Thermo Fisher، A35864، Oncomine Lung Cell-Free Total Nuneic Acid Research Assay

اختبار Oncomine Lung cfTNA البحثي للأحماض النووية الكلية الخالية من الخلايا في الرئة: يُعد اختبار Oncomine Lung cfTNA البحثي جزءًا من حل متكامل للكشف عن الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبوزي RNA الخالي من الخلايا (الحمض النووي الكلي الخالي من الخلايا؛ cfTNA) المُستخلص من بلازما الدم الكامل. يوفر هذا الاختبار الكواشف اللازمة لبناء المكتبات، بالإضافة إلى مجموعة واحدة من بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد (PCR) لتحضير مكتبات التضخيم من cfTNA المُستخلص من بلازما الدم الكامل في أنبوب واحد سعة 10 مل. توفر الخزعات السائلة العديد من المزايا مقارنةً بخزعات الأورام الصلبة التقليدية.
• أقل توغلاً، مما يسمح بأخذها في أوقات متعددة لمراقبة تطور السرطان
• تكلفة أقل
• وقت استجابة أسرع من العينة إلى النتائج
• تمثيل أفضل لعدم تجانس الورم: يُمكّن اختبار Oncomine Lung cfTNA Research Assay من تحليل ما يلي:
• الجينات الساخنة (SNVs) والحذف والإدخال القصير: ALK، BRAF، EGFR، ERBB2، KRAS، MAP2K1، MET، NRAS، PIK3CA، ROS1، وTP53 (تمت تغطية حوالي 168 منطقة ساخنة)
• اندماجات جينية: ALK، RET، ROS1
• تخطي الإكسون 14 من جين MET
• جينات تغير عدد النسخ (CNV): MET. تم تحديد هذه الجينات على أنها تتعرض لطفرات متكررة في سرطان الرئة ذي الخلايا غير الصغيرة (NSCLC). وباستخدام تقنية تسلسل العلامات، يمكن تحقيق حدود كشف منخفضة (LOD) لأنواع مختلفة من المتغيرات*.
• بالنسبة للطفرات النقطية المفردة/الحذف والإدخال القصير، يمكن تحقيق حد كشف يبلغ 0.1% مع حساسية تبلغ حوالي 90% وخصوصية تزيد عن 99%.
• بالنسبة لعمليات الاندماج وتجاوز الإكسون MET، يمكن تحقيق حد كشف بنسبة 1% مع حساسية تزيد عن 90% وخصوصية تزيد عن 99%.
بالنسبة لهدف MET CNV، يمكن الكشف عن تضخيم منخفض يصل إلى 1.2 ضعف بحساسية تزيد عن 90% وخصوصية تزيد عن 99%. يمكن إنجاز سير العمل بالكامل، بدءًا من عزل الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfTNA) باستخدام مجموعة MagMAX لعزل الأحماض النووية الكلية الخالية من الخلايا، وصولًا إلى تحليل العينات، في غضون يومين فقط باستخدام نظام التسلسل Ion S5 XL. يوجد الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfDNA) والحمض النووي الريبوزي الخالي من الخلايا (cfRNA) بتراكيز منخفضة للغاية في بلازما الدم الكامل. ونظرًا لهذا الانتشار المنخفض، تُستخدم تقنية التسلسل بالعلامات في هذا التحليل. تربط هذه التقنية علامات جزيئية فريدة بالبادئات الخاصة بالجين (انظر الشكل أدناه). بعد التضخيم، تُجمع الجزيئات الموسومة بناءً على هذه العلامات. تُعتبر المجموعات التي تحتوي على نفس الطفرة بنسبة 80% أو أكثر إيجابية. باستخدام تقنية العلامات، تُزال المجموعات التي تحتوي على أخطاء عشوائية ناتجة عن عملية بناء المكتبة/التسلسل. على عكس التقنيات الأخرى ذات حدود الكشف التي تتراوح بين 1-5%، يتميز اختبار Oncomine Lung cfTNA Research Assay بحدود كشف مرنة تصل إلى 0.1% للطفرات النقطية المفردة (SNVs) أو نسخة طافرة واحدة في خلفية من 1000 نسخة من النوع البري. ولتحقيق حد كشف 0.1%، يلزم 20 نانوغرام من الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfDNA). يمكن استخدام كميات أقل من الحمض النووي الخالي من الخلايا، ولكن ستكون نسبة حد الكشف أعلى اعتمادًا على الكمية المُدخلة. المزايا:
• تصميم محسّن للأمبليكون لـ cfDNA القصير يضمن أعلى معدل التقاط ممكن
• تعمل تقنية تسلسل العلامات على تقليل النتائج الإيجابية الخاطئة عن طريق إزالة الأخطاء المدمجة عشوائياً
• يسمح تصميم الفحص المستهدف الأمثل بإجراء تسلسل الجيل التالي عالي التعدد (NGS)، مما يقلل من تكاليف التسلسل لكل عينة
• سير عمل فعال لمدة يومين: يمكن تحليل الطفرات النقطية المفردة (SNVs) والحذف والإدخال القصير باستخدام برنامج Torrent Suite الإصدار 5.2 أو أحدث. ولتحليل هذه الطفرات، والاندماجات، وتغيرات عدد النسخ (CNVs)، يلزم استخدام برنامج Ion Reporter الإصدار 5.6 (متوفر على السحابة أو الخادم). تتميز تقنية TagSequencing بالبساطة والسرعة وقابلية التوسع. يُمكّن اختبار Oncomine Lung cfTNA Research Assay من إجراء دراسات جينية للسرطان باستخدام 5 نانوغرام فقط من الحمض النووي الخالي من الخلايا (cfTNA) لإنشاء مكتبات مستهدفة. يتوافق اختبار Oncomine Lung cfTNA Research Assay مع عينات FFPE لإجراء دراسات التوافق. يستغرق إنشاء المكتبات المستهدفة أربع ساعات فقط. يتم تحقيق قابلية التوسع والمرونة باستخدام مجموعة رموز Tag Sequencing الشريطية 1-24 أو 25-48 (أرقام الكتالوج A31830 وA31847) لدمج العينات المرمزة على رقائق Ion S5. تم تحديد حساسية ونوعية كل نوع من أنواع المتغيرات باستخدام مجموعة من العينات الإيجابية المصطنعة وcfTNA المعزول من متبرعين أصحاء. للاستخدام مع (التطبيق): التسلسل
عدد التفاعلات: 8
خط الإنتاج: أونكوماين™
نوع المنتج: اختبار أبحاث الأحماض النووية الكلية الخالية من الخلايا الرئوية من Oncomine
الكمية: 8 تفاعلات
شروط الشحن: ثلج جاف
حجم الوحدة: كل وحدة