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La histona H3 es una de las cinco principales proteínas histonas implicadas en la estructura de la cromatina en células eucariotas. Con un dominio globular principal y una larga cola N-terminal, la H3 participa en la estructura de los nucleosomas en forma de "perlas en una cuerda". La cola N-terminal de la histona H3 sobresale del núcleo globular del nucleosoma y puede sufrir diversos tipos de modificaciones epigenéticas que influyen en los procesos celulares. Estas modificaciones incluyen la unión covalente de grupos metilo o acetilo a los aminoácidos lisina y arginina, y la fosforilación de serina o treonina. La acetilación de la histona H3 ocurre en varias posiciones diferentes de lisina en la cola de la histona y es realizada por una familia de enzimas conocidas como histona acetil transferasas (HAT). La acetilación de la lisina14 se observa comúnmente en genes que se transcriben activamente en ARN.
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