Qiagen، 180497، مجموعة QIAseq Ultralow Input Lib UDI-A (96)

لـ 96 تفاعلًا مع أنظمة Illumina؛ محاليل منظمة وكواشف لتلميع النهايات عند مدخلات منخفضة للغاية، وربط عند مدخلات منخفضة للغاية، وتضخيم مكتبة HiFi؛ تتضمن لوحة تحتوي على 96 محول Y فريدًا مزدوج الفهرسة

سمات

- تعمل التركيبات الكيميائية فائقة الكفاءة على زيادة أداء العينات التي يقل حجمها عن النانوغرام
- يوفر البروتوكول المرن حلاً شاملاً لكمية الحمض النووي المدخلة من 10 بيكوغرام إلى 100 نانوغرام
- متوافق مع مجموعة واسعة من أنواع العينات، بما في ذلك الحمض النووي الخالي من الخلايا، والعينات المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين، والحمض النووي القديم، وتقنية ChIP-seq
- محولات فهرسة مزدوجة فريدة متاحة لدمج ما يصل إلى 384 عينة

تفاصيل المنتج

تتضمن مجموعة QIAseq Ultralow Input Library Kit تقنيات جديدة فائقة الكفاءة لإصلاح نهايات الحمض النووي وربطها، ضمن حل متكامل ومبسط. تتيح هذه المجموعات إنشاء مكتبات عالية الجودة من عينات الحمض النووي المحدودة والتالفة، باستخدام سير عمل فعال يستغرق ساعتين ونصف فقط، بدءًا من 10 بيكوغرام إلى 100 نانوغرام من الحمض النووي المجزأ، لتحضير مكتبة قوية مناسبة لمجموعة واسعة من التطبيقات البحثية.

هل ترغب بتجربة هذا الحل لأول مرة؟ اطلب عرض سعر لمجموعة تجريبية.

أداء

أقصى إنتاجية بأقل مدخلات

عالج عينات الحمض النووي بثقة تامة، بدءًا من 10 بيكوغرام وحتى 100 نانوغرام. تعمل التركيبات الكيميائية الجديدة عالية الكفاءة في مجموعات QIAseq Ultralow Input على التخلص من مشكلة انخفاض الأداء عند استخدام أقل من 1 نانوغرام من الحمض النووي. تعمل الإنزيمات والتركيبات المنظمة المبتكرة على زيادة أداء العينات التي تقل عن نانوغرام إلى أقصى حد، مع توفير مرونة في معالجة عينات تصل إلى 100 نانوغرام من الحمض النووي.

معدلات تحويل عالية الكفاءة ومتسقة

تُتيح مجموعات QIAseq Ultralow Input Library Kits معدلات تحويل فائقة للمكتبات (>30%) من عينات تحتوي على أقل من 1 نانوغرام من المدخلات، وذلك باستخدام تركيبات كيميائية مُحسّنة حديثًا. تغطي معدلات التحويل المتسقة هذه للمعلومات الجينومية إلى جزيئات المكتبة المرتبطة بالمحولات نطاقًا واسعًا يصل إلى 1000 ضعف - من 10 بيكوغرام إلى 10 نانوغرام من مدخلات الحمض النووي - مما يُرسي معيارًا رائدًا في هذا المجال. كما تُقلل النسبة المنخفضة لثنائيات المحولات من تلوث المكتبة مقارنةً بالمنتجات المنافسة.

حل قوي للعينات الصعبة

تُعد تقنية QIAseq Ultralow Input مثالية لـ: تسلسل الجينوم الكامل ذي المدخلات المنخفضة؛ cfDNA لتطبيقات الخزعة السائلة؛ ومصادر الحمض النووي المحدودة من أنسجة FFPE، والتشريح المجهري لالتقاط الليزر (LCM) وسحب الإبرة الدقيقة (FNA).

مبدأ

يُعدّ تسلسل الجيل التالي (NGS) قوة دافعة للعديد من التطبيقات الجديدة والمثيرة، بما في ذلك أبحاث السرطان، وأبحاث الخلايا الجذعية، وعلم الجينوم البيئي، وعلم الوراثة السكانية، والأبحاث الطبية. ورغم التطور المستمر لتقنية NGS، لا يزال تحضير المكتبات يمثل عائقًا رئيسيًا أمام العديد من المختبرات، وعاملًا مُحددًا لأنواع العينات التي يمكن أن تُنتج بيانات NGS بنجاح.

ونتيجةً لذلك، يُعدّ استخلاص أكبر قدر ممكن من المعلومات الجينومية في مكتبة تسلسل الجيل التالي (NGS) أمرًا بالغ الأهمية، ولكنه في الوقت نفسه يُمثّل تحديًا كبيرًا، خاصةً عند البدء بعينات الحمض النووي المحدودة أو التالفة. ويمكن أن تُؤدي طرق تحضير المكتبات القياسية، المُطبقة على أنواع عديدة من العينات - مثل الحمض النووي الخالي من الخلايا، والحمض النووي المُثبّت بالفورمالين والمُضمّن في البارافين (FFPE)، والحمض النووي القديم، والحمض النووي المُستخلص بتقنية ChIP-seq - إلى مشاكل تتعلق بجودة البيانات. وتُحدّ هذه المشاكل من فائدة البيانات المُولّدة، بدءًا من انخفاض إنتاجية المكتبة أو معدلات التحويل، وصولًا إلى ارتفاع نسبة القراءات المُستمدة من جزيئات ثنائيات المحوّل.

إجراء

بناء المكتبة

تبدأ مجموعات QIAseq Ultralow Input Library Kits بحمض نووي مزدوج السلسلة تم تجزئته إنزيميًا أو كيميائيًا أو ميكانيكيًا أو طبيعيًا. تستخدم هذه المجموعات تفاعلًا مُحسَّنًا لتلميع الأطراف وتركيبة ربط جديدة فائقة الصغر، بالإضافة إلى مزيج HiFi PCR Master Mix الخاص بشركة QIAGEN. يُعظِّم هذا المزيج معدل تحويل عينة الحمض النووي إلى مكتبة NGS، مع تضخيم فعال ومتساوٍ حتى للمناطق ذات المحتوى العالي والمنخفض من GC في الجينوم. يُمكِّن هذا البروتوكول من الحصول على مكتبة تسلسل بأعلى إنتاجية ممكنة، خالية من تلوث ثنائيات المحولات - بدءًا من 10-100 بيكوغرام* فقط من مدخلات الحمض النووي. بفضل بروتوكول المجموعة المرن، يمكن استخدام المجموعة نفسها لكميات أكبر من مدخلات الحمض النووي، بما في ذلك تحضيرات المكتبات الخالية من تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) بدءًا من 10 بيكوغرام* فقط من مدخلات الحمض النووي. *لاحظ أن التعقيد الجينومي اللازم لتجربة معينة سيختلف باختلاف حجم جينوم الكائن الحي ونسبة هذا الجينوم المُضمنة في المنطقة المستهدفة.

تنظيف التفاعل

بعد خطوات ربط المحولات وتضخيم المكتبة، يمكن تنظيف التفاعل وإزالة ثنائيات المحولات المتبقية باستخدام خرز Agencourt AMPure XP، مما يتيح التشغيل الآلي السهل على منصات التشغيل الآلي عالية الإنتاجية المختلفة.

تضخيم اختياري للحمض النووي للمكتبة

عادةً ما يكون تضخيم مكتبة الحمض النووي باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ضروريًا إذا كانت كمية الحمض النووي المدخلة أقل من 100 نانوغرام. هذا البروتوكول اختياري، ويتيح تضخيمًا عالي الدقة لمكتبة الحمض النووي باستخدام مزيج QIAseq HiFi PCR Master Mix المرفق مع المجموعة.

المحتويات والملحقات

تتضمن مجموعة QIAseq Ultralow Input Library Kit، التي تتسع لـ 96 تفاعلًا، محولات ثنائية الترميز بتنسيق اللوحة. تحتوي كل بئر في لوحة المحولات ذات 96 تفاعلًا على محول للاستخدام لمرة واحدة، يتألف من مزيج فريد من رمزين شريطيين للتعريف، كل منهما مكون من ثمانية نيوكليوتيدات. وبفضل دمج رمز شريطي i5 ورمز شريطي i7 في كل محول جاهز للاستخدام، تدعم مجموعات QIAseq Ultralow Input Kit، التي تتسع لـ 96 تفاعلًا، تجميع ما يصل إلى 96 مكتبة قبل التسلسل.

على الرغم من أن المحولات غير مدرجة في مجموعة حجم التفاعل 12، إلا أنه يمكن طلب مجموعة محولات QIAseq UDI Y (24)، رقم الكتالوج 180310، والتي تحتوي على محولات Y ذات فهرس عينة مزدوج فريد برمز شريطي (تنسيق لوحة لـ 24 عينة) بشكل منفصل.

التطبيقات

صُممت مجموعات QIAGEN QIAseq Ultralow Input Library Kits لتكون الحل الأمثل لإنتاج مكتبات عالية الجودة حتى من عينات NGS بالغة الصعوبة. وهي مُخصصة لباحثي NGS الذين يبحثون عن مجموعة واحدة لتحضير المكتبات متوافقة مع نطاق واسع من عينات الحمض النووي المجزأ ذات المدخلات المنخفضة للغاية، والمنخفضة، والقياسية. تُمكّن مجموعات QIAseq Ultralow Input Library Kits من الحصول على رؤى جديدة من خلال تعظيم الأداء، لا سيما مع أنواع عينات الحمض النووي المحدودة والتالفة. كما يُتيح البروتوكول المُبسط، الذي يستغرق ساعتين ونصف فقط، لإنتاج المكتبات من الحمض النووي المجزأ باستخدام مجموعات QIAseq Ultralow Input Library Kits، إمكانية التشغيل الآلي بسهولة على منصات معالجة السوائل المختلفة.