كياجين، 47119، مجموعة MagAttract PowerSoilPro DNA EP (384)

مواد عازلة، ومواد بلاستيكية لتشغيل تقنية PowerSoil Pro على جهاز epMotion.

سمات

- عزل الحمض النووي عالي الجودة من التربة الصعبة والبراز وعينات بيئية أخرى
- تحسين الإنتاجية بفضل ألواح وأنابيب PowerBead Pro الأكثر كفاءة وكيمياء التحلل
- تحسين إزالة المثبطات لزيادة نقاء الحمض النووي
- دقة أكبر في تمثيل الميكروبيوم في المراحل اللاحقة
- اختر بين نظام التشغيل الآلي المفضل لديك: KingFisher Flex أو epMotion

تفاصيل المنتج

تتضمن مجموعات MagAttract PowerSoil Pro DNA لأجهزة KingFisher وepMotion طرقًا مبتكرة وحصرية لعزل الحمض النووي الجينومي الميكروبي من عينات البيئة والبراز. ويمكن معالجة العينات البيئية الصعبة، مثل السماد العضوي والرواسب والسماد الحيواني، بالإضافة إلى أنواع أخرى من التربة والبراز، بنجاح باستخدام هذه المجموعات. تجمع هذه المجموعات بين تقنية إزالة المثبطات من الجيل الثاني (IRT) من QIAGEN وتقنية الخرزات الكيميائية الأكثر كفاءة وكيمياء التحلل. ينتج عن ذلك حمض نووي عالي الجودة يمكن استخدامه فورًا في تطبيقات لاحقة، مثل تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) وتفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي (qPCR) وتسلسل الجيل التالي (16S والجينوم الكامل).

أداء

صُممت مجموعات MagAttract PowerSoil Pro DNA خصيصًا لمنصة Thermo Scientific KingFisher Flex وجهاز Eppendorf epMotion. تتيح هذه المجموعات عزل الحمض النووي (DNA) آليًا وبإنتاجية عالية من ما يصل إلى 384 عينة في أقل من يوم واحد.

مبدأ

تُعدّ مجموعة MagAttract PowerSoil Pro DNA Kit فعّالة في إزالة مثبطات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) من عينات التربة والبراز، حتى من أصعب الأنواع. تُضاف العينات البيئية أو البشرية إلى صفيحة خرزية ذات 96 بئرًا أو أنابيب خرزية لتجانس سريع وشامل. يتم تحلل الخلايا باستخدام مزيج من الطرق الميكانيكية والكيميائية. تُزال الأحماض الدبالية باستخدام تقنية IRT. تُنقل المستخلصات المُحضّرة إلى منصتي KingFisher Flex و epMotion حيث يُلتقط الحمض النووي الجينومي الكلي على خرز مغناطيسي متخصص بوجود محاليل منظمة. يُغسل الحمض النووي على الخرز ثم يُستخلص، ليصبح جاهزًا لتقنيات التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS) وتفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) وغيرها من التطبيقات اللاحقة.

أظهرت مجموعتا MagAttract PowerSoil Pro DNA تحسناً ملحوظاً في الأداء مقارنةً بالمجموعات السابقة والمنافسة (انظر "جودة الحمض النووي الأفضل مع مجموعات Pro"). لمزيد من المعلومات حول أداء المجموعتين، يُرجى الرجوع إلى ملف تعريف المنتج التفاعلي.

إجراء

المواد الأولية

صُممت هذه المجموعات في الأساس لاستخلاص الحمض النووي الجينومي للميكروبات من مواد معقدة، مثل التربة أو البراز. عادةً ما تحتوي هذه العينات على كميات كبيرة من المثبطات التي تتداخل مع التفاعلات الإنزيمية اللاحقة، بالإضافة إلى مركبات قادرة على تحليل الحمض النووي. صُممت مجموعات MagAttract PowerSoil Pro DNA خصيصًا لإزالة هذه الملوثات أو المثبطات، فضلًا عن البروتينات أو النيوكليازات الأخرى من عيناتك.

الكمية الموصى بها لبدء تحليل عينات البراز هي 100 ملغ. الحد الأقصى الموصى به هو 200 ملغ؛ أما بالنسبة لعينات البراز المجففة، فيُفضل البدء بكمية لا تتجاوز 100 ملغ. بشكل عام، تُحقق أعلى نسبة استخلاص عند استخدام 50-150 ملغ من البراز، مع العلم أن هذه الكمية تختلف باختلاف المصدر. الكمية الموصى بها لبدء تحليل التربة هي 250 ملغ. الحمض النووي الجينومي الميكروبي المُستخلص باستخدام مجموعات MagAttract PowerSoil Pro DNA جاهز للاستخدام في التفاعلات الإنزيمية، مثل تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) أو التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS)، أو يُمكن تخزينه في درجة حرارة تتراوح بين -30 و -15 درجة مئوية.

دق الخرز

يتطلب تحليل الخلايا الميكروبية في عينة الميكروبيوم استخدام الخرز الدقيق بكفاءة. صُممت مجموعات MagAttract PowerSoil Pro DNA للاستخدام مع ألواح PowerBead Pro (رقم المنتج 19311) أو أنابيب PowerBead Pro (رقم المنتج 19301). قد يؤدي استخدام وسائط تحليل أخرى إلى انخفاض كمية الحمض النووي الجينومي الميكروبي المستخلص. ولتسهيل عملية التجانس عالي الإنتاجية في 96 بئرًا، نوفر جهاز TissueLyser II (رقم المنتج 85300) ومجموعة محولات الألواح (رقم المنتج 11990). يوفر جهاز TissueLyser II، عند استخدامه مع ألواح PowerBead Pro، معالجة عالية الإنتاجية لتحليل ما يصل إلى 2 × 96 عينة في وقت واحد وبسرعة وفعالية في غضون دقائق معدودة.

بالنسبة للتفتيت باستخدام أنابيب PowerBead Pro سعة 2 مل، يوفر جهاز TissueLyser II تفتيتًا متزامنًا لما يصل إلى 48 عينة بالاشتراك مع مجموعة محولات TissueLyser 2 × 24 (رقم الكتالوج 69982) أو ما يصل إلى 96 عينة بالاشتراك مع مجموعة حامل الأنابيب سعة 2 مل (رقم الكتالوج 11993) ومجموعة محولات الألواح.

يمكن أيضًا استخدام جهاز Vortex-Genie® 2 المزود بمحولات Vortex لأنابيب سعة 1.5-2 مل (رقم المنتج 13000-V1-24) للتجنيس مع أنابيب PowerBead Pro. سيتم توضيح ترتيب وضع المكونات والكواشف في الجزء الخاص بالمنصة من البروتوكول في البرنامج المُنزّل والمُخصّص للجهاز المُستخدم.

يمكن استخدام روبوتات أخرى ذات منصات مفتوحة مع هذه المجموعة. مع ذلك، قد تحتاج إلى التواصل مع الشركة المصنعة لروبوتك للحصول على المساعدة في تكييف هذا البروتوكول مع نظامها.