Merck, 17-371, EZ-ChIP

La inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) es una técnica importante que permite al investigador analizar in vivo las interacciones de proteínas con ADN genómico. Cualquier proteína asociada a la cromatina o de unión al ADN puede analizarse con esta técnica, siempre que exista un buen anticuerpo contra la proteína. Se pueden medir diferentes proteínas localizadas en una región específica del genoma, o la distribución genómica de una proteína específica. Otra aplicación importante de esta técnica es analizar los cambios en las modificaciones de histonas que se correlacionan con procesos como la transcripción, la mitosis o la reparación del ADN. La inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) es una técnica eficaz para mapear la distribución in vivo de proteínas asociadas al ADN cromosómico. Estas proteínas pueden ser subunidades de histonas y modificaciones postraduccionales u otras proteínas asociadas a la cromatina, como factores de transcripción, reguladores de la cromatina, etc. Además, la ChIP puede utilizarse para identificar regiones del genoma asociadas con estas proteínas o, a la inversa, para identificar proteínas asociadas con una región particular del genoma. La metodología ChIP a menudo implica la reticulación proteína-ADN y proteína-proteína, la fragmentación de la cromatina reticulada y la posterior inmunoprecipitación de la cromatina con un anticuerpo específico para una proteína diana. Los fragmentos de ADN aislados en complejo con la proteína diana pueden identificarse mediante diversos métodos, como PCR, microarreglos de ADN y secuenciación de ADN. Se puede realizar PCR estándar o cuantitativa para verificar si una secuencia de ADN particular (el gen o la región del genoma) está asociada con la proteína de interés. La combinación de ChIP y microarreglos de promotores o teselado genómico (ChIP-chip) permite la identificación, a nivel de todo el genoma, de los sitios de unión al ADN para las proteínas asociadas a la cromatina con una resolución precisa. Como alternativa, la secuenciación de alto rendimiento de bibliotecas construidas a partir de ADN cromosómico inmunoprecipitado (ChIP-Seq) es una potente alternativa a ChIP-chip para el mapeo de las interacciones proteína-ADN en los genomas de mamíferos.