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El análisis de la expresión génica se realiza comúnmente mediante transfección transitoria. Estos sistemas suelen basarse en el uso de genes de fusión que se insertan en las células, y la expresión del gen se analiza dentro de las 48 horas posteriores a la introducción del ADN. Generalmente, la fusión consiste en el sitio de unión del promotor o la secuencia potenciadora en estudio, que se une a un gen reportero. Se presume que la cantidad de proteína reportera sintetizada en las condiciones experimentales refleja la capacidad de las secuencias estudiadas para dirigir o promover la transcripción. La luciferasa se ha convertido en una de las enzimas reporteras más utilizadas. El plásmido reportero contiene el gen de la luciérnaga Photinus pyralis. La enzima cataliza una reacción bioluminiscente que requiere el sustrato luciferina, así como Mg⁺² y ATP. La mezcla de estos reactivos con el extracto celular que contiene luciferasa produce un destello de luz que se desintegra rápidamente. Esta luz puede detectarse mediante un luminómetro. La emisión total de luz es proporcional a la actividad luciferasa de la muestra. El ensayo de luciferasa es rápido y sensible, y no requiere un sustrato radiactivo como el ensayo CAT. Una desventaja del ensayo de luciferasa es que requiere un instrumento bastante costoso, el luminómetro, para medir la actividad enzimática.
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