شركة كياجين، 9002035، منصة روتور-جين كيو إم دي إكس (الولايات المتحدة الأمريكية)

جهاز تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي بست قنوات (لا يُنصح باستخدام القناتين الحمراء وHRM مع اختبارات الأحماض النووية المعتمدة من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية)، وجهاز كمبيوتر محمول، وبرامج، وملحقات، وضمان لمدة عام واحد على قطع الغيار واليد العاملة.

سمات

- فحص معتمد من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية للكشف الموثوق عن طفرة D842V في جين PDGFRA
- نظام جاهز للاستخدام يتميز بسير عمل بسيط ونتائج في اليوم التالي
- تحليل البيانات الآلي باستخدام برنامج Rotor-Gene AssayManager

تفاصيل المنتج

مجموعة therascreen PDGFRA RGQ PCR هي عبارة عن فحص تشخيصي نوعي في الوقت الحقيقي في المختبر للكشف عن الطفرة الجسدية D842V في جين PDGFRA باستخدام الحمض النووي الجينومي المستخرج من أنسجة الورم المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) لمريض مصاب بورم اللحمة المعدية المعوية (GIST).

تهدف مجموعة أدوات تفاعل البوليميراز المتسلسل PDGFRA RGQ من ثيراسكرين إلى مساعدة الأطباء في تحديد المرضى المصابين بأورام الجهاز الهضمي اللحمية (GIST) الذين قد يكونون مؤهلين للعلاج باستخدام AYVAKIT (أفابريتينيب) بناءً على نتيجة الكشف عن طفرة في جين PDGFRA. تُعالج عينات الأورام المثبتة بالفورمالين والمضمنة في البارافين (FFPE) باستخدام مجموعة أدوات QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kit لتحضير العينات يدويًا، وجهاز Rotor-Gene Q MDx (الولايات المتحدة) للتضخيم والكشف الآليين.

أداء

مقياس الاتفاق: التكرارات ونسبة الاتفاق
نسبة الاتفاق الإجمالية: 145/147
نسبة الموافقة الإيجابية: 40/42
نسبة الموافقة السلبية: 105/105

مقياس الاتفاق: التكرارات ونسبة الاتفاق
نسبة الاتفاق الإجمالية: 145/154
نسبة الموافقة الإيجابية: 40/43
نسبة الموافقة السلبية: 105/111

- طفرة D842V في PDGFRA؛
- المرضى الذين تفاقمت حالتهم بعد العلاج بالإيماتينيب ومثبط كيناز واحد على الأقل، والذين لا يُعرف أن لديهم طفرة D842V في PDGFRA؛ أو
- تطورت أو عانت من عدم تحمل إيماتينيب، بما في ذلك في الإعداد المساعد، والذين لم يتلقوا علاجًا إضافيًا بمثبطات الكيناز ولم يكن لديهم طفرة D842V معروفة في PDGFRA.

دراسة سريرية تدعم استخدام AYVAKIT (أفابريتينيب)

تظهر فعالية العلاج باستخدام AYVAKIT (أفابريتينيب) عند التحقق من صحة استخدامه باستخدام مجموعة therascreen PDGFRA RGQ PCR Kit، في البيانات التي تم جمعها في دراسة BLU-285-1101 الخاصة بـ AYVAKIT (أفابريتينيب)، والتي أعيد تحليلها في الدراسة الجسرية.

كانت الدراسة السريرية BLU-285-1101 دراسة مفتوحة التسمية، متعددة المراكز، دولية، من المرحلة الأولى، وهي أول دراسة تُجرى على البشر، لتقييم سلامة وفعالية دواء AYVAKIT (أفابريتينيب) لدى المرضى البالغين المصابين بأورام الجهاز الهضمي اللحمية غير القابلة للاستئصال أو المنتشرة. وتم توسيع نطاق الدراسة لتشمل مرضى مصابين بأورام الجهاز الهضمي اللحمية المتقدمة بناءً على الفعالية الأولية المشجعة التي لوحظت عند زيادة الجرعة. تم تسجيل 237 مريضًا، سواءً أكان لديهم طفرة في جين PDGFRA أم لا، في جميع مراحل الدراسة، وتلقى 204 منهم جرعة واحدة على الأقل من AYVAKIT (أفابريتينيب) إما 300 ملغ أو 400 ملغ مرة واحدة يوميًا (بينما تلقى 33 مريضًا جرعة أقل من 300 ملغ مرة واحدة يوميًا). كانت نقاط النهاية الأولية هي تحديد الجرعة القصوى المسموح بها (MTD) والجرعة الموصى بها للمرحلة الثانية (RP2D) من AYVAKIT (أفابريتينيب)، وتحديد السلامة العامة وقابلية تحمل AYVAKIT (أفابريتينيب)، وتحديد معدل الاستجابة الكلي (ORR) وفقًا لمعايير تقييم الاستجابة المعدلة في الأورام الصلبة (mRECIST) الإصدار 1.1 عند الجرعة القصوى المسموح بها/الجرعة الموصى بها للمرحلة الثانية من AYVAKIT (أفابريتينيب) لدى المرضى المصابين بأورام الجهاز الهضمي اللحمية (GIST):

استند تحليل فعالية AYVAKIT (أفابريتينيب) إلى نقاط النهاية الأولية للفعالية المتمثلة في البقاء على قيد الحياة بشكل عام (OS) في 40 مريضًا قابلًا للتقييم عند قطع قاعدة البيانات.

من بين 31 مريضًا في مجموعة الجرعة الابتدائية 300/400 ملغ، والذين تم تشخيص طفرة PDGFRA D842V لديهم بواسطة فحص QIAGEN CTA، أظهر 29 مريضًا استجابة كاملة (CR) أو استجابة جزئية (PR) مؤكدة بناءً على مراجعة مركزية للأشعة، بنسبة استجابة إجمالية (ORR) بلغت 94% (95% CI: 78.6%، 99.2%). وكانت أفضل استجابة لهؤلاء المرضى الـ 31 هي استجابة كاملة لدى مريضين، واستجابة جزئية لدى 27 مريضًا، واستقرار الحالة لدى مريضين، بنسبة فائدة سريرية (CBR) بلغت 100%. لم يتم الوصول إلى متوسط ​​مدة الاستجابة (DOR) في مجموعة الجرعة 300/400 ملغ؛ حيث تم استبعاد 22 مريضًا (76%) من التحليل عند تاريخ قطع البيانات وفقًا لقواعد إدارة الغذاء والدواء الأمريكية (FDA)، مع تقدير استجابة 64% و51% منهم عند 12 شهرًا و18 شهرًا على التوالي.

حققت دراسة BLU-285-1101 هدفها الرئيسي، حيث أثبتت أن العلاج بدواء AYVAKIT (أفابريتينيب) يُحقق فائدة سريرية ملموسة لمرضى أورام الجهاز الهضمي اللحمية (GIST) الحاملين لطفرة PDGFRA D842V، وذلك وفقًا لمعدل الاستجابة الموضوعية (ORR). وبشكل عام، تُظهر نتائج فعالية وسلامة دراسة BLU-285-1101 أن دواء AYVAKIT (أفابريتينيب) يتمتع بملف فائدة/مخاطر إيجابي، ويُعد علاجًا فعالًا لمرضى أورام الجهاز الهضمي اللحمية (GIST) الحاملين لطفرة PDGFRA D842V.

التوافق بين فحص CDx و CTA (دراسة الربط)

في دراسة BLU-285-1101، تم تحديد حالة طفرة PDGFRA D842V لفحص وتسجيل المرضى عن طريق فحص التجارب السريرية (CTA).

تم تقييم التوافق بين مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل PDGFRA RGQ (CDx) و CTA على الحمض النووي المستخلص من عينات GIST من 154 مريضًا في الدراسة BLU-285-1101.

من بين 154 عينة، أعطت 147 عينة نتيجة صالحة باستخدام مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) الخاصة بـ Therascreen PDGFRA RGQ (للمرضى المؤهلين للتقييم التشخيصي المصاحب). يوضح الجدول 1 بالتفصيل نسب الدقة الإيجابية (PPA) والسلبية (NPA) والفعالة (OPA) المقدرة بين مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) الخاصة بـ Therascreen PDGFRA RGQ والتصوير المقطعي المحوسب للأوعية الدموية (CTA) (مع اعتبار CTA الطريقة المرجعية) للمرضى المؤهلين للتقييم التشخيصي المصاحب. وقد حققت نسبة فعالية (OPA) البالغة 98.64% معايير قبول الدراسة التي تبلغ 80% أو أكثر.

* التصوير المقطعي المحوسب للأوعية الدموية كطريقة مرجعية والمرضى القابلين للتقييم باستخدام التشخيص المصاحب.

† كلوبر-بيرسون (بالضبط) ذو الحدين.

تم إدراج الحالات السبع التي أظهرت نتائج غير صالحة باستخدام مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) الخاصة بـ PDGFRA RGQ من شركة ثيراسكرين كنتائج متضاربة في التحليل الذي شمل جميع المرضى المؤهلين لاختبار التشخيص المصاحب. يوضح الجدول 2 بالتفصيل قيم PPA وNPA وOPA المقدرة بين مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) الخاصة بـ PDGFRA RGQ من شركة ثيراسكرين والتصوير المقطعي المحوسب للأوعية الدموية (CTA) (مع اعتبار التصوير المقطعي المحوسب للأوعية الدموية طريقة مرجعية) لجميع المرضى المؤهلين لاختبار التشخيص المصاحب. وقد حققت نتيجة OPA البالغة 94.16% معايير قبول الدراسة التي تبلغ 80% أو أكثر.

* التصوير المقطعي المحوسب للأوعية الدموية كطريقة مرجعية والمرضى الذين يمكن اختبارهم باستخدام التشخيص المصاحب.

أظهرت مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي PDGFRA RGQ من ثيراسكرين توافقًا إجماليًا بنسبة 98.64% (95% CI: 95.17، 99.83) للمرضى القابلين للتقييم باستخدام التشخيص المصاحب. يوفر العلاج باستخدام AYVAKIT (أفابريتينيب) فائدة سريرية ملموسة للمرضى المصابين بأورام الجهاز الهضمي اللحمية (GIST) الحاملة لطفرة PDGFRA D842V، وذلك وفقًا لمعدل الاستجابة الموضوعية (ORR). بلغ معدل الاستجابة الموضوعية للمرضى الحاملين لطفرة PDGFRA D842V عند استخدام مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي PDGFRA RGQ من ثيراسكرين 0.94 (95% CI: 0.79، 0.99)، أي ما يعادل 94%.

مبدأ

تتكون مجموعة therascreen PDGFRA RGQ PCR من تفاعل تضخيم PCR متعدد واحد للكشف عن الطفرة النقطية ذات الأهمية ومنطقة تحكم تقع أسفل هذا التفاعل في نفس جين PDGFRA.

يحتوي هذا الاختبار على الكواشف اللازمة لتضخيم وكشف تسلسل الحمض النووي المستهدف باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل النوعي في الوقت الحقيقي. وهو مصمم للاستخدام مع جهاز Rotor-Gene Q MDx (الولايات المتحدة) بالتزامن مع برنامج Rotor-Gene AssayManager.

يتضمن الفحص عددًا من الضوابط التي تُستخدم كجزء من كل دورة فحص. سيتم استخدام ضابط سلبي (بدون قالب) للكشف عن أي تلوث. كما سيتم استخدام بلازميد ضابط إيجابي يحتوي على التسلسلات المطلوبة للتأكد من أن عملية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) قد تمت ضمن المعايير المتوقعة.

يقوم برنامج Rotor-Gene AssayManager بإنشاء قيمة Ct للطفرة D842V وتسلسل التحكم الموجودين في العينة. ويستخدم البرنامج فرق قيمة Ct (ΔCt) بين قيمة Ct للطفرة D842V وقيمة Ct للتحكم لتحديد ما إذا كانت الطفرة D842V موجودة أم لا.

إجراء

تبدأ عملية الاختبار البسيطة والمباشرة باستخلاص الحمض النووي من نسيج ورم اللحمة المعدية المعوية المُثبَّت بالفورمالين والمُضمَّن في البارافين (FFPE) باستخدام مجموعة QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kit. يلي ذلك إجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) عالي الحساسية في الوقت الحقيقي على جهاز Rotor-Gene Q MDx (الولايات المتحدة). وأخيرًا، يقوم برنامج Rotor-Gene AssayManager بمعالجة النتائج والإبلاغ عنها بسرعة ودقة، مُعلِمًا مُشغِّل النظام بوجود طفرة D842V أو عدم وجودها.

التطبيقات

- تعليمات استخدام مجموعة اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل PDGFRA RGQ من ثيرا سكرين (كتيب). يناير 2023.

مجموعة therascreen PDGFRA RGQ PCR هي عبارة عن فحص تشخيصي نوعي في الوقت الحقيقي في المختبر للكشف عن الطفرة الجسدية D842V في جين PDGFRA باستخدام الحمض النووي الجينومي المستخرج من أنسجة ورم اللحمة المعدية المعوية (GIST) FFPE.

تهدف مجموعة therascreen PDGFRA RGQ PCR إلى مساعدة الأطباء في تحديد المرضى المصابين بأورام الجهاز الهضمي الذين قد يكونون مؤهلين للعلاج باستخدام AYVAKIT (أفابريتينيب) بناءً على نتيجة تم الكشف عنها لطفرة PDGFRA.