Qiagen، 334852، QIAseq Multimodal DNA/RNA UDI (24)

يحتوي QIAseq Multimodal DNA/RNA UDI (24) على الكواشف ومؤشرات الحمض النووي/الحمض النووي الريبي اللازمة لمعالجة 24 عينة لتسلسل WG/WT - ما مجموعه 48 تفاعلًا (24 مجموعة من DNA UDIs، 24 مجموعة من RNA UDIs).

سمات

- تحضير مكتبات التسلسل الجينومي الكامل (WGS) والتسلسل الجينومي الكامل (WTS) بشكل متزامن من عينة واحدة (متوافقة مع أنواع مختلفة)
- دمج وحدات تعريف جزيئية فريدة (UMIs) لمكتبات الحمض النووي (DNA) والحمض النووي الريبي (RNA) لتعزيز الحساسية
- متوافق مع إثراء الهدف القائم على الالتقاط الهجين في المراحل اللاحقة
- تقنية QIAseq FastSelect المدمجة لإزالة الحمض النووي الريبوزي المتداخل (HMR) لتحسين الأداء
- سير عمل ليوم واحد من العينات إلى مكتبات التسلسل

تفاصيل المنتج

تتيح مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit إنشاء مكتبات تسلسل الجينوم الكامل (WGS) ومكتبات تسلسل النسخ الكامل (WTS) إما من إجمالي الأحماض النووية أو من الحمض النووي DNA والحمض النووي RNA المعزولين بشكل منفصل. يتم وسم كل جزيء بفهرس جزيئي فريد (UMI)، مما يعزز دقة بيانات التسلسل. تُعد هذه المجموعة مثالية للكشف الحساس عن المؤشرات الحيوية للحمض النووي DNA والحمض النووي RNA، مثل متغيرات النوكليوتيدات المفردة (SNVs)، وعمليات الإدخال والحذف (InDels)، وتغيرات عدد النسخ (CNVs)، والاندماجات، وأحداث تخطي الإكسونات، ومستويات التعبير الجيني. وهي مناسبة تمامًا للدراسات التي تشمل الخلايا والأنسجة (الطازجة والمجمدة والمثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين) والسوائل الحيوية في مختلف المجالات، مثل أبحاث السرطان والوراثة. تُمكّن هذه المجموعة من إجراء دراسات متعددة الأوميات باستخدام طرائق مختلفة لفهم شامل للبيولوجيا الجزيئية للتغيرات الجينية، مما يؤدي إلى رؤى أعمق وأوسع.

أداء

يُمكّن من تحضير مكتبات الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA من إجمالي الأحماض النووية من خلال سير عمل يستغرق يومًا واحدًا ومرونة عالية

صُممت مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit لتوفير مرونة عالية، حيث تُمكّن من إنشاء مكتبات الحمض النووي (DNA) والحمض النووي الريبوزي (RNA) من عينة واحدة (مزيج من الحمض النووي والحمض النووي الريبوزي) في غضون 6 ساعات. ويمكن تسلسل مكتبات الحمض النووي والحمض النووي الريبوزي المُنشأة مباشرةً أو إخضاعها لإثراء الهدف عن طريق الالتقاط الهجين، مثل لوحات تحليل الإكسوم ولوحات التنميط الجينومي الشامل (CGP)، مما يجعلها مناسبة لمجموعة واسعة من التطبيقات (انظر "سير عمل مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit").

يمكن استخدام هذه المجموعة أيضًا في عمليات تحليل الحمض النووي (DNA) فقط أو الحمض النووي الريبوزي (RNA) فقط، مع نطاق واسع من المدخلات لأنواع مختلفة من العينات. كما أن الاستخدام الاختياري لعلامات UMI على مكتبة الحمض النووي يجعلها مناسبة لتسلسل الجينوم الكامل (WGS) وتسلسل الإكسوم الكامل (WES)، بالإضافة إلى عمليات إثراء الأهداف الأخرى التي تتطلب حساسية أعلى (انظر "مجموعة مكتبة QIAseq متعددة الأنماط للحمض النووي/الحمض النووي الريبوزي توفر مرونة للعديد من التطبيقات اللاحقة").

تُظهر مكتبات الحمض النووي التي تم إنشاؤها باستخدام مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit تعقيدًا عاليًا للمكتبة وتغطية موحدة

على غرار مجموعة QIAseq FX DNA Library Kit، تُنتج مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit مكتبات الحمض النووي مع أدنى حد من التحيز في محتوى GC باستخدام إنزيمات مستقلة عن التسلسل للتجزئة. ولم يؤثر وجود الحمض النووي الريبي (RNA) في العينة الأولية على الأداء العام.

أظهرت مكتبات الحمض النووي الريبوزي (RNA) التي تم إنشاؤها باستخدام مجموعة أدوات QIAseq Multimodal DNA/RNA Library أداءً عاليًا في تحليلات النسخ الكاملة.

يُعد استخدام مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR فعالاً للغاية، حيث لا يتبقى سوى آثار ضئيلة من الحمض النووي الريبوزي (rRNA)، مما يجعل مكتبات الحمض النووي الريبوزي (RNA) مناسبة لتسلسل الحمض النووي الكامل (WTS) ويحسّن من دقة إثراء الهدف باستخدام تقنية التهجين (انظر "أداء مكتبة WTS المُنشأة باستخدام مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit"). تُعدّ مكتبات الحمض النووي الريبوزي (RNA) المُنشأة باستخدام مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit مناسبة لتحليل النسخ الكامل، بما في ذلك تحليل التعبير الجيني، بالإضافة إلى الكشف عن الاندماجات الجينية.

توافق واسع مع مختلف لوحات الالتقاط الهجينة، مما يحافظ على الأداء الموثوق.

يمكن إخضاع مكتبات الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبوزي RNA لإثراء الهدف باستخدام تقنية التهجين، وهي متوافقة مع لوحات QIAseq xHYB البشرية، بالإضافة إلى لوحات من مزودين آخرين (انظر "أداء تسلسل الإكسوم الكامل للمكتبات المُنشأة باستخدام مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit"). ويمكن استخدامها للكشف عن عمليات إعادة الترتيب الجينومي الكبيرة، والطفرات النقطية المفردة (SNVs)، وعمليات الإدخال والحذف (InDels)، وتغيرات عدد النسخ (CNVs).

يسمح بالكشف عن عمليات الاندماج بعد إثراء الهدف باستخدام تقنية الالتقاط الهجين

يمكن استخدام مكتبات الحمض النووي الريبي التي تم إنشاؤها للكشف عن جينات الاندماج المعبر عنها وأحداث تخطي الإكسون (انظر "إثراء الهدف لمكتبات WTS باستخدام لوحة التقاط الهجين البشري QIAseq xHYB").

تُظهر قليل النوكليوتيدات الحاجبة لتقنية QIAseq خصوصية أعلى مقارنةً بقليل النوكليوتيدات الحاجبة الأخرى.

يمكن استخدام أوليغومرات الحجب QIAseq خلال عملية الالتقاط الهجين على المكتبات التي تتضمن تسلسلات محول TruSeq (أوليغومرات الحجب One-4-All) أو على المكتبات التي تتضمن تسلسلات محول Nextera (أوليغومرات الحجب QIAseq N). وتتميز هذه الأوليغومرات بنوعية أعلى من تلك التي يتم الحصول عليها باستخدام أوليغومرات الحجب من موردين آخرين (انظر "أوليغومرات الحجب QIAseq تُظهر نوعية أعلى مقارنةً بأوليغومرات الحجب الأخرى").

هل لديك أسئلة؟ تواصل معنا

مبدأ

تتزايد شعبية الدراسات متعددة الأوميات في الأوساط العلمية نظرًا لما توفره من رؤى أعمق بفضل دمج المعلومات من مختلف الوسائط. وتعاني الطرق الحالية لتحليل الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA في آنٍ واحد من بعض القيود، منها الحاجة إلى كميات كبيرة من عينات الإدخال لإجراء عمليات تحليل منفصلة لكل منهما، وإجراءات تحضير المكتبات التي تتطلب جهدًا كبيرًا، وطول مدة إنجاز التحليل، وغيرها.

صُممت مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit لتوفير مرونة استثنائية. يمكن استخدامها لإنشاء مكتبات DNA فقط أو RNA فقط، مما يُمكّن المختبرات من تبسيط سير عملها من خلال تقليل تحضير مكتبات WGS وWTS إلى مجموعة واحدة، مع توافقها مع مجموعة واسعة من عينات الإدخال، مثل الأنسجة (الطازجة والمجمدة والمثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين)، والدم، وcfDNA. علاوة على ذلك، بالنسبة لمكتبات DNA، يُعد استخدام UMI اختياريًا (تتضمن المجموعة محولات UMI وغير UMI؛ وهذا الخيار مُدمج في سير العمل). يتيح خيار محول UMI حساسية أعلى، وهو أمر ضروري لتطبيقات مُحددة.

لإنشاء مكتبة الحمض النووي الريبوزي (RNA)، تستخدم المجموعة معرّفات جزيئية فريدة (UMIs) لتصحيح الأخطاء، وتتضمن مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR لاستنفاد الحمض النووي الريبوزي (rRNA) وتمكين التوافق مع كميات الإدخال المنخفضة، كما تتضمن خطوة لإزالة أي حمض نووي متبقٍ قبل بدء عملية النسخ العكسي. تضمن هذه الطريقة نتائج عالية الجودة وموثوقة، مما يدعم دراسات متعددة الأوميات أكثر فعالية.

إجراء

- لا يحتوي المحول غير المزود بـ UMI على UMI
- يتضمن محول UMI تسلسل UMI عشوائي بالكامل مكون من 14 قاعدة، كما أنه مُجهز بشكل إضافي لتحقيق التنوع الأمثل للقواعد أثناء التسلسل.

نظرة عامة على سير عمل مجموعة أدوات مكتبة الحمض النووي/الرنا متعددة الأنماط QIAseq

تفتت الأحماض النووية

في مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit، تخضع جزيئات الحمض النووي الريبوزي (RNA) للتفتيت الحراري، بينما تُعالج جزيئات الحمض النووي (DNA) من خلال التفتيت الأنزيمي، وإصلاح الأطراف، وإضافة ذيل الأدينين (A) ضمن تفاعل إنزيمي متعدد واحد. تتضمن هذه الخطوة أيضًا إزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) باستخدام مجموعة QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit.

إضافة ذيل عديد الأدينين إلى الحمض النووي الريبي

بالنسبة لعينات الحمض النووي الريبي (RNA)، يتم إجراء عملية إضافة ذيل عديد الأدينين الاصطناعية لإنشاء موقع ارتباط ضروري لخطوة النسخ العكسي اللاحقة.

ربط الحمض النووي

بالنسبة للحمض النووي، يتم ربط المحولات بقطع الحمض النووي. يتوفر خياران للمحولات.

في عملية التهجين، يُنصح باستخدام أوليغومرات الحجب One-4-All (متوفرة بشكل منفصل أو ضمن مجموعة كواشف QIAseq xHYB Human) لحجب تسلسلات محولات TruSeq بكفاءة. تتوافق هذه المكتبات مع QIAseq Human Exome وQIAseq xHyb Human catalog واللوحات المخصصة أو مجسات الجهات الخارجية.

النسخ العكسي وتبديل القوالب

تُجرى عملية النسخ العكسي وتبديل القالب، خاصةً فيما يتعلق بالحمض النووي الريبوزي (RNA). وتُدمج في هذه الخطوة تسلسلات عشوائية مكونة من 10 قواعد (UMIs). عند استخدام تقنية الالتقاط الهجين لمكتبات الحمض النووي الريبوزي (RNA)، والتي تستخدم تسلسلات محولات Nextera، يُنصح باستخدام أوليغومرات QIAseq N Blocking Oligos (تُباع منفصلةً وليست ضمن مجموعة كواشف QIAseq xHYB Human Reagent Kit) لحجب المحولات بفعالية.

توسيع المكتبة/فهرستها

يتم إجراء تفاعلات PCR عالمية منفصلة على مكتبات الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA لدمج مؤشرات مزدوجة فريدة (UDI) لكل مكتبة، مما يضمن تحديد العينة بدقة ويقلل من خطر التلوث المتبادل.

هل لديك أسئلة؟ تواصل معنا

التطبيقات

- الحمض النووي: SNVs، InDels، CNVs
- الحمض النووي الريبي: التعبير الجيني التفاضلي، والاندماجات، وأحداث تخطي الإكسون.

يمكن استخدام مجموعة QIAseq Multimodal DNA/RNA Library Kit لإجراء دراسات تسلسل متعددة الأوميات من عينة واحدة، بما في ذلك تسلسل الجينوم الكامل (WGS/WTS) وتقنيات الإثراء المستهدفة القائمة على الالتقاط الهجين، مثل تسلسل الإكسوم الكامل (WES) أو تسلسل الجينوم الكامل المقارن (CGP). تشمل المتغيرات من الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبوزي RNA ما يلي: