Qiagen، 333075، QIAseq UPX 3' Trans. 48-Index (192)

لفهرسة ما يصل إلى 48 عينة لكل مسار تسلسل على أجهزة Illumina NGS؛ يمكن دمج عدة لوحات 96 أو 384 بئراً كعينة واحدة، مما يسمح بـ 48 لوحة 96 بئراً (4608 خلية/بئر) أو 48 لوحة 384 بئراً (18432 خلية/بئر) لكل مسار

سمات

- ابدأ بـ 10 بيكوغرام إلى 10 نانوغرام من الحمض النووي الريبي الكلي المعزول، ومستخلصات الخلايا
- يسمح وضع علامات UPX بمعالجة 4608-18432 عينة لكل مسار تسلسل واحد
- تعمل المؤشرات الجزيئية الفريدة (UMIs) على التخلص من تحيز تضخيم المكتبة من أجل التعبير الجيني الدقيق
- كيمياء محسّنة بتقنية LNA لزيادة الدقة والنوعية والحساسية
- يتضمن الوصول إلى بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) لعينات الإنسان والفأر والجرذ

تفاصيل المنتج

تُمكّن مجموعات QIAseq UPX 3' Transcriptome من إجراء تحليل عالي الإنتاجية للتعبير الجيني من مستخلصات الخلايا والحمض النووي الريبوزي الكلي المعزول. تكفي كل مجموعة لإنشاء مكتبات من 96 أو 384 بئرًا، وتأتي بتنسيقات مختلفة، إما على شكل صفائح متعددة الفواصل ذات 96 بئرًا أو صفائح أحادية الاستخدام ذات 384 بئرًا، مع وجود بادئات النسخ العكسي المجففة بالتجميد في قاع الصفائح لسهولة الاستخدام. لإنشاء مكتبات لتسلسل الحمض النووي الريبوزي، ما عليك سوى إضافة الخلايا أو ما يصل إلى 10 نانوغرام من الحمض النووي الريبوزي الكلي لإعادة تكوين تفاعل النسخ العكسي. بعد تخليق الحمض النووي التكميلي، اجمع محتويات كل صفيحة في أنبوب واحد لإكمال تحضير المكتبة. جميع الكواشف اللازمة للبدء بالخلايا (مثل كواشف التحلل) أو الحمض النووي الريبوزي موجودة في المجموعة.

قم بتحليل بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي 3' بسهولة باستخدام بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي المتكاملة مع GeneGlobe - وهو حل تحليل بيانات بديهي قائم على الويب تم إنشاؤه لعلماء الأحياء ومضمن في مجموعات QIAseq UPX 3' Transcriptome.

هل ترغب بتجربة هذا الحل لأول مرة؟ اطلب عرض سعر لمجموعة تجريبية.

مبدأ

تُمكّن مجموعات QIAseq UPX 3' Transcriptome من الحصول على نتائج دقيقة من خلال تقنية التسلسل عالي الإنتاجية (NGS) للحمض النووي الريبوزي متعدد الأدينين (polyadenylated RNA) من مستخلصات الخلايا أو الحمض النووي الريبوزي المعزول باستخدام أجهزة Illumina NGS. صُممت هذه المجموعات لبناء المكتبات وتحليل كريات الخلايا (حتى 100 خلية) أو الحمض النووي الريبوزي النقي (من 10 بيكوغرام إلى 10 نانوغرام). تتميز مجموعات QIAseq UPX 3' Transcriptome بميزة مبتكرة، حيث يتم وسم كل خلية بمعرف فريد (حتى 384 معرفًا مختلفًا) أثناء عملية النسخ العكسي، كما يتم وسم كل جزيء من الحمض النووي الريبوزي بمؤشر جزيئي فريد (UMI). بعد النسخ العكسي مع تبديل القالب المتكامل، يمكن دمج جميع الحمض النووي التكميلي (cDNA) الموسوم بشكل فردي، مما يسمح بإجراء جميع خطوات بناء المكتبة اللاحقة في أنبوب واحد. هذا يمنع اختلاط العينات، ويوفر وقتًا كبيرًا، ويقلل بشكل ملحوظ من تكاليف تحضير المكتبة. خلال عمليات التضخيم وبناء المكتبة اللاحقة، يمكن تعيين ما يصل إلى 48 معرفًا مختلفًا للعينات. يُمكّن الجمع بين مُعرّفات الخلايا ومُعرّفات العينات من تسلسل ما يصل إلى 18432 مكتبة معًا. كما تُتيح بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) المُدمجة مع GeneGlobe إمكانية رسم الخرائط الأولية وتحليل التعبير التفاضلي.

إجراء

سير عمل مبتكر ومُحسَّن

تُعرّف مجموعة QIAseq UPX 3' Transcriptome Kit جيلاً جديداً من تقنيات التسلسل الجيني عالي الإنتاجية (NGS) ضمن منهجية QIAGEN الشاملة من العينة إلى التحليل. يتم أولاً نسخ الحمض النووي الريبوزي (RNA) النقي أو المستخلص من الخلايا عكسياً، ويُمنح كل جزيء RNA فهرساً جزيئياً فريداً (UMI)، وتُخصص له معرّفات خاصة بكل بئر (حتى 384 بئراً؛ معرّفات الخلايا). بعد النسخ العكسي مع تبديل القالب المدمج، تُدمج جميع نسخ الحمض النووي التكميلي (cDNA)، مما يُتيح تنفيذ خطوات بناء المكتبة المبسطة في أنبوب واحد. خلال عمليات التضخيم وبناء المكتبة اللاحقة، يُمكن تخصيص ما يصل إلى 48 فهرساً مختلفاً للمكتبة (معرّفات العينات). يتيح الجمع بين معرفات الخلايا ومعرفات العينات تسلسل ما يصل إلى 18432 مكتبة في وقت واحد (انظر الأشكال "Innovative and Optimized QIAseq UPX 3' Transcriptome Kit Workflow" و "QIAGEN's Sample to Insight QIAseq UPX 3' Transcriptome Workflow").

تحليل بيانات GeneGlobe بسهولة

يتوفر تحليل البيانات القائم على السحابة QIAseq UPX عبر مركز تحليل البيانات GeneGlobe ويوفر محاذاة القراءة و UMI وفك تشفير العينات، مع تحليل التعبير الجيني منخفض المدخلات.

التطبيقات

- تطبيقات الفحص عالي الإنتاجية (مثل أبحاث علم السموم)
- تحليل التعبير الجيني التفاضلي