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Categorías relacionadas Marcadores y escaleras de ARN, Marcadores y escaleras de ARN Especificación Bases Fragmento pb 1 500 2 300 3 150 4 80 5 50 6 30 7 21 Rango de tamaño efectivo 21 pb a 500 pb Tampón de almacenamiento Tris-HCl 10 mM EDTA 1 mM pH 8 a 25 °C Preguntas frecuentes P: ¿Qué tipos de geles se recomiendan para las escaleras de ssRNA y dsRNA? (N0363, N0362, N0364) R: En general, cuando se trabaja con moléculas de ARN monocatenario, se debe utilizar un gel desnaturalizante, un tampón/colorante de carga de muestra desnaturalizante que contenga formamida o urea y SYBR Gold para la tinción. El tinte SYBR Gold se une preferentemente a las moléculas monocatenarias y, por lo tanto, proporciona una buena visualización de las bandas después de la electroforesis en gel. En algunos casos, cuando las moléculas de ARNmc son grandes, como en el caso de la escalera de ARNmc (N0362S), se puede usar un gel nativo y teñirlo con bromuro de etidio. Sin embargo, tenga en cuenta que las muestras de ARNmc siempre deben prepararse con un tampón/colorante de carga de muestra desnaturalizante que contenga formamida o urea. Cuando se trabaja con moléculas de ARN bicatenario, solo se necesita usar un gel nativo, un tampón/colorante de carga de muestra no desnaturalizante y teñir el gel con bromuro de etidio, SYBR Green o SYBR Safe. P: ¿Qué tipos de gel y colorantes de tinción puedo usar para la escalera de ARNmc de NEB (N0363S)? R: Definitivamente, se necesita usar un gel nativo como agarosa-TBE al 2,0 %, como se recomienda en el protocolo para ejecutar la escalera de ARNmc. La escalera se prepara para la electroforesis en gel utilizando un tampón/colorante de carga de muestra libre de ARNasa y no desnaturalizante (similar a los utilizados para preparar muestras de ADN). A continuación, el gel se tiñe con bromuro de etidio, SYBR Green o SYBR Gold.
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