Qiagen، 250284، مجموعة dPCR PanCancer BRAF V600 FAM (200)

200 تفاعل × 40 ميكرولتر: تتضمن 20 اختبار BRAF V600 FAM، و20 اختبار AP3B1 HEX المرجعي، وماء، و4 خلطات QIAcuity Master Mix لفحص 8 طفرات BRAF V600 باستخدام جهاز QIAcuity

سمات

- الكشف المتوازي عن الطفرات المميزة بترددات منخفضة تصل إلى 0.1%
- يحدد الفحص المرجعي عدد نسخ الجينوم ويتحقق من كفاءة تفاعل البوليميراز الرقمي (dPCR).
- تم الكشف عن الجين المرجعي والطفرات المميزة في عملية واحدة باستخدام صبغتين مختلفتين
- بروتوكول تفاعل البوليميراز الرقمي البسيط والسريع على جهاز QIAcuity
- متوافق مع مجموعات وأجهزة تحضير العينات من QIAGEN

تفاصيل المنتج

صُممت مجموعات dPCR PanCancer للكشف عن جينات مستهدفة متعددة ذات صلة بالسرطان. وباستخدام اختبار واحد، يمكن لهذه المجموعات الكشف عن طفرات أو حذف متعددة في الجين المستهدف. على سبيل المثال، يمكن لمجموعة dPCR PanCancer Kit BRAF V600 FAM الكشف عن ثماني طفرات رئيسية في جين BRAF V600، بينما يمكن لمجموعة dPCR PanCancer Kit EGFRex19del FAM الكشف عن 23 حذفًا في الإكسون 19 من جين EGFR.

تتكون كل مجموعة dPCR PanCancer من علبتين: إحداهما تحتوي على اختبار PanCancer المحدد مع بادئات جينية محددة موسومة بـ FAM وجين مرجعي موسوم بـ HEX للتحقق من كفاءة تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، والأخرى تحتوي على مزيج QIAcuity الرئيسي (انظر الشكل "مفهوم مجموعة dPCR PanCancer"). تأتي البادئات والمجسات ممزوجة مسبقًا بالتركيزات الصحيحة.

تم تحسين هذا التحليل خصيصًا للوحة QIAcuity Nanoplate 26k ذات 24 بئرًا، ولكن يمكن استخدامه أيضًا مع أنواع أخرى من اللوحات النانوية. يتيح نظام dPCR سهل الاستخدام على جهاز QIAcuity فحصًا سريعًا ودقيقًا وفعالًا من حيث التكلفة لعيناتك.

أداء

حساسية عالية في الكشف عن الطفرات

طُوِّرت مجموعات dPCR PanCancer لتلبية الحاجة إلى فحص دقيق وسريع لعينات السرطان في مشاريعكم البحثية. تستطيع هذه الاختبارات الكشف عن طفرات متعددة بالتوازي، وصولاً إلى تردد طفرات بنسبة 0.1%، في أنواع مختلفة من العينات المستخدمة في أبحاث السرطان.

الكشف المتوازي عن طفرات مميزة متعددة وجين مرجعي

تتيح لوحة QIAcuity Nanoplate 26k ذات 24 بئراً تحليل 24 عينة بالتوازي. يكشف كل اختبار عن عدة طفرات ذات صلة بالسرطان بالتوازي ضمن جين مستهدف محدد في قناة واحدة. ولأن الاختبار المرجعي لـ AP3B1 يأتي بصبغة مختلفة عن صبغة اختبار الطفرات، يمكن قراءة النتائج باستخدام قناتين مختلفتين على لوحة QIAcuity ولكن في بئر التفاعل نفسه، مما يوفر عينات ثمينة ويسمح بتحليل المزيد من العينات على لوحة واحدة (انظر الشكلين "الكشف الدقيق عن طفرات BRAF V600E في معيار الحمض النووي المرجعي باستخدام مجموعة dPCR PanCancer Kit BRAF V600 FAM" و"الكشف الدقيق عن حذف الإكسون 19 من EGFR في معيار الحمض النووي المرجعي باستخدام مجموعة dPCR PanCancer Kit EGFRex19del FAM").

متوافق مع أنواع متعددة من العينات وطرق تحضير العينات

تتوافق مجموعات dPCR PanCancer مع أجهزة جمع العينات ومجموعات التحضير والأجهزة من QIAGEN، مما يتيح لك تلبية احتياجات متنوعة من حيث الإنتاجية وقابلية التكرار والحساسية. سواءً قمت بعزل الحمض النووي يدويًا باستخدام مجموعة QIAGEN، مثل مجموعة QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit للحمض النووي الخالي من الخلايا (cfDNA)، أو مجموعات QIAamp DNA Blood Kit للحمض النووي من الدم، أو مجموعة QIAamp DNA FFPE Advanced Kit للحمض النووي من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE)، أو قمت بعزل الحمض النووي آليًا باستخدام EZ2 Connect أو QIAsymphony SP، فإن مجموعات dPCR PanCancer تعمل مع جميعها.

مبدأ

تكشف مجموعات dPCR PanCancer - BRAF V600 FAM و EGFRex19del FAM - عن طفرات مميزة متعددة في جين BRAF المشفر لبروتين كيناز سيرين/ثريونين B-Raf وجين EGFR المشفر لمستقبل عامل نمو البشرة، على التوالي.

صُممت هذه الاختبارات للاستخدام مع مزيج QIAcuity الرئيسي ونظام QIAcuity الرقمي لتفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR). يتضمن كل اختبار تضخيمًا نهائيًا لتفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) يستهدف مناطق جينية محددة من جين السرطان ذي الصلة. يتم الكشف عن الناتج المُضخّم باستخدام مجسات تحلل فلورية خاصة بالهدف، مما يعزز خصوصية الاختبار.

فيما يلي نظرة عامة مفصلة على الطفرات المشمولة مع مُعرّفات قاعدة بيانات COSMIC v99 الفريدة. بالإضافة إلى ذلك، تتضمن كل مجموعة dPCR PanCancer اختبارًا مرجعيًا يُحدد كمية جين AP3B1 البشري أحادي النسخة، مما يوفر معيارًا لتحديد عدد نسخ الجينوم في العينة. على الرغم من أن الإعداد الموصى به يتضمن لوحة QIAcuity Nanoplate 26k ذات 24 بئرًا، إلا أن هذه الاختبارات متوافقة أيضًا مع أنواع أخرى من لوحات QIAcuity Nanoplate، مما يوفر مرونة في التكوينات التجريبية. يمكنك أيضًا تنزيل جدول يتضمن ملخصًا لقوالب التحكم الإيجابي لاختبارات BRAF وEGFR PanCancer (انظر قسم الموارد).

تعرف على المبدأ الكامن وراء تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل الرقمي القائمة على الألواح النانوية QIAcuity هنا.

إجراء

بروتوكول مجموعة dPCR PanCancer بسيط ويمكن تنفيذه في أي مختبر باستخدام جهاز QIAcuity dPCR. باتباع التعليمات الواردة في دليل المستخدم وبروتوكول البدء السريع، يقوم المستخدم بتحضير مزيج التفاعل ونقله باستخدام الماصة إلى الصفيحة النانوية. نوصي باستخدام الصفيحة النانوية 26k وتحديث البرنامج باستمرار. يُضاف الحمض النووي المعزول إلى مزيج QIAcuity Probe Master Mix الجاهز للاستخدام وماء خالٍ من النيوكلياز. يُوزع هذا المزيج في كل بئر من آبار صفيحة dPCR التحضيرية، والتي تحتوي على مجموعات مُوزعة مسبقًا من البادئات ومجسات التحلل. تُنقل مخاليط التفاعل من الصفيحة التحضيرية إلى آبار صفيحة dPCR النانوية، والتي تُغلق بإحكام ثم تُنقل إلى جهاز QIAcuity dPCR (انظر الشكل "سير عمل بسيط وسريع قائم على الصفيحة"). تتم خطوات التقسيم والتدوير والتصوير تلقائيًا بالكامل بواسطة جهاز QIAcuity dPCR وفقًا للمعايير المُحددة مسبقًا. اعتمادًا على بروتوكول التدوير، يمكن تحليل نتائج تشغيل dPCR باستخدام مجموعة برامج QIAcuity في غضون ساعتين تقريبًا.

التطبيقات

تُعدّ مجموعات dPCR PanCancer مناسبةً للغاية للكشف عن الطفرات أو الحذف في الحمض النووي المستخلص من الدم أو البلازما أو الأنسجة الطازجة أو الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE)، كما يُمكن استخدامها مع أنواع أخرى من العينات. تتوافق هذه الاختبارات مع نظام QIAGEN وقد تم التحقق من صحتها من خلال اختبارات معملية (انظر الشكل "الكشف عن طفرات BRAF V600 (أ) وحذف الإكسون 19 من جين EGFR (ب) في الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfDNA) المستخلص من بلازما الدم باستخدام مجموعة dPCR PanCancer على منصة QIAcuity"). يُظهر الشكل نتائج استخلاص الحمض النووي يدويًا وآليًا، بالإضافة إلى تحليل dPCR اللاحق. كما يُوضح الشكل توافق البيانات مع الحمض النووي المستخلص باستخدام طرق تحضير العينات المختلفة من QIAGEN.