Product Description
Conjunto de cebadores para estudiar la rata CCRN4L en el área de investigación.
Almacenamiento
Se suministra en agua sin nucleasas a una concentración de 5 μM (cada cebador tiene una concentración final de 5 μM). Conservar a -20 °C.
Protocolo
Protocolos disponibles: IP de cromatina
Especificidad / Sensibilidad
Reactividad de la especie: Rata
Fondo
El ensayo de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) es una técnica potente y versátil que se utiliza para investigar las interacciones proteína-ADN en el contexto cromatínico natural de la célula (1,2). Este ensayo puede utilizarse para identificar múltiples proteínas asociadas a una región específica del genoma o para identificar las numerosas regiones del genoma unidas por una proteína en particular (3-6). El ChIP puede utilizarse para determinar el orden específico de reclutamiento de diversas proteínas a un promotor génico o para medir la cantidad relativa de una modificación de histona específica en todo un locus génico (3,4). Además de las proteínas histonas, el ensayo ChIP puede utilizarse para analizar la unión de factores de transcripción y cofactores, factores de replicación del ADN y proteínas reparadoras del ADN. Al realizar el ensayo ChIP, las células se fijan primero con formaldehído, un agente de entrecruzamiento reversible proteína-ADN que preserva las interacciones proteína-ADN que ocurren en la célula (1,2). Las células se lisan y la cromatina se recolecta y fragmenta mediante sonicación o digestión enzimática. Posteriormente, la cromatina fragmentada se inmunoprecipita con anticuerpos específicos para una proteína o modificación de histona en particular. Cualquier secuencia de ADN asociada con la proteína o modificación de histona de interés coprecipitará como parte del complejo de cromatina reticulada, y la cantidad relativa de dicha secuencia de ADN se enriquecerá mediante el proceso de inmunoselección. Tras la inmunoprecipitación, se revierten los enlaces cruzados proteína-ADN y el ADN se purifica. La PCR estándar o la PCR cuantitativa en tiempo real se utilizan a menudo para medir el grado de enriquecimiento de una secuencia de ADN específica mediante una inmunoprecipitación específica para la proteína (1,2). Como alternativa, el ensayo ChIP puede combinarse con técnicas de microarray de teselación genómica (ChIP en chip), secuenciación de alto rendimiento (ChIP-Seq) o estrategias de clonación, todas las cuales permiten el análisis de todo el genoma de las interacciones proteína-ADN y las modificaciones de histonas (5-8). Los cebadores SimpleChIP se han optimizado para la amplificación de ADN aislado de ChIP mediante PCR cuantitativa en tiempo real y proporcionan controles positivos y negativos importantes que pueden usarse para confirmar un experimento de ChIP exitoso.
Nombres alternativos
chip; IP de cromatina; nocturnina; pcr; cebador; cebadores; simplechip
Especificación
REACTIVIDAD: R
Order Guidelines
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Collaboration
Tony Tang
Email: Tony.Tang@iright.com
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