شركة كياجين، 333242، مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA Worm Kit (24)

لـ 24 تفاعلًا: كاشف لإزالة الحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري؛ يدعم الديدان

سمات

- متوافق مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الموجهة من QIAGEN و Illumina و NEB و KAPA
- كاشف واحد لعينات دودة Caenorhabditis elegans (الديدان)
- إزالة عالية الأداء للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي و/أو الغلوبين في غضون 14 دقيقة فقط
- خطوة واحدة فقط للمعايرة - امزج كاشف QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي (RNA) وحضّنه
- لا توجد خطوات تنظيف إضافية أو تغييرات في بروتوكول مكتبة NGS

تفاصيل المنتج

تستخدم مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Worm طريقة مبتكرة لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالي الوفرة ذي القيمة العلمية المنخفضة من مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). يمكن للباحثين الذين يستخدمون تقنية تسلسل الحمض النووي الريبوزي لتحليل النسخ الكامل استخدام مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Worm لإزالة جميع الحمض النووي الريبوزي (rRNA) المُعَلَّم في RefSeq وEnsembl لديدان Caenorhabditis elegans. وبناءً على تشابه تسلسل الحمض النووي الريبوزي، ستعمل مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA Worm على أنواع أخرى من الديدان (بحسب تشابه تسلسل الحمض النووي الريبوزي المستهدف مع C. elegans).

قم بتحليل بيانات RNA-seq بسهولة باستخدام بوابة تحليل RNA-seq المتكاملة مع GeneGlobe - وهو حل تحليل بيانات بديهي قائم على الويب تم إنشاؤه لعلماء الأحياء ومضمن في مجموعة QIAseq هذه.

نوصي باستخدام مجموعات QIAseq Stranded RNA Library Kits لإعداد مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) عالية الجودة والمجزأة (FFPE) بدقة عالية. تستخدم هذه المجموعات تقنية الفهرسة المزدوجة الفريدة (UDIs) التي تُمكّن من تحليل ما يصل إلى 384 عينة في كل مسار خلية تدفق على أجهزة Illumina NGS، كما تُقلل من مشكلة قفز الفهرسة على أجهزة Illumina NovaSeq وخلايا التدفق المنقوشة. صمم مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة لإزالة أي نوع من الحمض النووي الريبوزي (RNA) من مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) الخاصة بك - اطلع على مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA).

هل ترغب بتجربة مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA Worm Kit لأول مرة؟ اطلب مجموعة تجريبية لتقييمها.

أداء

توفر مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Worm إزالة فعالة للغاية للـ rRNA (الشكل QIAseq FastSelect –rRNA Worm Kits توفر إزالة فعالة للغاية للـ rRNA) ورسم خرائط متسق للقراءة (الأشكال QIAseq FastSelect –rRNA Worm exon/intron/intergenic mapping، QIAseq FastSelect ‒rRNA Worm يقوم بتحويل تخصيص القراءة بشكل كبير من rRNA إلى الجينات و QIAseq FastSelect ‒rRNA Worm يقوم بتحويل تخصيص القراءة بشكل كبير من rRNA إلى الجينات: مخطط شريطي).

مبدأ

يؤدي حذف نسخ الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالية التعبير، ولكنها غير مهمة بيولوجيًا، إلى زيادة كفاءة تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS) وتمكين معالجة عينات أكثر بحساسية أعلى. علاوة على ذلك، قد يكون حذف أنواع الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيها من عينات الحمض النووي الريبوزي الكاملة والمجزأة أمرًا بالغ الصعوبة، وقد يؤدي إلى أداء دون المستوى الأمثل.

صُممت مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Worm Kits لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) السيتوبلازمي والميتوكوندري من الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) بسرعة وكفاءة أثناء تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بتقنية التسلسل عالي الإنتاجية (NGS). تتكامل QIAseq FastSelect بسلاسة مع سير عمل تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) الحالي لديك، لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) في خطوة واحدة مُدمجة مدتها 14 دقيقة. قبل تجزئة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بالحرارة (وهي عملية اختيارية وتعتمد على مجموعة تحضير المكتبة ونوع العينة)، يُضاف كاشف الإزالة QIAseq FastSelect مباشرةً إلى الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) والمحاليل المنظمة الخاصة بتحضير المكتبة. بعد التجزئة، تُخفض درجة حرارة التفاعل تدريجيًا إلى درجة حرارة الغرفة، وتُستكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. لا حاجة لإجراء أي نوع من الإثراء على عينات الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA). تضمن مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Worm Kits أداءً عاليًا باستمرار مع كميات الحمض النووي الريبوزي (RNA) التي تتراوح من 1 نانوغرام إلى 1 ميكروغرام. يمكن استخدام QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي من عينات طازجة من العديد من أنواع الديدان (اعتمادًا على تشابه تسلسل الحمض النووي الريبي المستهدف مع C. elegans)، ويوفر إزالة موثوقة للحمض النووي الريبي وقابلية تكرار عالية في التطبيقات اللاحقة.

إجراء

تعتمد معظم استراتيجيات إزالة أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي (RNA) المرتبطة ببناء مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) على معالجة مسبقة للعينات، تشمل التقاط الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه باستخدام التهجين أو الإزالة الأنزيمية. يتوافق إجراء QIAseq FastSelect الفريد الخاص بنا مع مجموعات مكتبات الحمض النووي الريبوزي من QIAGEN وIllumina وKAPA وNEB وغيرها، ويوفر إزالة كاملة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) في خطوة واحدة مباشرة مدتها 14 دقيقة (انظر الشكل: سير عمل مجموعة QIAseq FastSelect). يُعد هذا الإجراء أسرع بكثير من مجموعات استنفاد الحمض النووي الريبوزي البديلة، التي تتطلب بروتوكولات معالجة مسبقة تتضمن أكثر من 25 خطوة وساعتين لإتمامها.

ببساطة، أضف كاشف QIAseq FastSelect إلى عينة الحمض النووي الريبوزي (RNA)، وقم بتجزئة الحمض النووي (إن لزم الأمر)، ثم برد التفاعل تدريجيًا من 75 درجة مئوية إلى 25 درجة مئوية لمدة 14 دقيقة، ثم أكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. يعمل QIAseq FastSelect مع أو بدون تجزئة الحمض النووي الريبوزي، مما يوفر مرونة استخدام الحمض النووي الريبوزي المجزأ من عينات الديدان أو الحمض النووي الريبوزي عالي الجودة كجزء من سير عمل بناء مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) القياسي.

التطبيقات

يوفر نظام QIAseq FastSelect إزالة سريعة وموثوقة للحمض النووي الريبوزي (RNA) من عينات الحمض النووي الريبوزي الكاملة أو المجزأة من أنواع عديدة من الديدان (بحسب تشابه تسلسل الحمض النووي الريبوزي المستهدف مع دودة C. elegans). تتوفر مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Worm بأشكال وأحجام متنوعة لتناسب تطبيقاتكم الخاصة.