مجموعة CST، 93872S، PTMScan® مالونيل-لايسين [Mal-K]

برنامج PTMScan للدراسة في مجال البحث. معلومات استخدام المنتج تُحلل الخلايا في محلول منظم يحتوي على اليوريا، وتُهضم البروتينات الخلوية بواسطة إنزيمات البروتياز، ثم تُنقى الببتيدات الناتجة باستخدام استخلاص الطور الصلب ذي الطور المعكوس. بعد ذلك، تُخضع الببتيدات لتنقية المناعة باستخدام جسم مضاد PTMScan® Motif مرتبط بخرزات بروتين A أجاروز. تُزال الببتيدات غير المرتبطة بالغسل، وتُستخلص الببتيدات الحاملة لتعديلات ما بعد الترجمة (PTM) باستخدام حمض مخفف. تُجرى عملية تنقية الطور المعكوس على رؤوس دقيقة لإزالة الأملاح وفصل الببتيدات عن الجسم المضاد قبل تركيز الببتيدات المُثرية لتحليلها بتقنية LC-MS/MS. توصي شركة CST باستخدام محلول PTMScan® IAP رقم 9993 المرفق مع المجموعة. تخزين تُزوَّد حبيبات الأجسام المضادة في محلول منظم IAP يحتوي على 50% جلسرين. يُحفظ في درجة حرارة -20 درجة مئوية. لا تُقسِّم الأجسام المضادة إلى أجزاء. بروتوكول البروتوكولات المتاحة: PTMScan خلفية يخضع الليسين لمجموعة واسعة من التعديلات التنظيمية اللاحقة للترجمة نظرًا لسلسلة الأمينو الجانبية الموجبة الشحنة. ومن أبرز هذه التعديلات اليوبيكويتين والأسيتلة، وهما عمليتان محفوظتان بدرجة عالية بين بدائيات النوى وحقيقيات النوى (1، 2). يعمل نقل مجموعة الأسيل من وسائط الأيض، مثل أسيتيل-CoA، وسكسينيل-CoA، ومالونيل-CoA، وغلوتاريل-CoA، وبيوتيريل-CoA، وبروبيونيل-CoA، على معادلة الشحنة الموجبة لليسين وإحداث تغييرات بنيوية تؤثر على وظيفة البروتين الركيزة. يتم تحفيز أسيتلة الليسين بواسطة إنزيمات أسيتيل ترانسفيراز الهيستون (HATs)، باستخدام أسيتيل-CoA كعامل مساعد (3، 4). أما إزالة الأسيل فتتم بوساطة إنزيمات دي أسيتيل الهيستون (HDACs 1-11) وسيرتوينات 1-7 المعتمدة على NAD. بعض السيرتوينات ذات نشاط نازع للأسيتيل ضئيل أو معدوم، مما يشير إلى أنها أكثر ملاءمة لركائز أسيل ليسين الأخرى (5). يُعدّ سيرتوين 5 (Sirt 5) نازعًا للسكسينيل والمالونيل بشكل أساسي في الميتوكوندريا (5، 6). في غياب ناقل مالونيل معروف، يُرجّح أن يكون مالونيل البروتين غير الإنزيمي مدفوعًا بتركيز مالونيل-CoA ودرجة الحموضة داخل الخلايا، ويخضع للتقلبات الأيضية (7). ينتشر المالونيل بشكل خاص بين بروتينات الأيض الميتوكوندرية. في نماذج الفئران المصابة بداء السكري من النوع الثاني، يمكن الكشف عن ارتفاع ملحوظ في المالونيل بشكل رئيسي، ولكن ليس حصريًا، على بروتينات استقلاب الجلوكوز والأحماض الدهنية (8). يشير مالونيل الهيستون H3K56 في الخميرة إلى ضعف كفاءة ارتباط الحمض النووي، وقد يؤدي إلى انخفاض حيوية الخلايا (9). أسماء بديلة ليسين؛ مالونيل؛ مالونيليشن؛ موتيف