شركة كياجين، 333430، مجموعة كواشف QIAseq xHYB البشرية (24)

مجموعة تحتوي على مواد استهلاكية إضافية متوافقة مع مجموعات xHYB و exome لإثراء مكتبات ما قبل الالتقاط؛ لا تحتوي هذه المجموعة على مجموعات إثراء أو مواد تحضير المكتبة

سمات

- يغطي أكثر من 720 جينًا، ويكشف عن الطفرات النقطية المفردة، والحذف والإدخال، وتغيرات عدد النسخ، وعدم استقرار الميكروساتلايت، وحمل الطفرات الكلي، واندماجات الحمض النووي الريبي.
- تحليل متغيرات الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA من عينة واحدة عن طريق إقرانها بمجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Lib Kit
- يغطي المناطق الصعبة، بما في ذلك المناطق ذات المحتوى العالي من GC
- متوافق مع أنواع متعددة من العينات، بما في ذلك عينات FFPE وعينات الخزعة السائلة
- قم بتخصيص اللوحات أو توسيع نطاق التغطية باستخدام مجسات إضافية

تفاصيل المنتج

اسم اللوحة: المواصفات
لوحة QIAseq xHYB CGP DNA: تكشف عن الطفرات النقطية المفردة (SNVs) والحذف والإدخال (indels) في 724 جينًا ورميًا وجينًا كابحًا للأورام؛ وتدعم تحليلات TMB وMSI.
لوحة QIAseq xHYB CGP RNA: تكشف عن عمليات الاندماج والتضفير وحذف الإكسونات في 274 جينًا
لوحة QIAseq xHYB DNA Fusion and MSI+: في غياب الحمض النووي الريبوزي (RNA)، تكشف عن اندماجات الحمض النووي في 50 جينًا؛ وتستهدف أكثر من 4000 علامة MSI لتحليل MSI الأمثل؛ وهي مصممة لعينات الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfDNA) ويمكن استخدامها كلوحة مستقلة أو كإضافة إلى لوحة QIAseq xHYB CGP DNA.

- استهداف مناطق محددة ذات أهمية باستخدام لوحات مخصصة بالكامل
- توسيع تغطية لوحة QIAseq xHYB CGP الحالية بسلاسة
- تعزيز التغطية بإضافة مجسات إضافية للحصول على رؤى أعمق حول المؤشرات الحيوية

تُعدّ لوحات QIAseq xHYB CGP مُصممة بعناية فائقة لإجراء تحليل شامل للجينوم (CGP). تستهدف هذه اللوحات مناطق جينومية رئيسية، وتضمّ جينات ذات متغيرات قابلة للتطبيق والتفسير، مُستقاة من قاعدة بيانات الطفرات الجسدية البشرية (HSMD) باستخدام مُرشّحات التطبيق من المستوى الأول والثاني. كما أنها تتوافق مع إرشادات الممارسة السريرية المُوصى بها من قِبل العديد من المنظمات، مما يضمن تغطية عالية للمناطق الحيوية عبر أكثر من 720 جينًا. يضمن تصميم المجسات المُحسّن التقاطًا فعالًا للمناطق الصعبة، بما في ذلك المناطق ذات المحتوى العالي من GC، مما يوفر بيانات موثوقة من أصعب العينات، مثل عينات FFPE وcfDNA.

يمكن دمج لوحات QIAseq xHYB CGP مع مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit للحصول على تحليل جينومي شامل من عينة واحدة من الأحماض النووية الكلية.

اختر لوحة CGP المناسبة لاحتياجات بحثك:

قم بتخصيص لوحة CGP وفقًا للمتغيرات التي تهمك:

أداء

الميزات: المواصفات
المتغيرات المسماة: SNVs، InDels، CNVs، الاندماجات، ومتغيرات التضفير
البصمات الجينومية المسماة: TMB، MSI
إجمالي وقت الإنجاز: 1.5 يوم من الحمض النووي إلى مكتبة جاهزة للتسلسل
تجميع العينات لالتقاط الصور الهجينة: حتى 8 عينات
النوع: بشري
أنواع العينات المتخصصة: FFPE، cfDNA
كمية الأحماض النووية المُدخلة: 40 نانوغرام من الحمض النووي DNA، 40-80 نانوغرام من الحمض النووي RNA. ملاحظة: قد يؤثر تقليل الكمية المُدخلة على كشف المتغيرات التي تقل نسبة تردد الأليل المتغير فيها عن 5%، وهو الحد الأدنى للكشف.
الحساسية التحليلية: >95% (المتغيرات الصغيرة، 5% VAF)
الخصوصية التحليلية: >99.995% (متغيرات صغيرة، 5% VAF)
عدد القراءات الخام الموصى به (بالملايين) بناءً على 2 × 150 زوجًا قاعديًا: 75 مليونًا لـ DNA المستخلص من عينات FFPE، و25 مليونًا لـ RNA المستخلص من عينات FFPE
برامج تحليل البيانات الموصى بها: QIAGEN CLC Genomics Workbench للتحليل الثانوي، وQIAGEN Clinical Insight للتحليل الثالثي
إجمالي وقت التحليل: 5 أيام من أخذ العينة إلى التقرير النهائي

- بالنسبة لعينات FFPE، فإن الجمع بين لوحات الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA يوفر رؤية كاملة للتغيرات الجينومية، بما في ذلك SNVs، وindels، وCNVs، وTMB، وMSI، واندماجات الحمض النووي الريبي RNA.
- بالنسبة لعينات الخزعة السائلة، فإن دمج لوحة الحمض النووي مع لوحة الاندماج وعدم استقرار الميكروساتلايت (MSI+) يعزز حساسية الكشف عن الاندماجات السرطانية في 50 جينًا ويعزز الكشف عن عدم استقرار الميكروساتلايت في الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfDNA) ذي المدخلات المنخفضة

تغطية موحدة وحساسية عالية

توفر لوحات QIAseq xHYB CGP تغطية متجانسة استثنائية، مما يضمن تغطية أكثر من 99% من القواعد المستهدفة بتركيز ≥20x، بغض النظر عن محتوى GC. وهذا يُمكّن من الكشف عن المتغيرات بحساسية عالية، مع حساسية مُجمعة تزيد عن 95% وخصوصية تزيد عن 99.995% للمتغيرات الصغيرة، مع تقليل فقدان البيانات إلى أدنى حد.

إنجاز سريع

بفضل أوقات التهجين القصيرة التي تصل إلى 30 دقيقة والتوافق التام مع التشغيل الآلي، توفر لوحات QIAseq xHYB CGP نتائج سريعة وعالية الجودة وقابلة للتكرار. وعند استخدامها مع مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit، فإنها تتيح إجراء تحليل جينومي شامل من عينة واحدة من الحمض النووي. يدمج سير العمل المبسط مؤشرات جزيئية فريدة (UMIs) لضمان الدقة، مما يوفر مكتبات جاهزة للتسلسل في غضون 1.5 يوم فقط.

مرونة نوع العينة

تتيح لوحات QIAseq xHYB CGP إجراء تحليل جينومي شامل من عينات FFPE وعينات الخزعة السائلة، مما يضمن رؤى دقيقة وقابلة للتنفيذ لتطبيقات البحث الانتقالي.

مبدأ

تستخدم لوحات QIAseq xHYB CGP تقنية التهجين الالتقاطي لإثراء تسلسلات محددة من الجينوم البشري مرتبطة بمتغيرات معروفة من مكتبات الجينوم الكامل أو النسخ الجيني المفهرسة. يتيح سير العمل المرن إجراء التهجين الالتقاطي المتزامن لما يصل إلى 8 عينات باستخدام 200 نانوغرام فقط من المدخلات لكل مكتبة.

بعد تهجين المجسات مع أهدافها، ترتبط الهجائن بين المجسات والأهداف بخرزات مغناطيسية مغلفة بالستربتافيدين عبر تفاعلها مع علامة البيوتين الموجودة على المجسات. ثم يُستخدم مغناطيس لتثبيت هذه الخرزات الحاملة للهجائن على جدار الأنبوب أثناء غسل الحمض النووي غير المرتبط، مما يقلل من التأثيرات الجانبية. بعد ذلك، تُضخّم الأهداف وتُجهز للتسلسل.

إجراء

يُوصى باستخدام مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit لتحضير مكتبات الجينوم الكامل والترانسكريبتوم الكامل (WGS/WTS) قبل عملية التهجين باستخدام لوحات QIAseq xHYB CGP. كما تتوافق مجموعات تحضير مكتبات WGS/WTS الأخرى، شريطة تحضير المكتبات دون تعديلات باستخدام البيوتين. تبدأ مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit بعينة واحدة من إجمالي الأحماض النووية، وتُنتج مكتبات DNA وRNA لمزيد من إثراء الهدف، مع نقاط توقف آمنة للمتابعة باستخدام DNA فقط، أو RNA فقط، أو كليهما. يلي ذلك إثراء الهدف عن طريق التهجين باستخدام سير عمل QIAseq xHYB CGP، ثم التسلسل.

يتم تحميل ملفات FASTQ الناتجة إلى سير عمل QIAseq xHYB CGP ضمن منصة QIAGEN CLC Genomics Workbench لإجراء عمليات التصفية، ورسم خرائط القراءات، وتحديد المتغيرات. كما يتم تحميل مخرجات VCF إلى برنامج QIAGEN Clinical Insight – Interpret (QCI-I)، مما يتيح عملية تصفية متسلسلة للمتغيرات تُسهّل تحديد أولوياتها لتفسيرها استنادًا إلى الأدلة.

التطبيقات

- تقييم TMB وMSI لتحسين نتائج العلاج المناعي
- مراقبة التغيرات في الطفرات والاندماجات بمرور الوقت لدراسة عدم تجانس الورم ومقاومته
- دمج البيانات الجينومية الشاملة في اختبار واحد لتبسيط كفاءة البحث
- الكشف عن التغيرات القابلة للتنفيذ للتحقق من فعالية العلاج المستهدف

توفر لوحات QIAseq xHYB CGP رؤى جينومية شاملة للنهوض بأبحاث السرطان: