شركة كياجين، 970590، مجموعة أدوات التمديد الحراري لنظام الري بالتنقيط (24)

لـ ٢٤ تفاعلًا: بادئات التسلسل، بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، حمض نووي تحكم غير مثيل، مزيج PyroMark PCR MasterMix، مركز CoralLoad، والمحاليل المنظمة والكواشف

سمات

- تغطية الطفرات في كودونات KRAS 59 و61 و117 و146
- تغطية الطفرات في كودونات NRAS 12 و13 و59 و61 و117 و146
- إضافة برمجية لتفسير معلومات التسلسل المعقدة
- نتائج موثوقة في وقت قصير

تفاصيل المنتج

مجموعة RAS Extension Pyro Kit هي مجموعة أدوات للكشف الجزيئي عن الطفرات في الإكسونات 3 و4 من جين KRAS الورمي، والإكسونات 2 و3 و4 من جين NRAS الورمي البشري. تحتوي المجموعة على بادئات وكواشف لتضخيم جيني KRAS وNRAS، بالإضافة إلى محاليل منظمة وبادئات وكواشف للكشف عن الطفرات وتحديد كميتها في الوقت الحقيقي باستخدام تقنية التسلسل الناري على نظام PyroMark Q24.

أداء

تتراوح قيم LOD للطفرات التي تغطيها مجموعة RAS Extension Pyro Kit من 1.8% إلى 8.8%.

مبدأ

الكودون: استبدال الحمض النووي
الكودون 59 من جين KRAS (GCA): 175G>A
176C>G: A59G
الكودون 61 من جين KRAS (CAA): 183A>C
182A>T: Q61L
182A>G: Q61R
183A>T: Q61H
181C>G: Q61E
كودون KRAS 117 (AAA): 351A>C
351A>T: K117N
كودون KRAS رقم 146 (GCA): 436G>A
436G>C: A146P
437C>T: A146V
الكودون 12 من جين NRAS (GGT): 34G>A
34G>T: G12C
34G>C: G12R
35G>A: G12D
35G>T: G12V
35G>C: G12A
الكودون 13 من جين NRAS (GGT): 37G>A
37G>T: G13C
37G>C: G13R
38G>A: G13D
38G>T: G13V
38G>C: G13A
الكودون 59 من جين NRAS (GGT): 175G>A
176C>G: A59G
الكودون 61 من جين NRAS (CAA): 181C>A
182A>G: Q61R
182A>T: Q61L
183A>T: Q61H
183A>C: Q61H
183A>G: Q61Q
الكودون 117 من جين NRAS (AAG): 351G>C
351G>T: K117N
الكودون 146 من جين NRAS (GCC): 436G>A
436G>C: A146P
437C>T: A146V

تُستخدم مجموعة RAS Extension Pyro Kit لإجراء قياسات كمية للطفرات في الإكسونات 3 و4 من جين KRAS الورمي البشري، والإكسونات 2 و3 و4 من جين NRAS الورمي البشري، وذلك باستخدام تقنية التسلسل الناري على نظام PyroMark Q24. تشفر جينات RAS بروتينات تلعب دورًا حاسمًا في سلسلة إشارات EGFR. ويمكن أن تؤثر الطفرات في جينات RAS على كيفية تحفيز هذه البروتينات لهذه المسارات اللاحقة.

تم الكشف عن الطفرات التالية:

إجراء

للحصول على نظرة عامة حول تقنية التسلسل الناري، يرجى زيارة مركز موارد التسلسل الناري الخاص بنا

تتألف مجموعة RAS Extension Pyro Kit من 8 اختبارات تغطي مختلف المناطق ذات الأهمية (انظر الشكل 1: اختبارات مجموعة RAS Extension Pyro Kit، والشكل 2: مخطط Pyrogram الناتج بعد تحليل عينة ذات نمط جيني طبيعي باستخدام اختبار KRAS 146). تُضخّم المناطق بشكل منفصل باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) وتُسلسل عبر المنطقة المحددة. تُستخدم التسلسلات المحيطة بالمواقع المحددة كقمم مرجعية ومعايرة لتحديد كمية التحليل وتقييم جودته.

بعد تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) باستخدام بادئات تستهدف الكودونات المختلفة، تُثبّت نواتج التضخيم على خرزات ستربتأفيدين سيفاروز عالية الأداء. يُحضّر الحمض النووي أحادي السلسلة، وتُربط بادئات التسلسل المناسبة به. ثم تُحلّل العينات على نظام PyroMark Q24 باستخدام ملف إعداد التشغيل وملف التشغيل. يُنصح باستخدام تقرير ملحق RAS لتحليل التشغيل. يضمن هذا التقرير استخدام قيم حد الكشف (LOD) الصحيحة، واستخدام تسلسلات مختلفة للتحليل تلقائيًا للكشف عن جميع الطفرات (انظر الشكل 3: قائمة تقرير ملحق RAS والشكل 4: تقرير ملحق RAS). مع ذلك، يمكن أيضًا تحليل التشغيل باستخدام أداة التحليل المدمجة في نظام PyroMark Q24. بعد ذلك، يمكن تعديل "التسلسل المراد تحليله" للكشف عن الطفرات النادرة بعد انتهاء التشغيل.

التطبيقات

تُمكّن مجموعة RAS Extension Pyro Kit من إجراء تحليل كمي للطفرات، وهو ما يُطبّق في العديد من مجالات البحث، بما في ذلك أبحاث السرطان وعلم التخلق. تُستخدم هذه المجموعة للكشف الكمي عن الطفرات في الكودونات 59 و61 و117 و146 من جين KRAS الورمي البشري، والكودونات 12 و13 و59 و61 و117 و146 من جين NRAS الورمي البشري، وذلك باستخدام الحمض النووي المستخلص من أنسجة بشرية مُثبّتة بالفورمالين ومُضمّنة في البارافين (FFPE).