كياجين، 334378، QIAseq FastSelect -Globin Kit (384)

تتضمن العبوة 4 أنابيب من كاشف QIAseq FastSelect لإزالة mRNA الغلوبين؛ تكفي لـ 384 تفاعلًا من عينات بشرية وفئران وجرذان

سمات

- متوافق مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الموجهة من QIAGEN و Illumina و NEB و KAPA
- كاشف واحد للإنسان والفأر والجرذ وأنواع الثدييات الأخرى
- إزالة عالية الأداء للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي و/أو الغلوبين في غضون 14 دقيقة فقط
- خطوة واحدة فقط للمعايرة - امزج كاشف QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي (RNA) وحضّنه
- لا توجد خطوات تنظيف إضافية أو تغييرات في بروتوكول مكتبة NGS

تفاصيل المنتج

تستخدم مجموعتا QIAseq FastSelect –rRNA HMR وQIAseq FastSelect –Globin طريقة مبتكرة لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالي الوفرة ذي القيمة العلمية المنخفضة من مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). يمكن للباحثين الذين يستخدمون تسلسل الحمض النووي الريبوزي لتحليل النسخ الكامل استخدام QIAseq FastSelect –rRNA HMR لإزالة الحمض النووي الريبوزي السيتوبلازمي والميتوكوندري، بينما يمكن للباحثين الذين يبدأون بعينات الدم استخدام QIAseq FastSelect –rRNA/Globin لإزالة كل من الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) والحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الخاص بالغلوبين. أما بالنسبة للباحثين الذين يقومون بإثراء الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) من الدم، ويرغبون فقط في إزالة الحمض النووي الريبوزي الرسول الخاص بالغلوبين، فنوصي باستخدام QIAseq FastSelect –Globin. تزيل مجموعتا QIAseq FastSelect –rRNA HMR وQIAseq FastSelect –Globin كمية أكبر من الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه، وهما أسرع بنسبة 30% من الإصدارات السابقة من مجموعتنا.

قم بتحليل بيانات RNA-seq بسهولة باستخدام بوابة تحليل RNA-seq المتكاملة مع GeneGlobe - وهو حل تحليل بيانات بديهي قائم على الويب تم إنشاؤه لعلماء الأحياء ومضمن في مجموعة QIAseq هذه.

نوصي باستخدام مجموعات QIAseq Stranded RNA Library Kits، وهي مجموعات تحضير مكتبات الحمض النووي الريبي القوية الخاصة بالسلسلة، للعينات عالية الجودة والمجزأة للغاية، مثل FFPE.

صمم مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة الخاصة بك لإزالة أي RNA ترغب فيه من مكتبة RNA-seq الخاصة بك - ألق نظرة على مجموعات إزالة RNA المخصصة QIAseq FastSelect الخاصة بنا.

هل ترغب بتجربة مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA/Globin لأول مرة؟ اطلب مجموعة تجريبية لتقييمها.

أداء

أظهرت مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA HMR كفاءة عالية في إزالة الحمض النووي الريبوزي (rRNA) وأداءً فائقًا مقارنةً بإصدارات مجموعاتنا السابقة والمنتجات البديلة. انظر الأشكال: تزيل مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR الحمض النووي الريبوزي (rRNA) بخطوة واحدة خلال 14 دقيقة. تتميز مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR بتغطية شاملة لإزالة أهداف الحمض النووي الريبوزي (rRNA) السيتوبلازمية والميتوكوندرية. تتميز مجموعة QIAseq FastSelect –Globin بتغطية شاملة لإزالة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) للغلوبين البالغ والجنين والخلايا الجنينية. توفر مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR إزالة أكبر للحمض النووي الريبوزي (rRNA) مقارنةً بالإصدارات السابقة. تُظهر مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR نتائج تعبير جيني مماثلة للإصدارات السابقة. تحافظ مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR على نمط التعبير: الكشف عن الجينات المُعبر عنها (RPKM > 0.3). تحافظ مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR على نمط التعبير: الكشف المتسق عن الجينات المُعبر عنها (RPKM > 0.3).

أداء قوي مع مجموعة متنوعة من أنواع العينات، بغض النظر عن كمية الحمض النووي الريبي المدخلة

يوفر QIAseq FastSelect إزالة موثوقة للـ rRNA، وتعيين قراءة متسق، ونتائج تعبير جيني قابلة للتكرار مع الحمض النووي الريبي المستخرج من أنواع مختلفة من العينات، بما في ذلك FFPE، وعلى نطاق واسع من كميات إدخال الحمض النووي الريبي. انظر الأشكال: مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR هي حل واحد يزيل الحمض النووي الريبوزي (rRNA) الميتوكوندري والسيتوبلازمي من عينات الإنسان والفأر والجرذ وغيرها من الثدييات. توفر مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR توزيعًا متسقًا لخرائط القراءة بين النسخ المتماثلة. تُظهر مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA/Globin نتائج متسقة عبر نطاق واسع من مدخلات الحمض النووي الريبوزي: إزالة فعالة وقابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA) والحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) للغلوبين، بغض النظر عن مدخلات الحمض النووي الريبوزي. تُظهر مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA/Globin نتائج متسقة عبر نطاق واسع من مدخلات الحمض النووي الريبوزي: تحليل متسق للغاية للقراءات المُرتبطة، بغض النظر عن مدخلات الحمض النووي الريبوزي. تُظهر مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA/Globin نتائج متسقة عبر نطاق واسع من مدخلات الحمض النووي الريبوزي: نتائج التعبير الجيني. تعمل مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR مع عينات الحمض النووي الريبوزي المُثبتة بالفورمالين والمُضمنة في البارافين (FFPE) والعينات المُتدهورة. تعمل مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR مع عينات الحمض النووي الريبوزي المُثبتة بالفورمالين والمُضمنة في البارافين (FFPE) والعينات المُتدهورة: إزالة يؤدي تحليل الحمض النووي الريبوزي (rRNA) إلى زيادة دقة تحديد مواقع الإكسونات. يعمل جهاز QIAseq FastSelect –rRNA HMR مع عينات الحمض النووي الريبوزي (RNA) المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) والعينات المتدهورة: نتائج التعبير الجيني. يتميز جهاز QIAseq FastSelect –rRNA HMR بأداء قوي مع عينات الحمض النووي الريبوزي (RNA) المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE).

مبدأ

بعد استخدام مجموعة استخلاص الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA)، يُسهم استبعاد نسخ الحمض النووي الريبوزي (RNA) عالية التعبير، ولكنها غير ذات أهمية بيولوجية، في رفع كفاءة تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS) وزيادة إنتاجية العينات مع حساسية أعلى. علاوة على ذلك، يُعدّ استبعاد أنواع الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيها من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) ومن عينات الحمض النووي الريبوزي المتدهورة أمرًا بالغ الصعوبة، وقد يؤدي إلى أداء دون المستوى الأمثل.

صُممت مجموعة QIAseq FastSelect لإزالة الحمض النووي الريبوزي (rRNA) السيتوبلازمي والميتوكوندري، و/أو الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) الخاص بالغلوبين، من الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) بسرعة وكفاءة أثناء تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) لتقنية التسلسل من الجيل التالي (NGS). تتكامل QIAseq FastSelect بسلاسة مع سير عمل تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA) الحالي لديك، لإزالة الحمض النووي الريبوزي (RNA) في خطوة واحدة مضمنة مدتها 14 دقيقة. قبل تجزئة الحمض النووي الريبوزي (RNA) بالحرارة (وهي عملية اختيارية وتعتمد على مجموعة تحضير المكتبة ونوع العينة)، يُضاف كاشف الإزالة QIAseq FastSelect مباشرةً إلى الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA) والمحاليل المنظمة الخاصة بتحضير المكتبة. بعد التجزئة، تُخفض درجة حرارة التفاعل تدريجيًا إلى درجة حرارة الغرفة، وتُستكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. لا حاجة لإجراء أي نوع من الإثراء على عينات الحمض النووي الريبوزي الكلي (RNA). تضمن مجموعتا QIAseq FastSelect –rRNA HMR وQIAseq FastSelect –Globin أداءً عاليًا باستمرار مع كميات الحمض النووي الريبوزي (RNA) التي تتراوح من 1 نانوغرام إلى 1 ميكروغرام. يمكن استخدام QIAseq FastSelect مع الحمض النووي الريبي من العينات الطازجة، وكذلك الحمض النووي الريبي من عينات FFPE (المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين) أو الحمض النووي الريبي المتدهور، ويوفر إزالة موثوقة للحمض النووي الريبي الريبوسومي وقابلية تكرار عالية في التطبيقات اللاحقة.

إجراء

تعتمد معظم استراتيجيات إزالة أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي (RNA) المرتبطة ببناء مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) على معالجة مسبقة للعينات، تشمل التقاط الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه باستخدام التهجين أو الإزالة الأنزيمية. يتوافق إجراء QIAseq FastSelect الفريد الخاص بنا مع مجموعات تحضير مكتبات QIAGEN وIllumina وKAPA وNEB، ويوفر إزالة كاملة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) في خطوة واحدة مباشرة مدتها 14 دقيقة (انظر الشكل: سير عمل مجموعة QIAseq FastSelect). يُعد هذا الإجراء أسرع بكثير من مجموعات استنفاد الحمض النووي الريبوزي البديلة، التي تتطلب بروتوكولات معالجة مسبقة تتضمن أكثر من 25 خطوة وساعتين لإتمامها.

ببساطة، أضف كاشف QIAseq FastSelect (لإزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي و/أو إزالة الغلوبين) إلى عينة الحمض النووي الريبوزي، وقم بتجزئة الحمض النووي الريبوزي (إن لزم الأمر)، ثم برد التفاعل تدريجيًا من 75 درجة مئوية إلى 25 درجة مئوية لمدة 14 دقيقة، ثم أكمل خطوات تحضير المكتبة المتبقية. يعمل QIAseq FastSelect مع أو بدون تجزئة الحمض النووي الريبوزي، مما يوفر مرونة استخدام الحمض النووي الريبوزي من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) أو عينات الحمض النووي الريبوزي المتدهورة، أو الحمض النووي الريبوزي عالي الجودة كجزء من سير عمل بناء مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي القياسي.

التطبيقات

يوفر نظام QIAseq FastSelect إزالة سريعة وموثوقة للحمض النووي الريبوزي (RNA) من عينات الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) وعينات الحمض النووي الريبوزي الطازجة. تتوفر مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA HMR وQIAseq FastSelect –Globin بأشكال وأحجام متنوعة لتناسب تطبيقاتك الخاصة.