Qiagen، 335925، مجموعة QIAseq FastSelect –5S/16S/23S (24)

تتضمن المجموعة 3 أنابيب من كاشف إزالة الحمض النووي الريبوزي QIAseq FastSelect –5S/16S/23S، ومحلول التفاعل، وخرزات QIAseq مع محلول ربط خرزات QIAseq، وماء خالٍ من النيوكلياز يكفي لـ 24 عينة

سمات

- إزالة الحمض النووي الريبوزي 5S/16S/23S من الحمض النووي الريبوزي المجزأ أو كامل الطول لدراسات الميتا-ترانسكريبتومية
- آلية جديدة لإزالة الحمض النووي الريبي لا تتضمن التقاط الهجين أو الهضم الأنزيمي
- يمكن دمجه مع تقنية QIAseq FastSelect –rRNA HMR لإزالة الحمض النووي الريبوزي من عينات الإنسان والفأر والجرذ لدراسات التفاعل بين المضيف والميكروب
- متوافق مع مجموعات تحضير مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الموجهة من QIAGEN و Illumina و NEB و KAPA
- تصميم حاسوبي يتوقع حجب أكثر من 95% من جميع تسلسلات قواعد بيانات الحمض النووي الريبوزي 5S و16S و23S.

تفاصيل المنتج

تستخدم مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S طريقة مبتكرة لإزالة الحمض النووي الريبوزي البكتيري 5S/16S/23S عالي الوفرة من مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). صُممت هذه المجموعات خصيصًا لعينات الميكروبات المعقدة من التربة والماء والبراز والحمأة، والتي تحتوي على تجمعات بكتيرية عديدة ومتنوعة. تعتمد تغطية الحمض النووي الريبوزي التي توفرها هذه المجموعة على تسلسلات SILVA 16S (ما يقارب 600,000 مدخل)، وتسلسلات SILVA 23S (ما يقارب 170,000 مدخل)، وتسلسلات قاعدة بيانات الحمض النووي الريبوزي 5S (أكثر من 7200 مدخل). وتُظهر النمذجة الحاسوبية تغطيةً لأكثر من 95% من جميع تسلسلات الحمض النووي الريبوزي 5S و16S و23S المعروفة.

تم اختبار QIAseq FastSelect –5S/16S/23S مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) من QIAGEN وIllumina وNEB، وهو متوافق مع جميع الطرق الرئيسية لتحضير مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي. يتكامل البروتوكول البسيط الذي يستغرق 14 دقيقة وتنظيف الخرز بسلاسة مع جميع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الشائعة، ويمكن استخدامه على الحمض النووي الريبوزي المجزأ أو كامل الطول (غير المجزأ).

لإزالة الحمض النووي الريبوزي البشري والفأر والجرذ والثدييات الأخرى، يرجى الاطلاع على مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA HMR الخاصة بنا.

كما يمكنكم الاطلاع على مجموعات مكتبات QIAseq Stranded RNA الخاصة بنا لإعداد مكتبات RNA-seq قوية.

صمم مجموعات QIAseq FastSelect المخصصة الخاصة بك لإزالة أي RNA ترغب فيه من مكتبة RNA-seq الخاصة بك - ألق نظرة على مجموعات إزالة RNA المخصصة QIAseq FastSelect الخاصة بنا.

هل ترغب بتجربة هذا الحل لأول مرة؟ اطلب مجموعة تجريبية لتقييمه.

أداء

وفقًا لنظام إدارة الجودة المعتمد من قبل شركة QIAGEN ISO، يتم اختبار كل دفعة من مجموعة QIAseq FastSelect –5S/16S/23S وفقًا لمواصفات محددة مسبقًا لضمان جودة المنتج المتسقة.

توفر مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S إزالة فعّالة للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من أنواع مختلفة من العينات. انظر الأشكال: QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: إزالة فعّالة للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من عينة مجتمع الأمعاء. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: إزالة فعّالة للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من مجتمع بكتيري (28 سلالة). QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: إزالة فعّالة للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من مجتمع بكتيري: تحليل التخطيط (28 سلالة).

توفر مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S إزالة فعّالة وقابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA). انظر الأشكال: QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: إزالة قوية وقابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من ميكروبيوم الأمعاء. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: إزالة قوية وقابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من ميكروبيوم الأمعاء: نتائج التعبير الجيني. إزالة قابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من بكتيريا الإشريكية القولونية K12 باستخدام QIAseq FastSelect –5S/16S/23S. إزالة قابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من بكتيريا الإشريكية القولونية K12 باستخدام QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: نتائج التعبير الجيني. إزالة قابلة للتكرار للحمض النووي الريبوزي (rRNA) من بكتيريا الإشريكية القولونية K12 باستخدام QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: نتائج التعبير الجيني (100 نانوغرام، 1 ميكروغرام).

أظهرت مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S كفاءة عالية في إزالة الحمض النووي الريبوزي (rRNA) وأداءً متفوقًا مقارنةً بالطرق البديلة. انظر الأشكال: مقارنة بين QIAseq FastSelect –5S/16S/23S والطرق الأخرى: إزالة الحمض النووي الريبوزي (rRNA)، مقارنة بين QIAseq FastSelect –5S/16S/23S والطرق الأخرى: قراءات التسلسل، مقارنة بين QIAseq FastSelect –5S/16S/23S والطرق الأخرى: إجمالي القراءات المُرتبطة بالحمض النووي الريبوزي (rRNA).

تتوافق مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S مع مجموعة واسعة من مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq). انظر الأشكال: تتوافق مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S مع مجموعة واسعة من مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq)، بما في ذلك QIAGEN وIllumina وNEB. كما تتوافق مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S مع مجموعة واسعة من مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq)، بما في ذلك QIAGEN وIllumina وNEB: الكشف عن الجينات. وتتوافق مجموعات QIAseq FastSelect –5S/16S/23S مع مجموعة واسعة من مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq)، بما في ذلك QIAGEN وIllumina وNEB: التعبير الجيني.

مبدأ

بعد استخلاص الحمض النووي الريبوزي البكتيري، تُستخدم مجموعة QIAseq FastSelect –5S/16S/23S لإزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) من جميع أنواع البكتيريا، وهي مصممة لإزالة 5S و16S و23S rRNA من عينات مجتمعات بكتيرية معقدة. صُمم كاشف إزالة الحمض النووي الريبوزي الريبوسومي الشامل لدينا باستخدام تسلسلات 16S (ما يقارب 600,000 مدخل)، و23S (ما يقارب 170,000 مدخل)، و5S rRNA (أكثر من 7200 مدخل). تتوقع النمذجة الحاسوبية إزالة أكثر من 95% من جميع تسلسلات 5S و16S و23S rRNA المعروفة.

يُمكن لجهاز QIAseq FastSelect –5S/16S/23S استيعاب كميات من الحمض النووي الريبوزي (RNA) تتراوح من 20 نانوغرام إلى 1 ميكروغرام، مع أداء عالٍ وثابت، وهو متوافق مع الحمض النووي الريبوزي (RNA) منخفض الجودة، أو عالي التجزئة، أو كامل الطول عالي الجودة. ولأن جهاز QIAseq FastSelect –5S/16S/23S لا يستخدم الهضم الأنزيمي أو تقنيات الالتقاط الهجين، فإن سير العمل السريع والبسيط يُؤدي إلى إزالة موثوقة للحمض النووي الريبوزي الريبوسومي (rRNA) وقابلية عالية للتكرار في التطبيقات اللاحقة.

إجراء

تعتمد معظم استراتيجيات إزالة أو استنفاد الحمض النووي الريبوزي (RNA) المرتبطة ببناء مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) على معالجة العينات مسبقًا، بما في ذلك التقاط الحمض النووي الريبوزي غير المرغوب فيه باستخدام التهجين أو الإزالة الأنزيمية. يتميز إجراء QIAseq FastSelect الفريد لدينا بسرعة فائقة، وهو متوافق مع معظم مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي. وقد تم اختبار QIAGEN FastSelect –5S/16S/23S مع مجموعات مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي الموجهة من QIAGEN وIllumina وNEB.

يتكامل نظام QIAseq FastSelect –5S/16S/23S بسلاسة مع عملية تحضير مكتبة تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) الحالية، حيث يوفر إزالة الحمض النووي الريبوزي في خطوة واحدة مدتها 14 دقيقة، تليها عملية تنظيف الخرز (انظر الشكل: سير عمل QIAseq FastSelect –5S/16S/23S). قبل تجزئة الحمض النووي الريبوزي بالحرارة (وهي عملية اختيارية وتعتمد على مجموعة تحضير المكتبة ونوع العينة)، يُخلط كاشف إزالة QIAseq FastSelect –5S/16S/23S مباشرةً مع الحمض النووي الريبوزي الكلي ومحلول التجزئة. بعد التجزئة الاختيارية، تُخفض درجة حرارة التفاعل تدريجيًا من 75 درجة مئوية إلى 25 درجة مئوية على مدار 14 دقيقة، ثم تُجرى عملية تنظيف الخرز. يصبح الحمض النووي الريبوزي جاهزًا بعد ذلك لعملية النسخ العكسي. هذا أسرع بشكل كبير من طرق استنفاد الحمض النووي الريبي الأخرى، والتي تتطلب أكثر من 25 خطوة وساعتين تقريبًا لإكمالها (الشكل استنفاد الحمض النووي الريبي البكتيري: المنتجات البديلة مقابل QIAseq Fast Select –5S/16S/23S).

التطبيقات

يوفر QIAseq FastSelect –5S/16S/23S إزالة سريعة وموثوقة للحمض النووي الريبوزي للعزلات البكتيرية، بالإضافة إلى المجتمعات البكتيرية المعقدة.