Thermo Fisher، 4475346، لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2

لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 عبارة عن مجموعة واحدة من البادئات تُستخدم لإجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد (multiplex PCR) لتحضير مكتبات تضخيم من مناطق "البؤر الساخنة" الجينومية التي تتعرض لطفرات متكررة في جينات السرطان البشري (حمّل قائمة الجينات المستهدفة والطفرات الخاصة بلوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2). وبناءً على الطفرات المشمولة في لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Panel الأصلية، توفر أحدث لوحة Ion AmpliSeq™ الجاهزة للاستخدام ما يلي:
• تم الحفاظ على التوافق مع عينات FFPE مع توسيع محتوى الطفرات لتغطية أوسع للجينات الإضافية وطفرات "النقاط الساخنة".
• تغطية متجانسة للغاية لتسلسل أكثر كفاءة وتوفير في التكاليف
• تصميم مُحسَّن للبادئات مع تحسين مجموعات البادئات الجديدة وتقليل انحياز السلسلة لزيادة الثقة في تحديد المتغيرات بدقة
• تحسين كشف المتغيرات باستخدام برنامج Torrent Suite v3.0 وملحق Variant Caller في كشف المتغيرات ذات الأليلات المنخفضة، بالإضافة إلى تحسين حساسية الإدخالات والحذوفات. محتوى طفرات إضافي لدعم دراسات أبحاث السرطان. صُممت لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 لتضخيم 207 مضخمات تغطي ما يقارب 2800 طفرة COSMIC من 50 جينًا ورميًا وجينًا كابحًا للورم. يشمل ذلك 739 طفرة COSMIC من 46 جينًا في لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Panel الأولى، بالإضافة إلى طفرات النقاط الساخنة المضافة من جينات سرطانية مهمة. مع الحفاظ على توافقنا مع عينات FFPE وتغطية نفس الأهداف مثل لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Panel الأولى، قمنا بتضمين طفرات إضافية عن طريق إضافة العديد من المضخمات للنقاط الساخنة في EZH2 وGNA11 وGNAQ وIDH2، وإضافة مضخمات أطول قليلاً لجينات أخرى للمساعدة في تطوير أبحاث السرطان. يُنصح باستخدام لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 مع مجموعة Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0. تسلسل أكثر كفاءة وفعالية من حيث التكلفة مع تغطية متجانسة للغاية. يُحسّن تصميم البادئات المُطوّر في لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 من تجانس التغطية لتقنية Ion AmpliSeq™. بفضل التغطية الأكثر تجانسًا، يُمكن تحقيق الحد الأدنى من العمق عبر جميع المُضخّمات باستخدام إنتاجية تسلسل أقل بكثير. وبالتالي، يُمكن دمج عينات إضافية باستخدام أي من رقائق Ion. ينتج عن ذلك توفير في التكاليف مع تسلسل أكثر كفاءة مع الحفاظ على ثقة عالية في تحديد المتغيرات. بالإضافة إلى ذلك، يُوفر التحيز المنخفض للسلسلة في مجموعات البادئات الخاصة بلوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 مزيدًا من الثقة في تحديد المتغيرات بدقة. بساطة وسرعة وقابلية التوسع في تقنية Ion AmpliSeq™: مع الحفاظ على بساطة تقنية Ion AmpliSeq™، تُمكّن لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 من إجراء دراسات جينية للسرطان من أنسجة FFPE باستخدام 10 نانوغرام فقط من الحمض النووي المُدخل لبناء مكتبات مُستهدفة. كما تحافظ لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 على سير العمل الثوري باستخدام معدات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) القياسية وتفاعل PCR بسيط لاختيار الأهداف عالي التعدد القائم على تفاعل PCR، دون الحاجة إلى استثمار رأسمالي كبير. بالإضافة إلى ذلك، تُمكّنك لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 من الوصول إلى أسرع وقت ممكن للمكتبات المُستهدفة في غضون 3.5 ساعات تقريبًا. كما تحافظ لوحة Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 على قابلية التوسع والمرونة، مما يسمح بتسلسل عينة واحدة أو عينات متعددة مُرمّزة باستخدام أي من رقائق Ion. تحسين اكتشاف المتغيرات باستخدام برنامج Torrent Suite v3. يُمكّنك برنامج Torrent Suite سهل الاستخدام وملحق Variant Caller من الانتقال من الحمض النووي المُستخلص إلى تحديد المتغيرات في غضون 10 ساعات فقط. مع تحسينات الخوارزميات، ستلاحظ حساسية أكبر في كشف عمليات الإدخال والحذف، بالإضافة إلى حساسية أكبر في كشف تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) مع الأليلات ذات التردد المنخفض. يُمكن استخدام برنامج Ion Reporter™ بعد ذلك لشرح المتغيرات في فحوصات الحمض النووي الروتينية، مما يُساهم في تطوير البحوث السريرية. يُستخدم مع (التطبيق): التسلسل
للاستخدام مع (المعدات): نظام Ion PGM™
المكتبات: مكتبة التسلسل المستهدف
قدرة التعدد: 207 مضخمات
عدد التفاعلات: 8
خط الإنتاج: Ion AmpliSeq™
نوع المنتج: لوحة الكشف عن بؤر السرطان
الكمية: 8 تفاعلات
نوع العينة: دم، مزارع خلايا، عينات سريرية، حمض نووي (جينومي)، حمض نووي من أنسجة مثبتة بالفورمالين ومضمنة في البارافين، حمض نووي مزدوج السلسلة، عينات خزعة بالإبرة الدقيقة، أنسجة مثبتة بالفورمالين ومضمنة في البارافين، دم كامل
النوع: بشري
كمية المواد الأولية: 10 نانوغرام من الحمض النووي
التقنية: تسلسل الأمبليكون، تسلسل أشباه الموصلات الأيونية بتقنية ما بعد الضوء™
خطوة سير العمل: اختيار الهدف
نوع التسلسل: تسلسل الجينوم والحمض النووي
حجم الوحدة: كل وحدة