ميرك، 17-371، إيزي-شيب

يُعدّ ترسيب الكروماتين المناعي (ChIP) تقنيةً مهمةً تُمكّن الباحث من تحليل التفاعلات الحيوية للبروتينات مع الحمض النووي الجينومي. يُمكن تحليل أي بروتين مرتبط بالكروماتين أو بروتين رابط للحمض النووي باستخدام هذه التقنية، شريطة توفر جسم مضاد مناسب لهذا البروتين. يُمكن قياس بروتينات مختلفة مُتمركزة في منطقة مُحددة من الجينوم، أو التوزيع الجينومي لبروتين مُحدد. من التطبيقات الفعّالة الأخرى لهذه التقنية تحليل التغيرات في تعديلات الهيستون المرتبطة بعمليات مثل النسخ، والانقسام الخلوي، وإصلاح الحمض النووي. يُعدّ ترسيب الكروماتين المناعي (ChIP) تقنيةً قويةً لرسم خريطة التوزيع الحيوي للبروتينات المرتبطة بالحمض النووي الصبغي. قد تكون هذه البروتينات وحدات فرعية من الهيستون وتعديلات ما بعد الترجمة أو بروتينات أخرى مرتبطة بالكروماتين مثل عوامل النسخ، ومنظمات الكروماتين، وغيرها. بالإضافة إلى ذلك، يُمكن استخدام ChIP لتحديد مناطق الجينوم المرتبطة بهذه البروتينات، أو على العكس، لتحديد البروتينات المرتبطة بمنطقة مُحددة من الجينوم. تتضمن تقنية ChIP عادةً ربط البروتينات بالحمض النووي (DNA) وربط البروتينات ببعضها، وتفتيت الكروماتين المرتبط، ثم ترسيب الكروماتين باستخدام جسم مضاد نوعي لبروتين مستهدف. يمكن تحديد شظايا الحمض النووي المعزولة والمرتبطة بالبروتين المستهدف باستخدام طرق متنوعة، منها تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، ومصفوفات الحمض النووي الدقيقة، وتسلسل الحمض النووي. يمكن إجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل القياسي أو الكمي للتحقق من ارتباط تسلسل معين من الحمض النووي (الجين أو منطقة من الجينوم) بالبروتين محل الاهتمام. يتيح الجمع بين تقنية ChIP ومصفوفات الحمض النووي الدقيقة للمحفزات أو مصفوفات التجانب الجينومي (ChIP-chip) تحديد مواقع ارتباط الحمض النووي للبروتينات المرتبطة بالكروماتين على مستوى الجينوم بدقة عالية. بدلاً من ذلك، يُعد التسلسل عالي الإنتاجية للمكتبات المُنشأة من الحمض النووي الصبغي المُرسب مناعيًا (ChIP-Seq) بديلاً فعالاً لتقنية ChIP-chip في رسم خرائط تفاعلات البروتين مع الحمض النووي عبر جينومات الثدييات.