Qiagen، 334594، QIAseq Poly-C Carrier RNA (50)

٥٠ تفاعلًا من الحمض النووي الريبي الحامل متعدد السيتوزين. يمكن استخدامه كبديل للحمض النووي الريبي الحامل متعدد الأدينين. يُوصى باستخدامه مع لوحة QIAseq xHYB HepC وعند إجراء تسلسل الفيروس الكامل.

سمات

- يكشف عن الأهداف الميكروبية ويحدد تسلسلها بثقة وسهولة وكفاءة
- يقوم بتحليل ما يصل إلى 384 عينة عند اقترانه بمجموعة أدوات مكتبة الحمض النووي QIAseq FX
- يزيل اختناقات البيانات ويقلل من وقت الاستجابة الإجمالي من خلال تحليل البيانات السريع وتفسير المتغيرات
- صمم لوحتك المخصصة لاستهداف أي مجموعة من أنواع الميكروبات التي تختارها

تفاصيل المنتج

تتضمن لوحة QIAseq xHYB التنفسية مجسات لإثراء الجينوم الكامل والكشف عن 89 هدفًا فيروسيًا منفصلاً وتوصيفها، بما في ذلك: فيروس SARS-CoV-2، وفيروسات الإنفلونزا، وفيروس الأنف، وفيروسات نظير الإنفلونزا، والفيروس المعوي، وغيرها.

توفر لوحة QIAseq xHYB Viral STI إثراءً عالي الجودة ومستهدفًا، وكشفًا وتوصيفًا لفيروس التهاب الكبد B، وفيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1، و19 نوعًا من فيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة، بما في ذلك النوعين 16 و18.

توفر لوحة QIAseq xHYB AMR الإثراء المستهدف والتسلسل والكشف عن أكثر من 2780 جينًا فريدًا لمقاومة المضادات الحيوية (أكثر من 6200 علامة لمقاومة المضادات الحيوية).

توفر لوحة QIAseq xHYB Adventitious Agent Panel إثراءً مستهدفًا للكشف عن 132 هدفًا فيروسيًا منفصلاً، بما في ذلك: الفيروس الغدي البشري، وفيروس نوروفيروس، وفيروس الروتا، وفيروسات الإنفلونزا، وفيروس SARS-CoV-2، وفيروس الورم الحليمي البشري، وفيروس إبشتاين-بار، وفيروس نقص المناعة البشرية، وفيروس زيكا، وفيروسات التهاب الكبد، وغيرها.

تُثري لوحة QIAseq xHYB HepC الجينوم الكامل لجميع الأنماط الجينية لفيروس التهاب الكبد الوبائي سي، مما يسمح بتوصيف دقيق للتنوع الفيروسي الكامل. ويمكن دمج لوحة QIAseq xHYB HepC مع أي لوحة أخرى من لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية.

توفر لوحة QIAseq xHYB MPXV إثراءً مُستهدفًا لجينوم فيروس جدري الماء (MPXV) بأكمله، بما في ذلك التكرارات الطرفية المتداخلة (ITRs). وتعمل لوحة MPXV مع جميع السلالات المعروفة من فيروس جدري الماء. ويمكن دمج لوحة QIAseq xHYB MPXV مع أي لوحة أخرى من لوحات QIAseq xHYB للفيروسات والبكتيريا.

ألا تجد الهدف الذي تبحث عنه؟ أنشئ لوحة ميكروبية مخصصة من QIAseq xHYB على منصة GeneGlobe لاستهداف أي نوع من الميكروبات. يمكن استخدام اللوحات المخصصة بشكل منفرد، أو دمجها مع أي لوحة أخرى من لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية.

أداء

حل عالي الجودة في صندوق واحد

تأتي جميع لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية مزودةً بكافة المواد اللازمة لتخليق الحمض النووي التكميلي (cDNA) وإثراء جميع الأهداف. عند استخدامها مع مجموعة QIAseq FX DNA Library UDI، يمكنك إنشاء مكتبات جاهزة للتسلسل متوافقة مع منصات Illumina. تأتي مجموعات QIAseq xHYB Hyb&Lib مزودةً بجميع الكواشف اللازمة لتحضير المكتبة والتقاط الهجين لعينتك الميكروبية.

تصميم مسبار مبتكر

تُعزز تقنية التهجين الالتقاطي تسلسل الحمض النووي المستهدف مع السماح بتجاوز حالات عدم التطابق التي قد تحدث في السلالات غير الموثقة أو الناشئة. كما تُمكّن هذه التقنية من استهداف مجموعة من الجينومات الفيروسية أو الجينات البكتيرية بكفاءة عالية، إذ يُمكن زيادة عدد المجسات بطريقة فعّالة من حيث التكلفة.

تعدد الإرسال

تتيح لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية إمكانية إجراء تحليل متعدد عالي المستوى على أجهزة التسلسل عالية الإنتاجية، مع توفر ما يصل إلى 384 معرّفًا فريدًا للأجهزة (UDI). ويمكن دمج أي لوحتين من لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية ضمن سير عمل واحد.

تحليل البيانات

عند استخدام هذه اللوحات مع بوابة التحليل على منصة GeneGlobe أو برنامج QIAGEN CLC Genomics Workbench، فإنها توفر بيانات قابلة للتحليل السريع. يمكن استخدام بيانات التسلسل لتحديد المتغيرات عبر عينات مختلفة، بالإضافة إلى مقارنتها مع جينومات متعددة - بدءًا من الجينومات المرجعية المتفق عليها وصولًا إلى العديد من الجينومات التي تم تحميلها من جميع أنحاء العالم. يُقدم التحليل عبر GeneGlobe مع شراء أي لوحة QIAseq xHYB للفيروسات أو البكتيريا.

مبدأ

تتميز الجينومات والجينات الميكروبية بتنوعها الكبير، وينطبق هذا بشكل خاص على الجينومات الفيروسية. تُظهر الجينومات الفيروسية تنوعًا كبيرًا في الشكل والحجم والتنظيم الجينومي، إذ يمكن أن تتكون من الحمض النووي DNA أو الحمض النووي RNA، وفي حالة الفيروسات القهقرية، من كليهما. إضافةً إلى ذلك، يمكن لبعض الفيروسات أن توجد كجزيء منفصل عن الجينوم أو أن تندمج في جينوم العائل. يتراوح حجم جينومات مسببات الأمراض الفيروسية البشرية من بضعة آلاف إلى عدة مئات الآلاف من القواعد. كما يمكن أن تكون منظمة في جزيء واحد من الحمض النووي DNA أو RNA، أو أن تكون مجزأة إلى عدة جزيئات كما هو الحال في فيروسات الإنفلونزا، التي تحتوي على ثمانية أجزاء من الحمض النووي RNA أحادي السلسلة.

إلى جانب الجينومات الفيروسية، تتسم جينات مقاومة المضادات الحيوية البكتيرية بتنوع كبير، مما يعكس العدد الهائل من فئات المضادات الحيوية وآليات المقاومة المستخدمة. ورغم قدرة التسلسل العميق على كشف بصمات المضادات الحيوية، إلا أنه يفتقر إلى حساسية أساليب التسلسل الموجه.

لمعالجة تحديات تسلسل الجينات والجينومات الميكروبية، طُوّرت لوحات الالتقاط الهجينة لإنتاج مكتبات ميكروبية عالية الجودة. تُستخدم هذه اللوحات مع مكتبات مُولّدة بعد تحويل الحمض النووي الريبوزي (RNA) إلى حمض نووي تكميلي مزدوج السلاسل (cDNA)، ثم تضخيمها وفهرستها باستخدام مجموعة QIAseq FX DNA Library Kit المزودة بمعرفات فريدة (UDIs). يُثري الالتقاط الهجين التسلسل المستهدف مع السماح بتسامح مع حالات عدم التطابق التي قد تحدث في السلالات غير المُصنّفة أو الناشئة. إضافةً إلى ذلك، يُتيح الالتقاط الهجين استهدافًا فعالًا لمجموعة من الجينومات الفيروسية أو الجينات البكتيرية، نظرًا لإمكانية زيادة عدد المجسات بطريقة اقتصادية.

إجراء

تتوافق لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية مع سير عمل الحمض النووي الريبي (RNA) والحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) والحمض النووي الكلي (TNA). عند البدء بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA)، يمكن البدء بإنشاء المكتبة باستخدام مجموعة أدوات QIAseq FX DNA Library Kit.

تحويل الحمض النووي الريبي (RNA) إلى الحمض النووي التكميلي (cDNA) مزدوج السلسلة

عند البدء باستخدام الحمض النووي الريبوزي (RNA) أو الحمض النووي الكلي (TNA)، تبدأ عملية عمل لوحة QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية بتحويل الحمض النووي الريبوزي الكلي في العينة إلى حمض نووي تكميلي (cDNA). ثم يُحوّل ناتج النسخ العكسي إلى حمض نووي تكميلي مزدوج السلاسل، والذي يُستخدم بعد ذلك كمدخل لبناء مكتبة الحمض النووي QIAseq FX بعد تنظيفها باستخدام خرز QIAseq.

بناء مكتبة الحمض النووي QIAseq FX

يُحوّل منتج الحمض النووي التكميلي (cDNA) المنقى إلى مكتبات تسلسل الجيل التالي (NGS) المتوافقة مع Illumina باستخدام مجموعة QIAseq FX DNA Library Kit. كما تُنتج هذه المجموعة مكتبات من الحمض النووي الجينومي إذا احتوت العينة عليه (سواءً كان حمضًا نوويًا كليًا أو حمضًا نوويًا جينوميًا معزولًا). تُقطع منتجات الحمض النووي المزدوجة السلاسل المنقاة إنزيميًا، ويُصلح طرف الحمض النووي المجزأ، ويُضاف حرف "A" إلى الطرف 3'. يصبح المنتج جاهزًا لربط المحولات، حيث تُربط محولات خاصة بمنصة Illumina بكلا طرفي شظايا الحمض النووي. تحتوي هذه المحولات على التسلسلات اللازمة لتمكين المكتبات من الارتباط بخلية التدفق لإجراء التسلسل. بعد ربط المحولات، تُنقى المكتبات باستخدام خرز QIAseq، الذي يُزيل أي محولات حرة. ثم تُضخّم المكتبات للحصول على كميات كافية تُستخدم في تفاعل الالتقاط الهجين.

التقاط هجين

بعد إنشاء مكتبات ما قبل الالتقاط، تُهجّن هذه المكتبات مع مجسات QIAseq xHYB. بعد تهجين ليلي، تُربط الهجائن بين المجس والهدف بخرزات مغناطيسية مغلفة بالستربتافيدين، ثم تُغسل لإزالة أي شظايا غير مرتبطة من المكتبة. بعد ذلك، تُضخّم المكتبات المُثرية وتُجهز للتسلسل على أنظمة Illumina.

تحليل

يمكن تحليل نتائج FASTQ عبر بوابة التحليل على منصة GeneGlobe أو عبر برنامج QIAGEN CLC Genomics Workbench. يُتاح التحليل عبر GeneGlobe مع لوحات QIAseq xHYB للفيروسات والبكتيريا، حيث يوفر نظرة عامة مبسطة على نتائج التسلسل لتحديد وقياس أنواع الفيروسات أو جينات مقاومة المضادات الحيوية المكتشفة في أي عينة. كما يتوفر برنامج CLC Genomic Workbench لإجراء تحليل أكثر تعمقًا لتحديد التصنيف، وتحليل المتغيرات، والأشجار التطورية، ومواقع اندماج الفيروسات.

التطبيقات

- الكشف عن المتغيرات
- المراقبة البيئية والسكانية
- التوصيف التصنيفي الفيروسي
- تحديد مسببات الأمراض

تتيح لوحات QIAseq xHYB الفيروسية والبكتيرية الكشف عن الفيروسات والأهداف المقاومة للمضادات الحيوية، وتسلسلها، وتوصيفها. وستُمكّن هذه المكتبات عالية الجودة مما يلي: