Panel de rasgos y trastornos caninos AgriSeq™ de Thermo Fisher, A43406

Thermo Fisher, A43406, Panel de Rasgos y Trastornos Caninos AgriSeq™. El Panel de Rasgos y Trastornos Caninos AgriSeq de Applied Biosystems contiene 154 marcadores dirigidos a rasgos y trastornos caninos clínicamente importantes. El panel incluye SNP y marcadores complejos como MNP e InDels. La mayoría de estos marcadores son comunes a todas las razas, mientras que algunos son específicos de cada raza para ciertos rasgos y afecciones. El Panel de Rasgos y Trastornos Caninos AgriSeq permite la genotipificación simultánea multiplexada mediante el flujo de trabajo de genotipificación dirigida por secuenciación (GBS) de AgriSeq. CanFam 3.
Se utiliza 1 genoma de referencia para el análisis.
La necesidad de una detección altamente consistente de marcadores genéticos informativos es crucial para la detección de rasgos genéticos. Los métodos de GBS dirigidos, como AgriSeq, tienen la ventaja sobre los enfoques de GBS no dirigidos (p. ej.
ej., RADSeq) que son altamente susceptibles a la pérdida de alelos y la falta de datos. Con el flujo de trabajo de AgriSeq, se pueden identificar cientos de miles de marcadores simultáneamente con alta reproducibilidad en diversos conjuntos de muestras. En colaboración con múltiples expertos y laboratorios miembros de ISAG, hemos desarrollado y validado el rendimiento de todos los marcadores del panel, incluyendo 97 SNP, 6 MNP, 13 inserciones y 38 deleciones. El rendimiento del panel se verificó mediante pruebas ortogonales, pruebas de robustez y pruebas de campo con diversas muestras de ADN de hisopos orales caninos. El completo Panel de Rasgos y Trastornos Caninos de AgriSeq está diseñado para ofrecer resultados de genotipado fiables para trastornos y rasgos genéticos de importancia clínica.
Las características del panel de rasgos y trastornos caninos de AgriSeq incluyen:
• Genotipificación reproducible de 154 marcadores dirigidos a 136 trastornos genéticos y 18 rasgos
• Flujo de trabajo simple y de alto rendimiento
• Enfoque personalizable para combinar con marcadores de paternidad e identificación compatibles. Tasa media de identificación de muestras >99 % para marcadores. Una alta tasa de identificación de genotipos y la reproducibilidad son fundamentales para predecir con precisión rasgos y trastornos. Se evaluaron muestras de campo de ADN de hisopos orales caninos altamente diversas mediante el flujo de trabajo AgriSeq dirigido a GBS, con una tasa media de identificación de muestras del 99 %.
Se obtuvo una tasa media de llamadas de muestra del 5% para la mayoría de los marcadores (véase la figura siguiente). La concordancia del genotipo replicado fue >99.
9% y las llamadas fueron altamente concordantes con los datos ortogonales (>99%).
Flujo de trabajo sencillo y de alto rendimiento. El panel de rasgos y trastornos caninos de AgriSeq se ha optimizado para su uso en el flujo de trabajo específico para GBS de AgriSeq. Se pueden agrupar hasta 768 muestras únicas por chip, lo que reduce considerablemente el coste de secuenciación y la mano de obra por animal. Se pueden procesar hasta cuatro placas de 384 pocillos en un solo día y obtener resultados completos de secuenciación en tan solo tres días. La flexibilidad del flujo de trabajo de AgriSeq permite agrupar cientos de muestras en una sola secuenciación dirigida a cientos o miles de marcadores.
Combine el panel de Parentesco e Identificación Canina o personalícelo con marcadores adicionales para maximizar el valor de la prueba. El flujo de trabajo de AgriSeq para GBS es altamente flexible, lo que permite agregar marcadores y paneles compatibles para una genotipificación eficiente y de alto valor. Si busca combinar el análisis de parentesco con marcadores de rasgos específicos o marcadores de defectos genéticos para descartar portadores en programas de mejoramiento genético, nuestro equipo de bioinformáticos en agrigenómica está disponible para ayudarle a diseñar paneles de alto rendimiento.
El panel de rasgos y trastornos caninos de AgriSeq, junto con el flujo de trabajo de AgriSeq, proporciona un método optimizado y rentable para la genotipificación canina de rasgos y trastornos.
NOTA: El CanFam 3.
Se pueden obtener 1 genoma de referencia y otros archivos necesarios para el análisis del Panel de rasgos y trastornos caninos de AgriSeq contactándose con el soporte técnico.
Tipo de producto: Oligonucleótidos personalizados
Cantidad: 960 reacciones
Condición de envío: Aprobado para envío en hielo húmedo o seco
Especie: Perro, Canino
Imprimación: Imprimación personalizada
Línea de productos: AgriSeq™
Tamaño de la unidad: cada una