Thermo Fisher، 26169، SDAD (NHS-SS-Diazirine) (succinimidyl 2-((4,4'-azipentanamido)ethyl)-1,3'-dithiopropionate)

يجمع مركب SDAD (NHS-SS-Diazirine) (succinimidyl 2-((4,4'-azipentanamido)ethyl)-1,3'-dithiopropionate) من شركة Thermo Scientific Pierce بين كيمياء التفاعل الضوئي القائمة على إستر NHS والديازيرين، والتي أثبتت فعاليتها، مع جزيئات تحتوي على أمين مترافق مع أي مجموعة وظيفية أخرى تقريبًا، وذلك عبر تنشيطها بضوء الأشعة فوق البنفسجية طويل الموجة.
يفصل ذراع فاصل بطول 5 أنجستروم يحتوي على رابطة ثنائية الكبريت قابلة للكسر بين المجموعتين المتفاعلتين ضوئياً.
خصائص SDAD (NHS-SS-Diazirine):
• قابل للنفاذ عبر الغشاء - مناسب للربط المتبادل للبروتينات داخل الخلايا الحية
• غير متجانسة ثنائية الوظيفة - تتفاعل مجموعة إستر NHS مع الأمينات الأولية عند درجة حموضة من 7 إلى 9 لتكوين روابط أميدية تساهمية؛ تتفاعل مجموعة الديازيرين (أزيبنتانوات) بكفاءة مع أي سلسلة جانبية من الأحماض الأمينية أو العمود الفقري للببتيد عند تنشيطها بضوء الأشعة فوق البنفسجية طويل الموجة (330-370 نانومتر).
• قابل للتحكم - يتم تنشيط الربط الكيميائي على مرحلتين باستخدام مصابيح الأشعة فوق البنفسجية المختبرية الشائعة
• سهلة الاستخدام - تتميز هذه الروابط المتشابكة بثباتها الضوئي في ظل ظروف الإضاءة المختبرية النموذجية، لذا لا حاجة لإجراء التجارب في الظلام.
• أفضل من أزيدات الأريل - تتمتع مجموعة الديازيرين الحساسة للضوء بثبات ضوئي أفضل في الضوء العادي مقارنةً بمجموعات فينيل أزيد في الروابط المتشابكة التقليدية الحساسة للضوء، ومع ذلك، يتم تنشيط مجموعة الديازيرين بكفاءة أكبر بواسطة الأشعة فوق البنفسجية طويلة الموجة. تُعد كواشف سكسينيميديل-ديازيرين (SDA) فئة جديدة من الروابط المتشابكة تجمع بين كيمياء تفاعل الأمين المثبتة وكيمياء ضوئية مبتكرة وفعالة تعتمد على الديازيرين لربط الجزيئات المحتوية على الأمين بأي مجموعة وظيفية أخرى تقريبًا. تشمل روابط SDA المتشابكة ستة مركبات تختلف في أطوال أذرع التباعد، والقدرة على فصل البروتينات المتشابكة، ووجود أو عدم وجود مجموعة مشحونة لنفاذية الغشاء. يُعد تشابك البروتين تقنية مهمة تُستخدم لفهم بنية البروتين وتثبيت تفاعلات البروتين-بروتين، وتُوسع كواشف SDA هذه كفاءة ونطاق التفاعلات التي يمكن استكشافها من خلال هذا النهج.
تتطلب الروابط المتشابكة ثنائية الوظيفة النموذجية التي تتفاعل مع الأمينات أو الكبريتيدريل مجموعات محددة من الأحماض الأمينية (مثل
على سبيل المثال، الليسين أو السيستين) على المسافة الصحيحة على كلا البروتينين لالتقاط تفاعلات البروتين. تتجاوز روابط SDA المتشابكة هذا القيد من خلال السماح بوضع علامات محددة على أحد البروتينين باستخدام إستر N-هيدروكسي سكسينيميد (NHS) المتفاعل مع الأمين، متبوعًا بربط متشابك مُنشط بالأشعة فوق البنفسجية عبر جزء الديازيرين مع أي سلسلة جانبية من الأحماض الأمينية أو العمود الفقري الببتيدي لبروتين ثانٍ. تتميز روابط الديازيرين الضوئية المتشابكة بثبات ضوئي أفضل من روابط الفينيل أزيد الضوئية المتشابكة، ويمكن تنشيطها بسهولة باستخدام الأشعة فوق البنفسجية طويلة الموجة (330-370 نانومتر).
تتوفر روابط متقاطعة متعددة من الديازيرين. تفتقر مشتقات الديازيرين من نوع NHS-ester (SDA وLC-SDA وSDAD) إلى مجموعة مشحونة، وهي قابلة للنفاذ عبر الأغشية الخلوية. هذه الخاصية تجعلها مثالية للربط داخل الخلايا وداخل الأغشية. في المقابل، تحتوي مشتقات Sulfo-SDA وSulfo-LC-SDA وSulfo-SDAD على مجموعات كبريتات سالبة الشحنة، مما يحسن ذوبانها في الماء ويقلل نفاذيتها عبر غشاء الخلية، مما يتيح استخدامها في الربط المتقاطع للبروتينات خارج الخلية. كما يحتوي كل من SDAD وSulfo-SDAD على رابطة ثنائية الكبريتيد ضمن الفاصل، والتي يمكن كسرها باستخدام عوامل الاختزال.
• قصير (3.
9Å) وطويل (12.
أنواع أذرع التباعد (5 أنجستروم)
• أصناف قابلة للنفاذ عبر الغشاء (NHS) وأصناف غير قابلة للنفاذ (Sulfo-NHS)
• أنواع غير قابلة للانقسام وأنواع قابلة للانقسام (فاصل ثنائي الكبريتيد) نفاذية الخلية: نعم
الوصف: SDAD
الشكل: صلب
طريقة وضع العلامات: وضع العلامات الكيميائية
الوزن الجزيئي (جم/مول): 388.
46
مُبَغْلَط: لا
خط الإنتاج: بيرس™
الكمية: 50 ملغ
الجزء التفاعلي: إستر NHS، ديازيرين
حالة الشحن: درجة حرارة الغرفة
الذوبانية: ثنائي ميثيل فورماميد، ثنائي ميثيل سلفوكسيد
طول ذراع التباعد: 13.
5 أنجستروم
قابل للذوبان في الماء: لا
التفاعل الكيميائي: أمين - غير انتقائي
قابل للانقسام: بواسطة الثيولات
نوع الرابط المتشابك: غير متجانس ثنائي الوظيفة
التنسيق: قياسي
نوع المنتج: مادة ربط متقاطع
الفاصل: متوسط ​​(من 10 إلى 30 أنجستروم)
حجم الوحدة: كل وحدة