Thermo Fisher, 551343, Axiom™ Caprine Genotyping v2 Array, formato 384HT

Matriz de Genotipado Caprino Axiom™ v2, formato 384HT. La Matriz de Genotipado Caprino Axiom v2 es un componente de nuestra solución de Genotipado Axiom Agrigenomics, donde el ADN genómico objetivo se prepara y procesa en el instrumento multicanal GeneTitan. El proceso automatizado incluye la hibridación del ADN genómico con esta micromatriz de alto rendimiento, seguida de tinción, lavado, obtención de imágenes y la generación de los datos de genotipado para su posterior análisis.
La matriz Axiom Caprine Genotyping v2 se diseñó en colaboración con el Consorcio Internacional del Genoma Cabruno y el Consorcio VarGoats. Incluye polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) del chip de cabra Illumina Goat_IGGC_65K_v2 e IMAGE 10K [más información (PDF)]. Esta matriz también incluye inserciones, deleciones y duplicaciones dirigidas por entre 1 y 50 sondas, junto con 59 795 SNP y 265 variantes estructurales.
Esta matriz también está disponible en formato mini-96.
Las características de la matriz Axiom Caprine Genotyping v2 incluyen:
• Un diseño actualizado que incluye el panel SNP de cabra original, lo que permite la compatibilidad con estudios anteriores
• Un diseño innovador que es el primer intento de apuntar a variantes estructurales (esta matriz incluye 265 variantes estructurales) Contenido de la matriz
• Contiene 59.795 SNP seleccionados para matrices de producción de alto rendimiento basadas en la cobertura del genoma y el mejor compromiso para incluir la mayor cantidad de SNP informativos para especies de cabras.
• Los siguientes SNP se incluyeron en el diseño de esta matriz: SNP con diferentes perfiles MAF, SNP elegidos en razas no representadas en el conjunto de datos de descubrimiento, SNP que pueden unirse a los datos actuales de GBS y llenar los vacíos restantes, incluidos los marcadores mitocondriales, SNP en regiones específicas, marcadores Y y variantes estructurales. Aplicaciones
• Estudios de asociación de todo el genoma
• Mejoramiento molecular: mapeo de asociaciones y selección genómica
• Creación de una matriz personalizada seleccionando SNP de esta matriz (se ha demostrado que cada SNP elegido tiene un buen rendimiento) Productos necesarios Software de consola de comandos GeneChip Instrumento multicanal GeneTitan Software Axiom Analysis Suite Herramienta de exportación de formato largo Axiom (AxLE) Para usar con (equipo): reactivos Axiom
Línea de productos: Axiom™
Cantidad: 1 matriz
Condición de envío: Temperatura ambiente
Número de matrices: 384 matrices
Especie: Caprino
Tamaño de la unidad: 1 matriz