Thermo Fisher, 551189, Matriz de genotipado Axiom™ OVSNP600, formato 96

Matriz de genotipado Axiom™ OVSNP600, formato 96. La matriz de genotipado Axiom OVSNP600, formato 96, contiene 702.183 SNP identificados en venados de cola blanca en libertad y forma parte de nuestra solución de genotipado Axiom Agrigenomics, donde el ADN genómico objetivo se prepara y procesa en el instrumento multicanal GeneTitan. El proceso automatizado incluye la hibridación del ADN genómico con esta micromatriz de alto rendimiento, seguida de tinción, lavado, obtención de imágenes y la generación de datos de genotipado para su posterior análisis.
El conjunto de genotipado Axiom OVSNP600 se diseñó con la colaboración del Departamento de Recursos Naturales de Michigan, la Universidad Estatal de Iowa, la Universidad de Wisconsin-Milwaukee, el Instituto de Investigación de Vida Silvestre Caesar Kleberg de la Universidad Texas A&M-Kingsville y el Centro Nacional de Salud de la Vida Silvestre del USGS. El desarrollo de este conjunto contó con el apoyo de una subvención de la Iniciativa Conjunta sobre Enfermedades de la Vida Silvestre del Departamento de Recursos Naturales de Michigan y la Universidad Estatal de Michigan, y de un programa de apoyo a la investigación de enfermedades de la fauna silvestre de EE. UU.
Subvención para conservación multiestatal del Servicio de Pesca y Vida Silvestre de EE. UU.
El uso de esta matriz de alta densidad permite que los datos generados en diferentes laboratorios se comparen más fácilmente que los datos generados por otros marcadores (p. ej.
p. ej., microsatélites), lo que facilita la colaboración entre laboratorios.
La matriz de genotipado Axiom OVSNP60 también está disponible en formato 384HT (n.° de cat. 551367), que contiene conjuntos de sondas para 72 723 SNP.
Contenido de la matriz
• Conjuntos de sondas para 702.183 SNP identificados en ciervos de cola blanca en libertad, seleccionados entre 89 millones de SNP identificados a través de la resecuenciación del genoma completo de ciervos en libertad de Iowa, Carolina del Norte y Texas, y también seleccionados para garantizar una distribución uniforme en los andamios del genoma de referencia (PRJNA317745)
• Incluye 517,261 SNP que cayeron en la categoría "Mejor y recomendado" en una evaluación inicial de 480 venados de cola blanca en libertad recolectados en 15 estados en el área de distribución oriental de la especie. Aplicaciones
• Identificar regiones genómicas bajo selección e identificar genes candidatos asociados con susceptibilidad a enfermedades, adaptación local u otros fenotipos de interés.
• Asignar paternidad y resolver relaciones entre individuos
• Asignar individuos a la población de origen y cuantificar la hibridación
• Distinguir los ciervos cautivos de los ciervos en libertad.
• Realizar estudios genómicos del paisaje para identificar características del paisaje que facilitan o limitan el movimiento de los ciervos/conectividad de la población. Productos requeridos: Software de consola de comandos GeneChip, instrumento multicanal GeneTitan, software Axiom Analysis Suite, herramienta de exportación de formato largo Axiom (AxLE), cantidad: 96 matrices
Tipo: Matriz de genotipado
Matriz: Genotipado
Formato: Placa de 96 pocillos, formato 96
Número de matrices: 96 matrices
Especie: Venado de cola blanca
Tamaño de la unidad: 96 matrices