Product Description
مجموعة تحتوي على كواشف لتخليق السلسلة الأولى، والوسم الجزيئي، والتضخيم الخاص بالجين، وإعداد المكتبة لتسلسل الحمض النووي الريبوزي المستهدف؛ لوحة مخصصة لـ 96 عينة
سمات
- اختر من بين لوحات شاملة أو حدد ما يصل إلى 1000 جين وقم بإنشاء لوحة مخصصة
- تضمن المؤشرات الجزيئية الفريدة (UMIs) تحديدًا دقيقًا لتعبير الجينات
- مناسب كبديل لتقنية qPCR للتعبير الجيني باستخدام كمية قليلة تصل إلى 25 نانوغرام من الحمض النووي الريبي الكلي
- يتضمن الوصول إلى بوابة تحليل بيانات GeneGlobe لمحاذاة القراءات، وتطبيع البيانات، وتحليل التعبير الجيني
- متوفر لأجهزة Illumina NGS
تفاصيل المنتج
طُوِّرت لوحات QIAseq Targeted RNA كحلٍّ شاملٍ لتحليل التعبير الجيني الكمي باستخدام تقنية تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). تدمج هذه اللوحات مؤشرات جزيئية فريدة (UMIs) وتحضير مكتبة ثنائي المراحل قائم على تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) لتقديم قياس كمي دقيق وغير متحيز من عينات بشرية وفئران وجرذان.
تُستخدم مؤشرات QIAseq Targeted RNA لفهرسة العينات لتسلسل الحمض النووي الريبي المستهدف والبادئات اللازمة لتسلسل مكتبات الحمض النووي الريبي التي تم إنشاؤها بواسطة لوحات QIAseq Targeted RNA.
أداء
- الدقة: تعمل المؤشرات الجزيئية الفريدة المبتكرة (UMIs) على التخلص من تكرار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) وتحيز التضخيم لتقديم أدق النتائج (انظر الشكل "القياس الكمي للجينات غير المتحيز والدقيق").
- الخصوصية: يضمن الجمع الفريد بين خوارزمية تصميم البادئات الخاصة بنا والاختبار الصارم لكل فحص بادئ خصوصية عالية ونتائج دقيقة (انظر الشكل "تصميم البادئات الخاص يوفر مضخمات خاصة بالجين - خصوصية 97٪").
- التوحيد: تم تحسين سير عمل لوحة QIAseq Targeted RNA Panel لتقديم نتائج تسلسل عالية التوحيد، لضمان استخدام سعة التسلسل بكفاءة عالية. في الواقع، تعمل المؤشرات الجزيئية الفريدة (UMIs) على إزالة تحيز تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) تمامًا في عد تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) (انظر الشكل "توحيد لا مثيل له - 97% من التحليلات تقع ضمن نطاق 20% من متوسط عدد العلامات الجزيئية").
- قابلية التكرار: يُظهر نظام QIAseq Targeted RNA Panel ارتباطات قوية عبر النسخ التقنية، ومجموعات المنتجات، والأجهزة بمعاملات ارتباط متوسطة تزيد عن 0.99، لضمان الكشف الموثوق عن الاختلافات في التعبير بين العينات البيولوجية.
- الحساسية: تم تحسين تسلسل الحمض النووي الريبوزي المستهدف باستخدام المؤشرات الجزيئية الفريدة (UMIs) لتقديم قياس كمي عالي الدقة يصل إلى حوالي 100 نسخة من الحمض النووي الريبوزي المستهدف في 25 نانوغرام من الحمض النووي الريبوزي الكلي (انظر الشكل "نتائج إيجابية مع 0.2 نسخة فقط من الحمض النووي الريبوزي لكل خلية"). تسمح البروتوكولات ذات المدخلات المنخفضة للباحثين بالبدء بكميات أقل من الحمض النووي الريبوزي في أحجام أصغر.
- المرونة: تجمع لوحات QIAseq Targeted RNA بين قوة NGS ودقة qPCR للسماح بتعدد إرسال العديد من العينات لكل NGS مع تقديم نتائج فعالة من حيث التكلفة (انظر الشكل "إجراء بسيط").
مبدأ
تعاني طرق تسلسل الحمض النووي الريبوزي التقليدية من تكرار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) وتحيز التضخيم، مما يؤدي إلى تحليل غير دقيق للتعبير الجيني. من خلال إدخال المؤشرات الجزيئية الفريدة (UMIs) قبل أي عملية تضخيم، تستطيع لوحات QIAseq Targeted RNA التغلب على هذه المشكلة لتقديم قياس كمي رقمي دقيق للجينات (انظر الشكل "قياس كمي دقيق وغير متحيز للجينات").
تتميز لوحات QIAseq Targeted RNA بمجموعة فريدة من فحوصات التحكم المدمجة. تتحكم فحوصات الحمض النووي الجينومي (gDNA) في أي تلوث بالحمض النووي الجينومي في عينة الحمض النووي الريبوزي (RNA) لضمان نتائج قابلة للتكرار. تُستخدم فحوصات جينات التدبير المنزلي (HKG) لتطبيع البيانات، مما يُتيح إجراء مقارنات بين العينات وبين عمليات التشغيل.
إجراء
تبدأ عملية QIAseq Targeted RNA Panel بتحويل الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) إلى الحمض النووي التكميلي (cDNA) (انظر الشكل "إجراء بسيط"). تتطلب هذه العملية كمية ضئيلة من الحمض النووي الريبوزي: عادةً ما يُستخدم 25 نانوغرام من الحمض النووي الريبوزي الكلي. لا حاجة لخطوات إثراء أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA). تستخدم خطوة الفهرسة الجزيئية بادئًا خاصًا بالجين (GSP1) يحتوي على مُعرّف فريد (UMI) مكون من 12 قاعدة في لوحة بادئات متعددة (تستهدف من 12 إلى 1000 جين). بعد خطوة الفهرسة الجزيئية، يُنقى الحمض النووي التكميلي الموسوم بشكل فريد باستخدام الخرز لإزالة البادئات المتبقية، ثم يُجرى تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) باستخدام مجموعة ثانية من بادئات المحولات الخاصة بالجين (GSP2) وبادئ RS2، الذي يبدأ من علامة مشتركة على بادئات GSP1. يضمن هذا التفاعل إثراء الأهداف المقصودة بشكل كافٍ لتمثيلها في المكتبة النهائية. يُحافظ على عدد الدورات عند الحد الأدنى لتقليل التباينات الناتجة عن تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) في التضخيم (حيث يمكن تصحيح أي تباينات بسهولة باستخدام الرموز الشريطية الجزيئية). ثم تُجرى عملية تنظيف سريعة أخرى باستخدام الخرز، ويُجرى تفاعل PCR شامل باستخدام بادئات RS2 وFS2، مما يُضيف أيضًا رموزًا شريطية لفهرسة العينات إلى كل عينة. تُجرى عملية تنظيف نهائية باستخدام الخرز، وبذلك تكتمل المكتبة وتصبح جاهزة للقياس الكمي والتسلسل.
يُتيح شراء لوحات QIAseq المستهدفة للحمض النووي الريبوزي الوصول إلى أدوات تحليل البيانات في بوابة GeneGlobe التابعة لشركة QIAGEN. وتشمل هذه الأدوات محاذاة القراءات وتطبيع البيانات، والتعبير الجيني التفاضلي بدون أي تكاليف إضافية.
التطبيقات
- تحليل التعبير الجيني
- أبحاث المؤشرات الحيوية
- تأكيد بيانات تسلسل النسخ الكامل
- تأكيد بيانات المصفوفة الدقيقة
Order Guidelines
1. Price & Stock Available on Request. Click to send email to: service@iright.com
2. Please DO NOT make payment before confirmation.
3. Minimum order value of $1,000 USD required.
Collaboration
Tony Tang
Email: Tony.Tang@iright.com
Mobile/WhatsApp/Wechat: +86-17717886924