كياجين، 333275، مجموعة QIAseq FastSelect لعلم الأوبئة (96)

لـ 96 تفاعلًا: كاشف إزالة الحمض النووي الريبوزي 5S/16S/23S لجميع أنواع البكتيريا؛ كاشف إزالة الحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري للإنسان والفأر والجرذ

سمات

- متوافق مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الموجهة من QIAGEN و Illumina و NEB و KAPA
- يوفر إزالة شاملة للحمض النووي الريبوزي 5S/16S/23S من الحمض النووي الريبوزي المجزأ أو كامل الطول، وإزالة الحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري من الإنسان والفأر والجرذ والأنواع ذات الصلة
- كواشف منفصلة للبكتيريا وHMR (الإنسان والفأر والجرذ) لتوفير المرونة في تطبيقات التسلسل الفردي أو المزدوج
- إجراء بسيط يتكامل مع سير العمل الحالي لتوفير الوقت

تفاصيل المنتج

صُممت مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology لإنشاء مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) ثنائية التسلسل أو ثنائية التسلسل للمضيف والممرض. يستطيع الباحثون الذين يستخدمون هذه المجموعات إزالة الحمض النووي الريبوزي البكتيري 5S/15S/23S، بالإضافة إلى الحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري البشري والفأري والجرذي. تُقدم الكواشف الخاصة بإزالة الحمض النووي الريبوزي البكتيري وHMR في أنابيب منفصلة، ​​مما يُتيح للباحثين تحسين سير عملهم في تسلسل الحمض النووي الريبوزي لعينات ثنائية التسلسل، أو بكتيرية، أو HMR. تستخدم مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology طريقة مبتكرة لإزالة الحمض النووي الريبوزي عالي الوفرة ذي القيمة العلمية المنخفضة من مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي. وقد تم اختبارها مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي من QIAGEN وIllumina وRoche/KAPA وNEB، وهي متوافقة مع جميع الطرق الرئيسية لإعداد مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي. يتكامل بروتوكول FastSelect البسيط الذي يستغرق 14 دقيقة والتنظيف اللاحق القائم على الخرز بسلاسة مع جميع مجموعات مكتبات RNA-seq الشائعة ويمكن استخدامه على الحمض النووي الريبي المجزأ أو كامل الطول (غير المجزأ).

قم بتحليل بيانات RNA-seq بسهولة باستخدام بوابة تحليل RNA-seq المتكاملة مع GeneGlobe - وهو حل تحليل بيانات بديهي قائم على الويب تم إنشاؤه لعلماء الأحياء ومضمن في مجموعة QIAseq هذه.

نوصي باستخدام مجموعات QIAseq Stranded RNA Library Kits لتحضير مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) بسرعة وكفاءة عالية، سواءً كانت عالية الجودة أو مجزأة للغاية. صمم مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة لإزالة أي نوع من الحمض النووي الريبوزي (RNA) من مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) الخاصة بك - اطلع على مجموعات QIAseq FastSelect Custom RNA Removal Kits.

هل ترغب بتجربة مجموعة QIAseq FastSelect Epidemiology Kit لأول مرة؟ اطلب مجموعة تجريبية لتقييمها.

مبدأ

يُحسّن إزالة نسخ الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالية التعبير، ولكنها غير ذات أهمية بيولوجية، من كفاءة تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS) ويُمكّن من معالجة عينات أكثر بحساسية أعلى. علاوة على ذلك، قد تكون إزالة أنواع الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيها من عينات الحمض النووي الريبوزي الكاملة والمجزأة صعبة للغاية، وقد تؤدي إلى أداء دون المستوى الأمثل. تُعدّ مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology Kits مجموعة شاملة لإزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) من البكتيريا، وهي مصممة لإزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي 5S و16S و23S، بالإضافة إلى الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي السيتوبلازمي والميتوكوندري البشري والفأري والجرذي من العينات المعقدة. صُمم كاشف إزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي الشامل لدينا باستخدام تسلسلات الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي 16S (ما يقرب من 600,000 مدخل)، و23S (ما يقرب من 170,000 مدخل)، و5S (أكثر من 7200 مدخل). تتوقع النمذجة الحاسوبية إزالة أكثر من 95% من الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي لجميع تسلسلات الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي 5S و16S و23S المعروفة. تستوعب مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology كميات من الحمض النووي الريبوزي (RNA) تتراوح من 20 نانوغرام إلى 1 ميكروغرام، مع أداء عالٍ وثابت، وهي متوافقة مع الحمض النووي الريبوزي منخفض الجودة، أو المجزأ بشدة، أو كامل الطول عالي الجودة. ولأن QIAseq FastSelect لا تستخدم الهضم الأنزيمي أو إجراءات الالتقاط الهجين، فإن سير العمل السريع والبسيط ينتج عنه إزالة موثوقة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) وقابلية عالية للتكرار في التطبيقات اللاحقة. إن إجراء QIAseq FastSelect الفريد لدينا أسرع بكثير من الطرق الحالية، وقد تم اختبار مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) الموجهة من QIAGEN وIllumina وNEB.

إجراء

تعتمد معظم استراتيجيات إزالة أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي (RNA) المرتبطة ببناء مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) على معالجة مسبقة للعينات، تشمل التقاط الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه باستخدام التهجين أو الإزالة الأنزيمية. يتوافق إجراء QIAseq FastSelect الفريد الخاص بنا مع مجموعات مكتبات الحمض النووي الريبوزي من QIAGEN وIllumina وKAPA وNEB وغيرها، ويوفر إزالة كاملة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) في خطوة واحدة مضمنة مدتها 14 دقيقة (انظر الشكل "سير عمل مجموعة QIAseq FastSelect"). يُعد هذا الإجراء أسرع بكثير من مجموعات استنفاد الحمض النووي الريبوزي البديلة، التي تتطلب بروتوكولات معالجة مسبقة تتضمن أكثر من 25 خطوة وساعتين لإكمالها (انظر الشكل QIAseq FastSelect - 5S/16S/23S مقابل الطرق الأخرى: إزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي). تتكامل مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology بسلاسة مع تحضير مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي الحالية، مما يوفر إزالة الحمض النووي الريبوزي في خطوة واحدة مدتها 14 دقيقة، تليها عملية تنظيف الخرز. قبل تجزئة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بالحرارة (وهي عملية اختيارية وتعتمد على مجموعة تحضير المكتبة ونوع العينة)، يُخلط QIAseq FastSelect مباشرةً مع الحمض النووي الريبوزي الكلي ومحلول التجزئة. بعد التجزئة الاختيارية، تُخفض درجة حرارة التفاعل تدريجيًا من 75 درجة مئوية إلى 25 درجة مئوية على مدى 14 دقيقة، ثم يُجرى تنظيف باستخدام الخرز. يصبح الحمض النووي الريبوزي جاهزًا بعد ذلك لعملية النسخ العكسي.

التطبيقات

توفر تقنية QIAseq FastSelect إزالة سريعة وموثوقة للحمض النووي الريبوزي (RNA) من عينات الحمض النووي الريبوزي الكاملة أو المجزأة من العديد من الأنواع. تتوفر مجموعات QIAseq FastSelect Epidemiology بأشكال وأحجام متنوعة لتناسب تطبيقاتك الخاصة.