Reactivos de síntesis de ácidos nucleicos Thermo Fisher para la fabricación de oligonucleótidos

Está creando oligonucleótidos de ADN/ARN que deben funcionar a la primera. Esta colección reúne los reactivos esenciales de Thermo Fisher en un solo lugar para que pueda elegir rápidamente y realizar sus pedidos con confianza. Como distribuidor, Iright ofrece una amplia gama de fosforamiditas originales de Thermo Fisher, soportes para CPG, etiquetas, reactivos de ciclo y recursos de control de calidad, con un eficiente servicio de documentación.

Qué cubre esta colección de síntesis de ácidos nucleicos

Esta página describe cada paso del flujo de trabajo de oligonucleótidos, desde monómeros y soportes hasta modificación, purificación y control de calidad, para que pueda adaptar los reactivos a la aplicación sin conjeturas. Encontrará una guía general, ejemplos de uso óptimos y una lista corta de números de pieza verificados de Thermo Fisher. Iright está disponible para cotizar, agrupar y proporcionar certificados cuando sea necesario.

Reactivos de síntesis de oligonucleótidos básicos: fosforamiditas de ADN/ARN, CPG, kits de ciclo

La elección de los componentes básicos y los soportes adecuados determina el rendimiento, la pureza y el rendimiento posterior. Utilice las notas a continuación para adaptar las fosforamiditas de ADN/ARN , los soportes de CPG y los reactivos de ciclo a su plataforma y la pureza deseada antes de escalar.

• Fosforamiditas de ADN/ARN. Thermo Fisher ofrece amiditas de ADN y ARN estándar, junto con productos químicos modificados en 2' y especializados para diferentes instrumentos y niveles de uso, desde RUO hasta el desarrollo de procesos. Las familias incluyen ADN, ARN, marcados con colorante, estructurales, enlazadores/espaciadores y succinatos.

• Soportes CPG (vidrio de poro controlado). Seleccione el tamaño de poro, la carga y el enlace (universal o específico para nucleósidos) para equilibrar la escala de síntesis y la pureza. Disponemos de columnas CPG listas para usar para escalas comunes.

• Química del ciclo. Asegúrese de que las condiciones de activador, oxidante/sulfurante, tapado A/B y desprotección sean compatibles con sus modificaciones y colorantes. (Existen formatos de botella específicos para cada instrumento para los sistemas Expedite y MerMade).

Oligos modificados: fluoróforos, extintores (BHQ/MGB) y grupos funcionales

La sensibilidad y especificidad del ensayo suelen depender del par marcador/extintor o del identificador funcional. Esta sección le ayuda a adaptar las opciones de etiquetado a la configuración óptica, el comportamiento de hibridación y las limitaciones de almacenamiento.

Las opciones típicas incluyen fluoróforos (6-FAM, HEX, TET, serie Cy), extintores (BHQ/MGB) y grupos funcionales (biotina, amina, tiol, azida, fosfato). Adapte la emisión/absorción a su instrumento o generador de imágenes de qPCR y considere la posición del marcador (5', interno, 3') para mantener la temperatura de fusión (Tm) y evitar el sangrado espectral. (El colorante 6-FAM, fosforamidito, para el marcado en 5' es fundamental en el diseño de sondas).

Purificación de oligoelementos y control de calidad: desalinización, OPC, HPLC/PAGE y certificados

Los requisitos de pureza varían según la aplicación, por lo que es importante calibrar la purificación y la documentación según la tolerancia al riesgo del ensayo. A medida que aumenta la pureza, también lo hacen el tiempo y el coste: elija el nivel más bajo que cumpla con los objetivos de rendimiento de forma fiable.

• Desalt/OPC para cebadores y cribado de rutina.

• HPLC (RP/IEC) o PAGE para sondas de estilo diagnóstico/qPCR y secuencias cortas y altamente modificadas.

• Control de calidad y documentación. Conserve datos UV, cromatogramas y certificados de análisis (CoA) para auditorías y transferencia de métodos. Thermo Fisher proporciona CoA específicos para cada lote de productos esenciales, como las amiditas de nucleósidos.

Mapa de aplicaciones: sondas PCR/qPCR, clonación, adaptadores NGS y más

Con el panorama químico establecido, asigne reactivos a métodos comunes para evitar la reoptimización posterior. Los siguientes consejos priorizan la compatibilidad y la pureza, en lugar de recetas exhaustivas.

• PCR/qPCR y PCR digital. Utilice pares de colorante/extintor con mínima superposición espectral y considere sondas purificadas por HPLC para obtener líneas base consistentes. 6-FAM/BHQ-1 es un punto de partida común; la MGB puede ajustar el comportamiento de fusión para sondas más cortas.

• Clonación y expresión génica. Las amiditas de ADN estándar y los soportes universales de CPG suelen ser suficientes; confirme las condiciones de desprotección para los motivos internos sensibles.

• Adaptadores/indexación NGS. Favorezca una mayor pureza y una fosforilación verificada según sea necesario; documente el control de calidad a nivel de lote para simplificar la resolución de problemas y la validación.

• Modalidades personalizadas (ASO/siRNA, estudios estructurales). Aprovechamiento de amiditas especializadas/estructurales y químicas modificadas en 2'; armonización de la sulfuración y la desprotección para preservar las modificaciones.

Familias populares: fosforamiditas, soportes CPG, sondas y desprotección

Para agilizar la navegación, aquí tienes familias de Thermo Fisher de gran interés que sueles combinar en un solo pedido. Úsalas como categorías de referencia para la navegación y el filtrado interno.

• Fosforamiditas de ADN (bases estándar; formatos de botella para plataformas Expedite/MerMade).

• ARN y fosforamiditas modificadas en 2′ (para RUO mediante desarrollo de procesos).

• Fosforamiditas marcadas con colorante (por ejemplo, 6-FAM para la unión 5′).

• Amiditas estructurales/enlazadoras/espaciadoras (optimizan la longitud/geometría de las sondas y conjugados).

• Soportes/columnas de CPG (universales vs. específicos de nucleósidos; tamaño de poro común de 500 Å).

Guía rápida del comprador: Adaptación de modificaciones, soportes y pureza al caso de uso

Utilice esta hoja de referencia para coordinar decisiones en cuanto a aplicación, pureza y documentación. Confirme los detalles en su POE y el manual del instrumento antes de comprometerse con la escala.

Guía de un vistazo

• Sondas qPCR (estilo TaqMan): 6-FAM (o HEX/TET) + BHQ/MGB; purificadas por HPLC; retienen CoA y cromatogramas.

• Cebadores de PCR de rutina: amiditas de ADN estándar; desalinizador/OPC; CPG universal; botellas compatibles con instrumentos (Expedite/MerMade).

• Adaptadores/índices NGS: mayor pureza (HPLC/PAGE según sea necesario); garantizar la fosforilación terminal si es necesario; documentar el lote y la versión del método.

• Oligonucleótidos de captura funcionalizados: identificadores de biotina/amina/tiol/azida; hacer coincidir la longitud del enlazador con la geometría de unión; almacenar protegido de la luz cuando esté etiquetado.

SKU destacados (números de pieza de Thermo Fisher verificados)

A continuación, se presentan artículos representativos que se utilizan con frecuencia en flujos de trabajo de oligoelementos. Los números de pieza y los nombres de los productos provienen de fuentes de Thermo Fisher; verifique la disponibilidad/región final antes de realizar el pedido.

Preguntas frecuentes sobre la síntesis de ácidos nucleicos: selección, compatibilidad y almacenamiento

Estas preguntas frecuentes eliminan los obstáculos comunes antes de realizar su pedido. Si su caso presenta problemas de borde (por ejemplo, etiquetas internas inusuales o enlaces novedosos), contacte con Iright para una revisión del método.

P1. ¿Qué nivel de purificación debo elegir para las sondas de qPCR?
Para la mayoría de las sondas de colorante 5'/extintor 3', se recomienda la purificación por HPLC para estabilizar las líneas base y los valores de Ct; se puede optar por PAGE para sondas muy cortas o muy modificadas que se benefician de la resolución de tamaño. Mantenga el control de calidad a nivel de lote para garantizar la trazabilidad.

P2. ¿Cómo selecciono pares fluoróforo/extintor?
Comience con la óptica y el plan multiplex de su instrumento. 6-FAM/BHQ-1 es una línea base común; amplíe con canales HEX/TET o Cy, evitando la diafonía espectral. Considere MGB para sondas más cortas con un comportamiento de fusión más preciso.

P3. ¿Estos reactivos funcionarán con mi sintetizador?
Thermo Fisher envía formatos de botella específicos y notas de compatibilidad para las plataformas Expedite y MerMade; siempre haga coincidir la rosca/volumen de la botella y verifique los reactivos del ciclo con su SOP.

P4. ¿Qué documentos se envían con mi pedido?
Disponemos de certificados de análisis (CoA) y especificaciones de producto para amiditas y soportes clave. Conserve los números de lote y cromatogramas para auditorías y transferencia de métodos.

P5. ¿Hay alguna precaución de almacenamiento para las amiditas marcadas con colorante y los CPG?
Proteja los colorantes fotosensibles; consérvelos desecados y a la temperatura recomendada. Deje que los reactivos alcancen la temperatura ambiente antes de abrirlos para minimizar la condensación; vuelva a cerrarlos inmediatamente después de su uso.