مجموعة تصوير Verogen ForenSeq من شركة Qiagen، رقم الإصدار V16000189

يتضمن الكواشف اللازمة لمعالجة ما يصل إلى 96 عينة في وقت واحد للحصول على معلومات عن النمط الظاهري والأصل الجغرافي الحيوي لإنشاء ملفات تعريف شاملة للحمض النووي.

سمات

- تقييم المتغيرات النوكليوتيدية المفردة الظاهرية مع أو بدون الأصل الجغرافي الحيوي
- سير عمل مصمم خصيصًا للتكامل مع مختبرات الطب الشرعي التشغيلية
- قابل للتشغيل البيني وقابل للتوسع مع تقارير مُعدة مسبقًا للتحميل إلى أدوات خارجية

تفاصيل المنتج

مجموعة Verogen ForenSeq Imagen هي مجموعة لتحضير المكتبات الجينية، توفر مزيجين مختلفين من البادئات، مما يسمح للمستخدم بتقييم تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) الظاهرية، سواءً مع أو بدون تحديد الأصل الجغرافي الحيوي. تعتمد آلية عمل ForenSeq Imagen على منهجية مُثبتة بالكامل لتحويل الحمض النووي إلى بيانات، مصممة خصيصًا لتطبيقات علم الجينوم الجنائي. وتعتمد المجموعة على مجموعات علامات SNP مُعتمدة ومُراجعة من قِبل النظراء، والتي تم تحديدها واختبارها من قِبل مجتمع الطب الشرعي.

تُعد مجموعة Verogen ForenSeq Imagen Kit حلاً مثالياً لمختبرات الطب الشرعي التشغيلية التي تفكر في تطبيق سير عمل لتوليد العملاء المحتملين قائم على تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي (NGS).

أداء

الميزة: التفاصيل
نوع العينة: الحمض النووي الجينومي المستخلص من مجموعة من أنواع العينات الجنائية الشائعة: مستخلص مسحة الخد، والعظام، والدم، والأسنان، وبطاقة FTA
الكمية الموصى بها لتحليل الحمض النووي الجينومي: 32 بيكوغرام - 1 نانوغرام لكل عينة
المدخلات الموصى بها لآلة ثقب بطاقات FTA: 1.2 مم لكل عينة
سعة الإرسال المتعدد الموصى بها: 8-96 مكتبة لكل تشغيل
عدد الخلطات التمهيدية: 2: DPME وDPMF (Geo)
محتوى مزيج البرايمر: DPME: 22 SNP للشعر، 6 SNP للون العين، 36 SNP للون البشرة و14 Y-SNP (إجمالي 55 SNP) DPMF (Geo): 22 SNP للشعر، 6 SNP للون العين، 36 SNP للون البشرة، 56 BGA SNP و14 Y-SNP (إجمالي 111 SNP)
الكشف عن الأمبليكونات القصيرة: تركيز عالٍ من العلامات <150 زوج قاعدي
إجمالي وقت تجهيز المكتبة: 7 ساعات و15 دقيقة
مدة التدريب العملي: ساعة ونصف
إجمالي وقت التسلسل: حوالي 18 ساعة باستخدام مجموعة Verogen MiSeq FGx Reagent Micro Kit

- مزيج بادئ مركز لزيادة حجم إدخال العينة
- تحضير متزامن لما يصل إلى 96 مكتبة في لوحة واحدة؛ كل مكتبة عبارة عن مجموعة من شظايا الحمض النووي المضخمة من عينة واحدة
- تم تصميم هذا الفحص لزيادة دقة تحليل الحمض النووي إلى أقصى حد باستخدام عينات متدهورة وقليلة المدخلات عن طريق توليد مضخمات قصيرة ذات مؤشرات مزدوجة فريدة (UDIs).
- نظام عازل لدعم عينات الطب الشرعي المثبطة
- مزيجان من البادئات لتوليد رؤى تستند إلى التنظيم الإقليمي الحالي والناشئ DPME - تضخيم أهداف SNP للتنبؤ بلون الجلد والشعر والعين، والتي يشار إليها أيضًا باسم الخصائص المرئية الخارجية (EVC) DPMF (Geo) - تضخيم أهداف SNP للتنبؤ بـ EVCs في DPME وعلامات الأصل الجغرافي الحيوي (BGA)
- DPME – تضخيم أهداف SNP للتنبؤ بلون الجلد والشعر والعين، ويشار إليها أيضًا باسم الخصائص المرئية الخارجية (EVC).
- DPMF (Geo) – تضخيم أهداف SNP للتنبؤ بـ EVCs في DPME وعلامات الأصل الجغرافي الحيوي (BGA)

- DPME – تضخيم أهداف SNP للتنبؤ بلون الجلد والشعر والعين، ويشار إليها أيضًا باسم الخصائص المرئية الخارجية (EVC).
- DPMF (Geo) – تضخيم أهداف SNP للتنبؤ بـ EVCs في DPME وعلامات الأصل الجغرافي الحيوي (BGA)

توفر مجموعة ForenSeq Imagen Kit الميزات التالية:

تتضمن كلتا مجموعتي البادئات 41 متغيرًا جينيًا أحادي النوكليوتيد (SNP) لتقدير النمط الظاهري، بما في ذلك 22 متغيرًا لتقدير لون الشعر، و6 متغيرات لتقدير لون العين، و36 مؤشرًا لتقدير لون البشرة، مع وجود بعض المتغيرات الجينية المشتركة بين أكثر من نمط ظاهري. كما تتضمن كلتا المجموعتين 14 متغيرًا جينيًا أحادي النوكليوتيد مرتبطًا بالكروموسوم Y لتمكين التقدير الدقيق للجنس البيولوجي. بالإضافة إلى ذلك، تتضمن إحدى المجموعتين 56 متغيرًا جينيًا أحادي النوكليوتيد لتقدير الأصل الجغرافي الحيوي. تتمتع المختبرات بالمرونة في استخدام أي من المجموعتين بناءً على المناهج التنظيمية المرتبطة بموقعها الجغرافي.

مبدأ

فئة SNP: عدد العلامات
المزيج E: المزيج F
Y-SNPs*: 14
المتغيرات النوكليوتيدية المفردة الظاهرية: 41
لون الشعر: 22
لون العين: 6
لون البشرة: 36
المتغيرات الجينية للأصول الجغرافية الحيوية: 56

تُنتج مجموعة Verogen ForenSeq Imagen Kit مكتبات مُفهرسة ثنائية للتسلسل. تُدمج كل عينة مع مزيج من البادئات يحتوي على زوج من النيوكليوتيدات المُوسومة لكل تسلسل مستهدف. تربط دورات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) الوسوم بنسخ من كل هدف، مُشكلةً قوالب الحمض النووي التي تتكون من المناطق المُراد دراستها مُحاطة بتسلسلات ربط البادئات العامة. تُستخدم الوسوم بعد ذلك لربط مُهايئات الفهرسة، ثم تُضخّم المكتبة الناتجة وتُنقى وتُجمع للتسلسل.

يقدم الجدول ملخصًا لعدد العلامات المرتبطة بكلتا مجموعتي البادئات في مجموعة Verogen ForenSeq Imagen Kit.

* تتداخل 4 متغيرات جينية أحادية النوكليوتيد (SNPs) بين أنماط لون العين والبشرة والشعر؛ وتتداخل 13 متغيرًا جينيًا أحادي النوكليوتيد بين أنماط لون الشعر والبشرة؛ ويتداخل متغيران جينيان أحاديا النوكليوتيد بين أنماط لون العين والبشرة. ** متوفر فقط في لوحة EVC+BGA SNP (DPMF-Geo).

إجراء

إن سير عمل ForenSeq Imagen، الذي يتألف من مجموعة ForenSeq Imagen، ونظام التسلسل MiSeq FGx مع مجموعة MiSeq FGx Reagent Micro، وطرق تحليل ForenSeq Imagen في برنامج التحليل العالمي (UAS)، هو سير عمل تم التحقق منه بالكامل لتحويل الحمض النووي إلى بيانات مصمم خصيصًا لتطبيقات علم الجينوم الجنائي (انظر الشكل Verogen ForenSeq Imagen Kit workflow).

قم بإعداد اختبار ForenSeq Imagen باستخدام DPME للخصائص المرئية الخارجية (EVC) ومتغيرات المظهر SNPs أو DPMF (Geo) للخصائص المرئية الخارجية ومتغيرات الأصل الجغرافي الحيوي (BGA) SNPs.

قم بالتسلسل باستخدام نظام التسلسل MiSeq FGx باستخدام مجموعة كواشف MiSeq FGx الدقيقة.

قم بالتحليل باستخدام وحدات تحليل مخصصة مُعدة مسبقًا لأساليب تحليل Imagen و Imagen Geo.

قم بتنزيل أنواع متعددة من التقارير دفعة واحدة من Imagen و Imagen Geo. تقارير تحليل النمط الظاهري متوافقة مع تطبيق الويب HIrisPlex-S.

قم بتحميل تقرير النمط الظاهري إلى تطبيق HIrisPlex-S على الويب لإجراء التقديرات.

أنشئ تقاريرك. تتم إعادة تنسيق البيانات بشكل يسهل الوصول إليه باستخدام أداة I-HAT macro الموجودة على خادم تحليل البيانات Verogen.

التطبيقات

يُمكن لتحليل النمط الظاهري للحمض النووي الجنائي (FDP) التنبؤ بالخصائص الظاهرة من خلال آثار الحمض النووي في مسرح الجريمة. ويُساعد هذا التحليل في توجيه تحقيقات الشرطة بمعلومات حول الجاني المجهول عندما تفشل طرق تحليل الحمض النووي التقليدية في تحديد هويته.

يُعدّ اختبار Verogen ForenSeq Imagen Kit البسيط القائم على الألواح جزءًا من سير عمل FDP المتكامل، حيث يقوم بتسلسل المكتبات على نظام التسلسل MiSeq FGx وتحليل البيانات باستخدام برنامج التحليل الشامل (UAS). ويتيح التكامل السلس للتقارير مع برامج خارجية مثل HIrisPlex-S للمستخدمين الوصول إلى رؤى محسّنة لتوليد العملاء المحتملين.