساسية تم التحقق من صحة هذه المجموعة بالاشتراك مع مجموعة تحضير مكتبات الحمض النووي لأنظمة Illumina (ChIP-seq، CUT&RUN) رقم 56795 لإنتاج مكتبات حمض نووي مؤهلة باستخدام كميات قليلة تصل إلى 0.5 نانوغرام من حمض ChIP النووي أو 0.1 نانوغرام من حمض CUT&RUN النووي كمواد أولية. تُظهر المكتبات المُحضّرة من كميات أولية مختلفة من الحمض النووي خصائص مماثلة لنظام Agilent Bioanalyzer، ومعدلات رسم خرائط الجينوم، وعدد قمم الارتباط المُحددة، ونسب الإشارة إلى الضوضاء عبر الجينوم بأكمله. التفاعل مع الأنواع: من المتوقع أن يتفاعل مع جميع الأنواع خلفية يُعدّ اختبار الترسيب المناعي للكروماتين (ChIP) تقنيةً فعّالةً ومتعددة الاستخدامات لدراسة تفاعلات البروتين مع الحمض النووي (DNA) ضمن سياق الكروماتين الطبيعي للخلية (1، 2). يُمكن استخدام هذا الاختبار لتحديد العديد من البروتينات المرتبطة بمنطقة مُحددة من الجينوم، أو على العكس، لتحديد العديد من مناطق الجينوم التي يرتبط بها بروتين مُعين (3-6). كما يُمكن استخدامه لتحديد الترتيب المُحدد لاستقطاب البروتينات المختلفة إلى مُحفز الجين، أو لقياس الكمية النسبية لتعديل هيستون مُعين عبر موقع جيني كامل (3، 4). بالإضافة إلى بروتينات الهيستون، يُمكن استخدام اختبار ChIP لتحليل ارتباط عوامل النسخ والعوامل المُساعدة، وعوامل تضاعف الحمض النووي، وبروتينات إصلاح الحمض النووي. عند إجراء اختبار ChIP، تُثبّت الخلايا أو الأنسجة أولاً بالفورمالديهايد، وهو عامل ربط مُتبادل قابل للعكس بين البروتين والحمض النووي، والذي يحافظ على تفاعلات البروتين مع الحمض النووي التي تحدث في الخلية (1، 2). تُحلل الخلايا ويُستخلص الكروماتين ويُجزأ باستخدام الموجات فوق الصوتية أو الهضم الأنزيمي. ثم يُخضع الكروماتين لعملية ترسيب مناعي باستخدام أجسام مضادة نوعية لبروتين معين أو تعديل هيستوني محدد. أي تسلسلات DNA مرتبطة بالبروتين أو التعديل الهيستوني محل الاهتمام ستترسب مع الكروماتين كجزء من المركب الكروماتيني المتشابك، وستزداد الكمية النسبية لهذا التسلسل DNA من خلال عملية الانتقاء المناعي. بعد الترسيب المناعي، تُفك روابط البروتين-DNA المتشابكة ويُنقى الحمض النووي. يمكن استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل القياسي (PCR) أو تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (qPCR) لقياس مقدار زيادة تسلسل DNA معين بواسطة الترسيب المناعي النوعي للبروتين (1، 2). بدلاً من ذلك، يمكن دمج فحص ChIP مع تقنيات المصفوفات الدقيقة لتقسيم الجينوم (ChIP على رقاقة)، ​​أو التسلسل عالي الإنتاجية، أو استراتيجيات الاستنساخ، وكلها تسمح بتحليل شامل للجينوم لتفاعلات البروتين-DNA وتعديلات الهيستون (5-8). أسماء بديلة الباركود؛ ChIP؛ مجموعة ChIP؛ ChIP-seq؛ تسلسل ChIP؛ ترسيب الكروماتين المناعي؛ ترسيب الكروماتين المناعي؛ CnR؛ CUT & RUN؛ CUT & Tag؛ cut and run؛ CUT and RUN؛ CUT&RUN؛ cutandrun؛ مكتبة الحمض النووي؛ بناء مكتبة الحمض النووي؛ تحضير مكتبة الحمض النووي؛ تسلسل الجيل التالي؛ تسلسل NG؛ Oligo؛ Oligos؛ التسلسل؛ بادئ التسلسل