مجموعة إزالة الحمض النووي الريبوزي المخصصة QIAseq FastSelect من شركة Qiagen، رقم 333390

تتضمن مجموعة QIAseq FastSelect لإزالة الحمض النووي الريبوزي المخصص لـ 1536 عينة قياسية

سمات

- حدد ما يصل إلى 20000 قاعدة من الحمض النووي الريبي لإزالتها
- يبقى المنتج صالحاً لمدة 18 شهراً على الأقل عند تخزينه وفقاً للإرشادات
- خطوة واحدة فقط للمعايرة - امزج كاشف QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي (RNA) وحضّنه
- يعمل مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الموجهة من QIAGEN و Illumina و NEB و KAPA وغيرها
- يعمل بكفاءة متساوية مع الحمض النووي الريبي عالي الجودة أو المجزأ للغاية

تفاصيل المنتج

تستخدم مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) طريقة مبتكرة لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالي الوفرة وقليل القيمة العلمية من مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). يمكنك الآن تصميم مجموعات QIAseq FastSelect مخصصة لإزالة أي نوع من الحمض النووي الريبوزي (RNA) ترغب به من مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). ما عليك سوى لصق تسلسلات الحمض النووي الريبوزي (RNA) التي تريد إزالتها في أداة QIAseq FastSelect Custom Builder لإنشاء رقم كتالوج فريد لمجموعة FastSelect المخصصة.

قم بتحليل بيانات RNA-seq بسهولة باستخدام بوابة تحليل RNA-seq المتكاملة مع GeneGlobe - وهو حل تحليل بيانات بديهي قائم على الويب تم إنشاؤه لعلماء الأحياء ومضمن في مجموعة QIAseq هذه.

مبدأ

يُسهم حذف نسخ الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالية التعبير، ولكنها غير ذات أهمية بيولوجية، في رفع كفاءة تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS) وزيادة إنتاجية العينات مع حساسية أعلى. علاوة على ذلك، يُعدّ حذف أنواع الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيها من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) ومن عينات الحمض النووي الريبوزي المتدهورة تحديًا كبيرًا، وقد يؤدي إلى أداء دون المستوى الأمثل.

صُممت تقنية QIAseq FastSelect لإزالة الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه (RNA) من الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) بسرعة وكفاءة أثناء تحضير مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) بتقنية التسلسل من الجيل التالي (NGS). تتكامل QIAseq FastSelect بسلاسة مع سير عمل تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) الحالي لديك، لإزالة الحمض النووي الريبوزي في خطوة واحدة مُدمجة مدتها 14 دقيقة. قبل تجزئة الحمض النووي الريبوزي بالحرارة (وهي عملية اختيارية وتعتمد على مجموعة تحضير المكتبة ونوع العينة)، يُضاف كاشف الإزالة QIAseq FastSelect مباشرةً إلى الحمض النووي الريبوزي الكلي والمحاليل المنظمة الخاصة بتحضير المكتبة. بعد التجزئة، تُخفض درجة حرارة التفاعل تدريجيًا إلى درجة حرارة الغرفة، وتُستكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. لا حاجة لإجراء أي نوع من الإثراء على عينات الحمض النووي الريبوزي الكلي. تضمن مجموعات QIAseq FastSelect أداءً عاليًا باستمرار مع كميات الحمض النووي الريبوزي التي تتراوح من 1 نانوغرام إلى 1 ميكروغرام. يمكن استخدام QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي من العينات الطازجة، وكذلك الحمض النووي الريبي من عينات FFPE أو الحمض النووي الريبي المتدهور، ويوفر إزالة موثوقة للحمض النووي الريبي الريبوسومي وقابلية تكرار عالية في التطبيقات اللاحقة.

إجراء

تعتمد معظم استراتيجيات إزالة أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي (RNA) المرتبطة ببناء مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) على معالجة مسبقة للعينات، تشمل التقاط الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه باستخدام التهجين أو الإزالة الأنزيمية. يتوافق إجراء QIAseq FastSelect الفريد الخاص بنا مع مجموعات تحضير مكتبات QIAGEN وIllumina وKAPA وNEB، ويوفر إزالة كاملة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) في خطوة واحدة مباشرة مدتها 14 دقيقة (انظر الشكل "سير عمل مجموعة QIAseq FastSelect"). يُعد هذا الإجراء أسرع بكثير من مجموعات استنفاد الحمض النووي الريبوزي البديلة، التي تتطلب بروتوكولات معالجة مسبقة تتضمن أكثر من 25 خطوة وساعتين لإتمامها.

ببساطة، أضف كاشف QIAseq FastSelect إلى عينة الحمض النووي الريبوزي (RNA)، وقم بتجزئة الحمض النووي الريبوزي (إن لزم الأمر)، ثم برد التفاعل تدريجيًا من 75 درجة مئوية إلى 25 درجة مئوية لمدة 14 دقيقة، ثم أكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. يعمل QIAseq FastSelect مع أو بدون تجزئة الحمض النووي الريبوزي، مما يوفر مرونة في استخدام الحمض النووي الريبوزي من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) أو عينات الحمض النووي الريبوزي المتدهورة، أو الحمض النووي الريبوزي عالي الجودة كجزء من سير عمل بناء مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) القياسي أو الخاص بـ FFPE.

التطبيقات

توفر تقنية QIAseq FastSelect استخلاصًا سريعًا وموثوقًا للحمض النووي الريبوزي (RNA) من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) وعينات الحمض النووي الريبوزي الطازجة. تتوفر مجموعات QIAseq FastSelect بأشكال وأحجام متنوعة لتناسب تطبيقاتك الخاصة، مثل استكشاف أخطاء استخلاص الحمض النووي الريبوزي وإصلاحها.