Matriz de genotipado de manzana Axiom™ de Thermo Fisher, 550573

Matriz de genotipado de manzana Axiom™ La matriz de genotipado de manzana Axiom™ (Axiom_Apple480) fue diseñada a través del Programa de diseño experto de Affymetrix en colaboración con el consorcio FruitBreedomics (www.
Breedómica de frutas.
cn). La secuenciación y la selección de marcadores fueron realizadas por expertos de la Fondazione Edmund Mach, INRA, la Universidad de Dalhousie, la UR de Wageningen, la Universidad de Bolonia y la Universita Degli Studi Di Milano.
La matriz de 96 formatos incluye marcadores identificados mediante datos de secuenciación del genoma completo de 63 cultivares de Malus domestica y dos accesiones doblemente haploides. La Tabla 1 muestra el número de cultivares y el país de origen correspondiente utilizados en el proceso de descubrimiento de SNP.
Axiom Apple Genotyping Array incluye 480.000 marcadores y, junto con el software Axiom Analysis Suite, supera los desafíos de genotipificación asociados con la poliploidía, la rápida descomposición del desequilibrio de ligamiento (LD) y el alto polimorfismo observado en el genoma de la manzana.
Aspectos destacados de la matriz
• Diversidad muy alta
• Incluye marcadores descubiertos en 63 cultivares de M. domestica en todo el mundo.
• Alta resolución para abordar la rápida descomposición de LD - 487.249 marcadores en la matriz - Sesgo hacia variantes comunes con frecuencia de alelos menores (MAF) >0.
05- Incluye 21.463 marcadores previamente validados: 19.990 marcadores de una matriz de manzanas Fruitbreedomics de 20.000 existente en el mercado y 1.473 marcadores identificados mediante genotipado por secuenciación (GBS).
• Ausencia de variantes parálogas mediante el uso de accesiones haploides dobles en el descubrimiento de SNP Aplicaciones de la matriz de genotipado de Axiom Apple
• Construcción de mapas genéticos de alta resolución
• Mapeo fino de loci de rasgos cuantitativos
• Estudios de asociación de todo el genomaProductos necesariosSoftware de consola de comandos GeneChipInstrumento multicanal GeneTitanAxiom Apple Genotyping Array (Axiom_Apple480) se diseñó a través del Programa de diseño experto de Affymetrix en colaboración con el consorcio FruitBreedomics (www.
Breedómica de frutas.
cn). La secuenciación y la selección de marcadores fueron realizadas por expertos de la Fondazione Edmund Mach, INRA, la Universidad de Dalhousie, la UR de Wageningen, la Universidad Di Bolonia y la Universita-Degli Studi Di Milano.
La matriz de 96 formatos incluye marcadores identificados mediante datos de secuenciación del genoma completo de 63 cultivares de Malus domestica y dos accesiones doblemente haploides. La Tabla 1 muestra el número de cultivares y el país de origen correspondiente utilizados en el proceso de descubrimiento de SNP.
Axiom Apple Genotyping Array incluye 480.000 marcadores y, junto con el software Axiom™ Analysis Suite, supera los desafíos de genotipificación asociados con la poliploidía, la rápida descomposición del desequilibrio de ligamiento (LD) y el alto polimorfismo observado en el genoma de la manzana.
Aspectos destacados de la matrizDiversidad muy altaIncluye marcadores descubiertos en 63 cultivares de M. domestica en todo el mundoAlta resolución para abordar la rápida descomposición de LD487,249 marcadores en la matrizSesgo hacia variantes comunes con frecuencia de alelos menores (MAF) >0.
05Incluye 21.463 marcadores previamente validados: 19.990 marcadores de una matriz de manzanas Fruitbreedomics de 20 000 existente en el mercado y 1.473 marcadores identificados mediante genotipificación por secuenciación (GBS)Ausencia de variantes parálogas mediante el uso de accesiones de doble haploide en el descubrimiento de SNPAplicaciones de Axiom Apple Genotyping ArrayConstrucción de mapas genéticos de alta resoluciónMapeo fino de loci de rasgos cuantitativosEstudios de asociación de todo el genomaTabla 1: País de origen y número de cultivares utilizados en el proceso de descubrimiento de SNP para Axiom Apple Genotyping Array.
País de origen Número de cultivares Australia 1 Europa Central 39 Canadá 1 Irán 1 Simmental 16 Japón 1 Nueva Zelanda 1 Europa del Norte 4 Rusia 9 Túnez 1 Estados Unidos 5 Para uso con (aplicación): Análisis de microarrays
Cantidad: 1 plato
Matriz: Genotipado
Formato: Placa de 96 matrices
Número de matrices: 96 matrices
Especie: Manzana
Tamaño de la unidad: 1 plato