Product Description
يحتوي على جميع مواد تحضير المكتبة والفهارس وكواشف الالتقاط الهجين اللازمة لتحضير وإثراء 96 عينة باستخدام سير عمل QIAseq xHYB الميكروبي. يحتوي على مجموعة الفهارس UDI-A.
سمات
- يُمكّن من إجراء تسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا السل (MTB) دون الحاجة إلى زراعة البكتيريا
- يغطي جميع مؤشرات مقاومة السل للمضادات الحيوية (AMR)
- مصمم وفقًا للسلالات السبع الرئيسية لبكتيريا السل لإجراء تحليل شامل
- يستخدم تقنية الإثراء بالتقاط الهجين وتقنية QIAseq xHYB Chemistry
تفاصيل المنتج
تتيح لوحة QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis إجراء التسلسل الجينومي الكامل (WGS) الشامل لمرض السل من عينات مثل البلغم أو السائل النخاعي الشوكي (CSF)، مما يؤدي إلى تبسيط العملية وتسهيل الكشف السريع عن سلالات MTB وتوصيفها.
أداء
- تغطية شاملة: يتيح WGE الكشف عن الطفرات والاختلافات عبر جينوم MTB بأكمله، بما في ذلك المناطق غير المشفرة والعناصر التنظيمية.
- الكشف المحسن عن مقاومة مضادات الميكروبات: يكشف WGE عن علامات مقاومة مضادات الميكروبات الجديدة ويوفر تقييمًا شاملاً للمحددات الجينية لمقاومة الأدوية.
- تحديد السلالة: يحدد WGE بدقة السلالة والعلاقة التطورية لسلالات MTB، مما يوفر رؤى قيمة حول ديناميكيات انتقال MTB وعلم الأوبئة.
- ضمان إمكانية التحليل المستقبلي: تتيح تقنية الجينوم الكامل (WGE) إجراء تحليل استرجاعي للعينات السابقة. علاوة على ذلك، إذا احتجت إلى إعادة تحليل العينات في المستقبل، فيمكن إعادة تحليل العينات المُحضّرة بتقنية WGE للكشف عن المؤشرات الجينية المكتشفة حديثًا وآليات مقاومة الأدوية.
بفضل الإثراء المستهدف للجينوم الكامل (WGE)، توفر لوحة QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis تغطية عالية المستوى لجينوم MTB بأكمله، حتى من العينات ذات الجودة المنخفضة (الشكل 1، الشكل 2، الشكل 3).
مزايا تقنية الجينوم الكامل (WGE) مقارنةً بتقنيات التضخيم المستهدف
مبدأ
تستخدم لوحة QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis تقنية الجينوم الكامل المستهدف، حيث تُوزّع مجسات الالتقاط الهجينة على كامل جينوم المتفطرة السلية. صُممت اللوحة لتشمل تسلسلات تمثيلية متعددة من كل سلالة من السلالات السبع الرئيسية للمتفطرة السلية، مما يتيح تغطية شاملة لتنوعها. وتغطي اللوحة جميع الجينات المعروفة المرتبطة بالمقاومة.
إجراء
بناء مكتبة الحمض النووي QIAseq FX
يمكن تحويل كل من الحمض النووي الجينومي المعزول أو الحمض النووي الكلي إلى مكتبات NGS متوافقة مع Illumina باستخدام مجموعة QIAseq FX DNA Library Kit. تُقطع منتجات الحمض النووي إنزيميًا، ثم يُصلح طرف الحمض النووي المجزأ، ويُضاف حرف "A" إلى الطرف 3'. تُربط محولات خاصة بمنصة Illumina. تحتوي هذه المحولات على التسلسلات اللازمة لربط المكتبة أثناء تسلسل الخلايا التدفقية. بعد التنقية، تُضخّم المكتبات للحصول على كميات كافية لتفاعل الالتقاط الهجين.
التقاط هجين
تُهجّن مكتبات ما قبل الالتقاط مع مجسات QIAseq xHYB الخاصة ببكتيريا السل. ثم تُربط الهجائن بين المجس والهدف بخرزات مغناطيسية مغلفة بالستربتافيدين وتُغسل. بعد ذلك، تُضخّم المكتبات المُخصبة وتُجهز للتسلسل على أنظمة Illumina.
تحليل
يمكن تحليل ملف FASTQ الناتج باستخدام برنامج QIAGEN CLC Genomics Workbench أو أي طريقة أخرى متوافقة مع تسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا السل. يوفر برنامج CLC Genomic Workbench تقريرًا شاملاً حول تصنيف سلالة بكتيريا السل، وتحديد النمط الجيني (spoligotyping)، والجينات المرتبطة بالمقاومة.
التطبيقات
- تحديد سلالة الدراجات الجبلية
- مقاومة الكتابة
- مراقبة تفشي الأمراض في الوقت الفعلي
يُعد QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis مثاليًا للمختبرات السريرية ووكالات الصحة العامة والمؤسسات البحثية التي تسعى للحصول على لوحة قوية لمراقبة وبحوث مرض السل.
يمكن استخدام هذه اللوحة من أجل:
Order Guidelines
1. Price & Stock Available on Request. Click to send email to: service@iright.com
2. Please DO NOT make payment before confirmation.
3. Minimum order value of $1,000 USD required.
Collaboration
Tony Tang
Email: Tony.Tang@iright.com
Mobile/WhatsApp/Wechat: +86-17717886924