Qiagen، 850103، GeneGlobe Analyze RNA-seq (24)

رصيد تحليلي كافٍ لتحليل وتفسير وتصميم دراسة متابعة لـ 24 عينة من بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) عبر بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) من GeneGlobe. صالح لمدة 12 شهرًا.

سمات

- مسارات تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) الجاهزة للاستخدام والمدعومة بخوارزميات QIAGEN CLC
- متوافق مع معظم مجموعات تحضير المكتبات الشائعة الاستخدام
- استكشاف وتصفية سهلة وبديهية للجينات المتغيرة التعبير في لوحة تحكم تفاعلية سهلة الاستخدام
- دعم التفسير من خلال إضافة تعليقات توضيحية تتضمن أهم المسارات المتأثرة، والمنظمات الأولية، والأمراض، والوظائف المستخلصة من قاعدة معارف تحليل مسارات QIAGEN Ingenuity (IPA).
- دعم اتخاذ القرارات بشأن تجارب التحقق من المؤشرات الحيوية من خلال توصيات المنتجات وأدوات التصميم المخصصة سهلة الاستخدام في مركز تصميم وتحليل جين جلوب من كياجين

تفاصيل المنتج

تجمع حلول GeneGlobe Analyze بين الخوارزميات والمعرفة الرائدة في هذا المجال وسهولة الاستخدام. يمكن الوصول إلى بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) السحابية من خلال GeneGlobe Analyze، وهي تتيح تحليل بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي، بدءًا من محاذاة القراءات الأولية وصولًا إلى تفسير الجينات المتغيرة التعبير، وإيجاد الأدوات المناسبة للتحقق من المؤشرات الحيوية المحتملة.

أداء

- تحليل microRNA: يتطلب 90 دقيقة فقط من ملف fastq إلى التعبير التفاضلي (استنادًا إلى بيانات من QIAseq miRNA Library Kit، 96 عينة مع ~5 مليون قراءة لكل عينة، قراءات أحادية الطرف 75 زوجًا قاعديًا)
- تحليل النسخ الكامل: يتطلب 4 ساعات فقط من ملف fastq إلى التعبير التفاضلي (استنادًا إلى بيانات من مجموعة QIAseq Stranded RNA Library Kit، 96 عينة، 60 مليون قراءة لكل عينة، قراءات مزدوجة النهاية 2 × 75 زوجًا من القواعد)

تعمل بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) من QIAGEN على تقليل وقت التحليل من أيام إلى بضع ساعات فقط:

مبدأ

- استقلالية تامة: تحكم بشكل كامل في مسار تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) واكتشاف المؤشرات الحيوية من خلال خط أنابيب تحليل متكامل تمامًا
- وفر الوقت: سرّع بحثك وقلل وقت التحليل من أيام إلى بضع ساعات فقط
- التركيز على الرؤى: إدارة بياناتك بسهولة، واستكشافها وتصفيتها في لوحة تحكم تفاعلية على الويب، وتحديد المؤشرات الحيوية المحتملة، والعثور على الاختبارات المناسبة للتحقق منها ضمن واجهة واحدة.
- توفير التكاليف المتعلقة بتكنولوجيا المعلومات: تتيح لك مسارات التحليل السحابية توسيع نطاق مشاريعك والوصول إلى قوة الحوسبة للحصول على نتائج جاهزة في غضون ساعات قليلة.

تُفيد بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) من QIAGEN بحثك بطرق عديدة:

تتيح واجهة المشروع سهلة الاستخدام في البوابة تحميل البيانات وإعداد تجارب جديدة في ثلاث خطوات بسيطة فقط (انظر الشكل: نظرة عامة على مشاريع بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي GeneGlobe). بعد المحاذاة، يتم حساب عدد الجينات، وتُستخدم خوارزميات QIAGEN CLC Genomics Workbench لإجراء تحليل التعبير الجيني التفاضلي بناءً على مجموعات التجارب التي يحددها المستخدم.

يتم تقييم مجموعة الجينات المتغيرة التعبير من حيث تأثيرها المحتمل على المسارات البيولوجية الأساسية والأمراض والوظائف، ويتم التنبؤ بالمنظمات الرئيسية التي تحفز التعبير عن هذه الجينات (انظر الشكل: لوحة نتائج تفاعلية). تعرض البوابة الإلكترونية أفضل عشرة جينات من كل نوع من قاعدة بيانات QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA). يلزم الحصول على ترخيص كامل لبرنامج QIAGEN IPA لعرض واستكشاف المجموعة الكاملة من التفسيرات البيولوجية.

تشمل مراقبة العينات والجودة الإعداد والتصميم التجريبي، ونظرة عامة على العينات في التجربة، ومقاييس مراقبة الجودة الشائعة الاستخدام مثل تقليم القراءة وإحصائيات التعيين، وتحليل المكونات الرئيسية وتوزيع النمط الحيوي (انظر الشكل مراقبة الجودة بما في ذلك توزيع النمط الحيوي للحمض النووي الريبي).

تتكامل لوحة نتائج التحليل مباشرةً مع منصة GeneGlobe Design & Analysis Hub من QIAGEN، حيث يُمكن استكشاف الجينات المُعبَّر عنها بشكلٍ تفاضلي وتصفيتها بناءً على قيمة p ونسبة التغير، وحفظها في مساحة "مشاريعي" الشخصية في حساب GeneGlobe الخاص بك. كما تُوصى بالأدوات المناسبة لتجارب التحقق من المؤشرات الحيوية (انظر الشكل: منتجات التحقق من المؤشرات الحيوية في GeneGlobe)، ويُمكن استكشاف الجينات أو جزيئات miRNA المحفوظة ذات الأهمية بشكلٍ أعمق في سياق المسارات والوظائف والمنشورات (انظر الشكل: خرائط المسارات في GeneGlobe).

للحصول على مزيد من المعلومات حول المبدأ والخلفية التقنية، يرجى الرجوع إلى دليل مستخدم بوابة تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq).

التطبيقات

- دعم عينات الإنسان والفأر والجرذ
- محاذاة القراءات الأولية التي تم إنشاؤها بواسطة أجهزة Illumina
- تعداد الجينات وتحليل التعبير الجيني/الميكرو آر إن إيه التفاضلي
- مراقبة جودة العينات لتجربة التعبير التفاضلي
- شرح الجينات/الميكرو آر إن إيه المتغيرة التعبير مع تحديد المسارات العشرة الأكثر تأثراً، والمنظمات الأولية، والأمراض/الوظائف النهائية.

- مجموعة أدوات QIAseq UPX 3' Transcriptome
- مجموعة مكتبة QIAseq miRNA
- مجموعة مكتبة الحمض النووي الريبوزي المجدول QIAseq
- مجموعات QIAseq FastSelect –rRNA HMR

- تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي الكلي الموجه TruSeq (بشري/جرذ، ذهبي، غلوبين)
- تحضير الحمض النووي الريبوزي الكلي المجدول بتقنية Illumina مع Ribo-Zero Plus

- مجموعة تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي الاتجاهية NEBNext Ultra™ II لـ Illumina

- مجموعة KAPA RNA HyperPrep

- مجموعة تحضير عينات الحمض النووي الريبوزي الكلي المجدول من SMARTer - HI Mammalian
- مجموعة تحضير عينات الحمض النووي الريبوزي الكلي المجدول من SMARTer - مدخلات منخفضة من الثدييات

- مجموعة تحضير مكتبة الحمض النووي الريبوزي المجدول من كوليبيري لأنظمة إلومينا

لتحليل بيانات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq)، بما في ذلك:

يدعم أكثر طرق تحضير مكتبات تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq) شيوعًا لأجهزة Illumina:

كياجين:

إلومينا:

مختبرات نيو إنجلاند البيولوجية:

حلول روش للتسلسل الجيني:

نبذة عن تاكارا:

شركة ثيرمو فيشر العلمية: