BD, 571201, Kit de etiquetado y reactivos suplementarios BD Rhapsody™ ATAC-Seq

Reactividad: Humana (Probada en desarrollo)
Aplicación: Experimentos multiómicos de células individuales en la plataforma BD Rhapsody™ (probado durante el desarrollo)
Estado regulatorio: RUO
Descripción: Descripción (página siguiente) Descripción El kit de tagmentación ATAC-Seq y reactivos suplementarios BD Rhapsody™ proporciona los reactivos necesarios para la tagmentación in situ en masa de núcleos individuales aislados de la(s) muestra(s) de interés para la preparación de bibliotecas ATAC-Seq de células individuales con el sistema de análisis de células individuales BD Rhapsody™. Se pueden preparar hasta 8 muestras utilizando este kit antes de la captura de núcleos individuales con el sistema de análisis de células individuales BD Rhapsody™. La tagmentasa del kit es una variante hiperactiva personalizada de la transposasa Tn5 procariota que permite la fragmentación simultánea de regiones abiertas de la cromatina en los núcleos aislados y la inserción de adaptadores de secuenciación en los sitios escindidos. Los adaptadores insertados permiten la amplificación de los fragmentos transpuestos mediante el kit de amplificación BD Rhapsody™ ATAC-Seq o el kit de amplificación BD Rhapsody™ Multiomic ATAC-Seq (se venden por separado), y la secuenciación de estas regiones según las recomendaciones de los protocolos de preparación de las bibliotecas. Los datos obtenidos de las bibliotecas secuenciadas ofrecen mapas genómicos de accesibilidad a la cromatina que delinean la ubicación de los elementos reguladores activos, como promotores, potenciadores y sitios de unión de factores de transcripción, a nivel celular. Antes de utilizar el kit de tagmentación y reactivos suplementarios BD Rhapsody™ ATAC-Seq, se deben realizar los pasos de aislamiento y preparación de los núcleos siguiendo los protocolos recomendados en otros laboratorios para el tipo celular específico de interés. Tras el paso de tagmentación, los usuarios procederán a la captura de núcleos individuales en el sistema de análisis de células individuales BD Rhapsody™ o en el sistema BD Rhapsody™ HT Xpress, utilizando uno de los protocolos indicados en la sección Procedimiento de ensayo recomendado. Además de los reactivos necesarios para el paso de tagmentación, este kit también proporciona un oligonucleótido de férula y los tampones correspondientes para la generación de un dúplex de férula-perla que servirá como sitio de unión para los fragmentos transpuestos tras la captura de los núcleos cargados.
Procedimientos de ensayo recomendados: Antes de añadir el tampón de tagmentación a la mezcla de tagmentación, se debe añadir dimetilformamida (DMF) al 100 % al tampón descongelado, según las instrucciones de los protocolos de preparación de la biblioteca. Para obtener instrucciones detalladas sobre el paso de tagmentación y la preparación de bibliotecas ATAC-Seq independientes, consulte el Protocolo de preparación de bibliotecas ATAC de células individuales (ID de documento: 23-24473). Para obtener instrucciones detalladas sobre el paso de tagmentación y la preparación de bibliotecas ATAC-Seq multiómicas y de análisis del transcriptoma completo, consulte el Protocolo de preparación de bibliotecas ATAC de células individuales y de análisis del transcriptoma completo (WTA) de ARNm (ID de documento: 23-24474). Para obtener instrucciones detalladas sobre el uso del sistema de análisis de células individuales BD Rhapsody™, consulte la Guía del usuario del sistema de análisis de células individuales BD Rhapsody™ HT Xpress (Doc ID 23-24257) o la Guía del usuario del sistema BD Rhapsody™ HT Xpress para flujo de trabajo sin escáner (Doc ID 23-24256). Para la preparación de muestras antes del ensayo ATAC-Seq, consulte el Protocolo de preparación de suspensiones de células individuales del sistema BD Rhapsody™ (Doc ID 23-24126). Para obtener información sobre el proceso bioinformático para el ensayo ATAC-Seq, consulte el Manual de bioinformática BD® Single-Cell Multiomics (Doc ID 54169). Para obtener información sobre seguridad, consulte la Guía del usuario del sistema de análisis de células individuales BD Rhapsody™ (Doc ID 23-24257). Utilice los protocolos de seguridad estándar de laboratorio. Lea y comprenda las hojas de datos de seguridad (HDS) antes de manipular productos químicos. Para obtener las HDS, visite regdocs.bd.com o contacte con el soporte técnico de BD Biosciences en scomix@bdscomix.bd.com. Advertencia: Todas las muestras biológicas y los materiales que entran en contacto con ellas se consideran biopeligrosos. Manipule como si pudieran transmitir infecciones y deséchelos con las precauciones adecuadas de acuerdo con las regulaciones federales, estatales y locales. Nunca pipetee con la boca. Use ropa protectora, gafas y guantes adecuados. Advertencia: 571201 ATAC-Seq Tagmentation Kit, componente del kit 51-9023085 Digitonina. La digitonina contiene 2 % en peso de digitonina, número CAS 11024-24-1, número CE 234-255-6, y 98 % en peso de dimetilsulfóxido, número CAS 67-68-5, número CE 200-664-3. Estos reactivos están clasificados como peligrosos según el Sistema Globalmente Armonizado de Clasificación y Etiquetado de Productos Químicos (GHS). Advertencia Líquido combustible. Nocivo en contacto con la piel. Puede provocar daños en los órganos tras exposiciones prolongadas o repetidas. Prevención Mantener alejado de llamas abiertas/superficies calientes. - No fumar. No respirar polvo/humo/gas/niebla/vapores/aerosol. Llevar guantes/ropa/protección ocular/protección facial. Respuesta EN CASO DE CONTACTO CON LA PIEL: Lavar con abundante agua y jabón. Llamar a un CENTRO DE TOXICOLOGÍA/médico si la persona se encuentra mal. Consultar a un médico/a si la persona se encuentra mal. Quitarse la ropa contaminada y lavarla antes de volver a usarla. En caso de incendio: Utilizar agua pulverizada para extinguirla. En caso de incendio: Utilizar dióxido de carbono para extinguirla. Almacenamiento Almacenar en un lugar bien ventilado. Mantener fresco. Eliminación Eliminar el contenido/el recipiente en una instalación aprobada de acuerdo con las regulaciones locales, regionales, nacionales e internacionales. Advertencia: 571201 Kit de etiquetado ATAC-Seq, componente del kit 51-9022689 Proteinasa K Peligro: La proteinasa K contiene 2,53 % en peso de proteinasa, serina de Tritirachium album, número CAS 39450-01-6, número CE 254-457-8. Estos reactivos están clasificados como peligrosos según el Sistema globalmente armonizado de clasificación y etiquetado de productos químicos (GHS). Peligro Puede provocar síntomas de alergia o asma o dificultades respiratorias si se inhala. Prevención Evite respirar polvo/humo/gas/niebla/vapores/aerosol. [En caso de ventilación inadecuada] use protección respiratoria. Respuesta EN CASO DE INHALACIÓN: Transportar a la persona al exterior y mantenerla en una posición que le facilite la respiración. Si experimenta síntomas respiratorios: Llamar a un CENTRO DE TOXICOLOGÍA o a un médico. Eliminación Eliminar el contenido/el recipiente en una instalación aprobada de acuerdo con las regulaciones locales, regionales, nacionales e internacionales.
Avisos del producto: Consulte los protocolos técnicos en www.bdbiosciences.com/us/s/resources. Dado que las aplicaciones varían, cada investigador debe titular el reactivo para obtener resultados óptimos. Consulte http://regdocs.bd.com para acceder a las fichas de datos de seguridad (FDS). Para conocer las patentes estadounidenses aplicables, consulte bd.com/patents.
Descripción: Cantidad/Tamaño: Número de pieza: ID de EntrezGene
N/D : 1.0 : N/D : N/D