Qiagen، 333255، QIAseq FastSelect –rRNA Fish Kit (96)

لـ 96 تفاعلًا: كاشف لإزالة الحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري؛ يدعم الأسماك

سمات

- متوافق مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) من QIAGEN و Illumina و NEB و KAPA وغيرها
- إزالة عالية الأداء للحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري في غضون 14 دقيقة فقط
- خطوة واحدة فقط للمعايرة - امزج كاشف QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي (RNA) وحضّنه
- لا توجد خطوات تنظيف إضافية أو تغييرات في بروتوكول مكتبة NGS
- مصمم لتغطية أسماك الزيبرا (Danio rerio) وسمك السلمون (Salmo salar) والأنواع ذات الصلة

تفاصيل المنتج

تستخدم مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Fish طريقة مبتكرة لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالي الوفرة ذي القيمة العلمية المنخفضة من مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). يمكن للباحثين الذين يستخدمون تسلسل الحمض النووي الريبوزي لتحليل النسخ الكامل استخدام مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Fish لإزالة جميع الحمض النووي الريبوزي (rRNA) المُعَلَّم في RefSeq وEnsembl لأسماك الزيبرا (Danio rerio) وسمك السلمون الأطلسي (Salmo salar). وبناءً على تشابه تسلسل الحمض النووي الريبوزي، ستعمل مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Fish على أنواع أسماك إضافية (بحسب تشابه تسلسل الحمض النووي الريبوزي المستهدف مع أسماك الزيبرا أو سمك السلمون الأطلسي).

قم بتحليل بيانات RNA-seq بسهولة باستخدام بوابة تحليل RNA-seq المتكاملة مع GeneGlobe - وهو حل تحليل بيانات بديهي قائم على الويب تم إنشاؤه لعلماء الأحياء ومضمن في مجموعة QIAseq هذه.

نوصي باستخدام مجموعات QIAseq Stranded RNA Library Kits لإعداد مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) عالية الجودة والمجزأة (FFPE) بدقة عالية. تستخدم هذه المجموعات تقنية الفهرسة المزدوجة الفريدة (UDIs) التي تُمكّن من تحليل ما يصل إلى 384 عينة في كل مسار خلية تدفق على أجهزة Illumina NGS، كما تُقلل من مشكلة قفز الفهرسة على أجهزة Illumina NovaSeq وخلايا التدفق المنقوشة. صمم مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة لإزالة أي نوع من الحمض النووي الريبوزي (RNA) من مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) الخاصة بك - اطلع على مجموعات QIAseq FastSelect Custom RNA Removal Kits.

هل ترغب بتجربة مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA Fish Kit لأول مرة؟ اطلب مجموعة تجريبية لتقييمها.

مبدأ

يؤدي حذف نسخ الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالية التعبير، ولكنها غير مهمة بيولوجيًا، إلى زيادة كفاءة تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS) وتمكين معالجة عينات أكثر بحساسية أعلى. علاوة على ذلك، قد يكون حذف أنواع الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيها من عينات الحمض النووي الريبوزي الكاملة والمجزأة أمرًا بالغ الصعوبة، وقد يؤدي إلى أداء دون المستوى الأمثل.

صُممت مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Fish Kits لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) السيتوبلازمي والميتوكوندري للأسماك بسرعة وكفاءة من الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) أثناء تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بتقنية التسلسل من الجيل التالي (NGS). تتكامل QIAseq FastSelect بسلاسة مع سير عمل تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) الحالي لديك لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) في خطوة واحدة مُدمجة مدتها 14 دقيقة. قبل تجزئة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بالحرارة (وهي عملية اختيارية وتعتمد على مجموعة تحضير المكتبة ونوع العينة)، يُضاف كاشف الإزالة QIAseq FastSelect مباشرةً إلى الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) والمحاليل المنظمة الخاصة بتحضير المكتبة. بعد التجزئة، تُخفض درجة حرارة التفاعل تدريجيًا إلى درجة حرارة الغرفة، وتُستكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. لا حاجة لإجراء أي نوع من الإثراء على عينات الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA). تضمن مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Fish Kits أداءً عاليًا باستمرار مع كميات الحمض النووي الريبوزي (RNA) التي تتراوح من 1 نانوغرام إلى 1 ميكروغرام. يمكن استخدام QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي من عينات طازجة من العديد من أنواع الأسماك (اعتمادًا على تشابه تسلسل الحمض النووي الريبي المستهدف مع D. rerio أو S. salar)، ويوفر إزالة موثوقة للحمض النووي الريبي وقابلية تكرار عالية في التطبيقات اللاحقة.

إجراء

تعتمد معظم استراتيجيات إزالة أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي (RNA) المرتبطة ببناء مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) على معالجة مسبقة للعينات، تشمل التقاط الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه باستخدام التهجين أو الإزالة الأنزيمية. يتوافق إجراء QIAseq FastSelect الفريد الخاص بنا مع مجموعات مكتبات الحمض النووي الريبوزي من QIAGEN وIllumina وKAPA وNEB وغيرها، ويوفر إزالة كاملة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) في خطوة واحدة مباشرة مدتها 14 دقيقة (انظر الشكل: سير عمل مجموعة QIAseq FastSelect). يُعد هذا الإجراء أسرع بكثير من مجموعات استنفاد الحمض النووي الريبوزي البديلة، التي تتطلب بروتوكولات معالجة مسبقة تتضمن أكثر من 25 خطوة وساعتين لإتمامها.

ببساطة، أضف كاشف QIAseq FastSelect إلى عينة الحمض النووي الريبوزي (RNA)، وقم بتجزئة الحمض النووي الريبوزي (إن لزم الأمر)، ثم برد التفاعل تدريجيًا من 75 درجة مئوية إلى 25 درجة مئوية لمدة 14 دقيقة، ثم أكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. يعمل QIAseq FastSelect مع أو بدون تجزئة الحمض النووي الريبوزي، مما يوفر مرونة استخدام الحمض النووي الريبوزي المجزأ من عينات الأسماك أو الحمض النووي الريبوزي عالي الجودة كجزء من سير عمل بناء مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) القياسي.

التطبيقات

يوفر نظام QIAseq FastSelect إزالة سريعة وموثوقة للحمض النووي الريبوزي (RNA) من عينات الحمض النووي الريبوزي الكاملة أو المجزأة للعديد من أنواع الأسماك (بحسب تشابه تسلسل الحمض النووي الريبوزي المستهدف مع سمك الزيبرا أو سمك السلمون الأطلسي). تتوفر مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA Fish Kits بأشكال وأحجام متنوعة لتناسب تطبيقاتكم الخاصة.