Qiagen, 15048976, Sistema de secuenciación MiSeq FGx

El sistema de secuenciación MiSeq FGx es un instrumento NGS de escritorio con software integrado para la configuración de la ejecución, la interpretación de los resultados y la generación de informes.

Características

- Secuenciador de sobremesa de alto rendimiento con pantalla táctil intuitiva y reactivos de carga y uso
- Capacidad avanzada para procesar muestras de ADN desafiantes
- Interroga cientos de marcadores en un solo flujo de trabajo
- Flexibilidad optimizada para aplicaciones de identificación humana

Detalles del producto

El sistema de secuenciación MiSeq FGx es el primer y único instrumento de secuenciación de nueva generación (NGS) diseñado, desarrollado y validado para la genómica forense. Al combinar la calidad comprobada de los datos con la facilidad de uso, el sistema es clave para una solución única y de plataforma única basada en la tecnología NGS de referencia. Prepare y secuencie bibliotecas, y analice datos en un único flujo de trabajo, diseñado para adaptarse a una creciente cartera de aplicaciones, incluyendo nuevas herramientas como la Genealogía Genética Investigativa Forense (FIGG). Los kits de reactivos específicos y el software de análisis adaptado facilitan la búsqueda de respuestas para todas las investigaciones de identificación humana.

Actuación

Característica: Detalles
Rendimiento: 1–384 muestras por ejecución, según el ensayo
Longitud máxima de lectura: 2 x 300 pb, según el ensayo
Salida (ejecución de 2 x 150 pb): ≥ 5 Gb
Lecturas que pasan los filtros: 25 millones
Puntuación Q30 (con una longitud de lectura de 2 x 150 pb): ≥ 80 %
Precisión general total: ≥ 99,66%
Reproducibilidad global total: ≥ 99,7%
Biomoléculas que se pueden secuenciar: ADNg, ARN, ADNmt
Modos: Forense (FGx) y Solo para uso en investigación (RUO)
Requisitos de alimentación: 100–240 V CA a 50/60 Hz, 10 A, 400 W
Radiofrecuencia RFID: 13,56 MHz
Potencia RFID: 100 mW
Dimensiones: 68,6 cm × 56,5 cm × 52,3 cm (27 pulgadas × 22,2 pulgadas × 20,6 pulgadas)
Peso: 54,5 kg (120 libras)

El sistema MiSeq FGx es fundamental para un flujo de trabajo validado, diseñado específicamente para laboratorios forenses. El sistema cuenta con un soporte completo, con certificaciones de rendimiento y mantenimiento disponible, que se ajustan a los requisitos de un laboratorio forense. Basándose en la velocidad y precisión de la química de secuenciación por síntesis (SBS) de Illumina, el sistema MiSeq FGx incorpora el enfoque sin precedentes de la genómica forense a la NGS, ofreciendo a la justicia penal un poderoso aliado.

Análisis superior de mezclas complejas de ADN y ADN degradado

El flujo de trabajo de secuenciación integrado consolida la preparación, la secuenciación y el análisis de la biblioteca.

Capacidad avanzada con longitudes de lectura ajustables, modos de ejecución dual y dos celdas de flujo

El sistema MiSeq FGx es el primer y único instrumento que analiza hasta 96 bibliotecas combinadas de SNP y STR en una sola ejecución. El sistema MiSeq FGx preserva muestras valiosas a la vez que demuestra un rendimiento robusto, generando perfiles de ADN más completos y detallados a partir de una amplia gama de tipos de muestras, moléculas biológicas y en todo el espectro de calidad, desde ADN genómico (ADNg) de alta calidad hasta muestras degradadas, mixtas y limitadas.

Dos modos de ejecución facilitan diversas aplicaciones de genómica forense, manteniendo la flexibilidad necesaria para trabajar en un entorno de investigación. Alterne fácilmente entre dos kits de secuenciación para ajustar el resultado a la aplicación actual o al tamaño del lote de muestra. Basado en la química Illumina SBS líder en la industria, el sistema MiSeq FGx cumple estrictos requisitos de rendimiento para obtener resultados completos y concluyentes. Elimine prácticamente todos los errores específicos del contexto, incluso en regiones de secuencia repetitiva u homopolímeros, y responda a una gama más amplia de preguntas en un único ensayo específico con capacidad de multiplexación. Una interfaz táctil intuitiva simplifica el funcionamiento del instrumento y el sistema monitoriza las métricas de calidad y rendimiento durante la ejecución. Tras la secuenciación, el análisis se inicia automáticamente y se completa en menos de una hora.

Principio

En comparación con el análisis basado en el tamaño de repeticiones cortas en tándem (STR) mediante electroforesis capilar (CE), la NGS detecta el espectro completo de variación genética en una muestra de ADN con resultados más rápidos que otras tecnologías. Con una sensibilidad inherente, la tecnología NGS de ForenSeq va más allá del tamaño del fragmento para identificar la variación subyacente en la secuencia. Los resultados completos se entregan de forma rápida y clara, mostrando secuencias base por base para una interpretación sencilla y con la máxima confianza. Basándose en las capacidades de los STR, la NGS aporta otras ventajas a la genómica forense moderna, como el análisis de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) nucleares, ADN mitocondrial (ADNmt), ARN mensajero (ARNm) y marcadores epigenéticos, lo que refuerza los casos que requieren identificación humana y elimina la necesidad de sopesar las limitaciones técnicas con datos potencialmente informativos. Obtenga resultados superiores en una sola secuenciación.

El sistema MiSeq FGx logra una calidad de datos excepcional mediante un método patentado basado en terminadores reversibles que detecta bases individuales a medida que se incorporan a cadenas de ADN masivamente paralelas. Los colorantes terminadores fluorescentes se visualizan a medida que se añade cada desoxinucleótido trifosfato (dNTP) y se escinde para permitir la incorporación de la siguiente base. Con los cuatro dNTP reversibles unidos a terminadores presentes en cada ciclo de secuenciación, la competencia natural entre bases minimiza el sesgo de incorporación. El software realiza llamadas de bases directamente a partir de las mediciones de intensidad de señal durante cada ciclo de incorporación, lo que reduce las tasas de error bruto en comparación con otras tecnologías. El resultado es una secuenciación base a base de alta precisión que minimiza los errores específicos del contexto de la secuencia, incluso en regiones de secuencia repetitivas u homopolímeros.

Procedimiento

Las bibliotecas secuenciadas en el sistema MiSeq FGx siguen el mismo flujo de trabajo básico de NGS: preparación de bibliotecas, secuenciación y análisis. El primer paso utiliza un kit de preparación de bibliotecas para añadir cebadores al ADN genómico (ADNg), ADNmt o ARNm extraído de muestras forenses para la captura y amplificación simultánea de cientos de regiones diana, generando bibliotecas de doble indexación listas para la secuenciación. Tras la preparación de la biblioteca, los reactivos de carga rápida agilizan la configuración del análisis. Simplemente descongele el cartucho de reactivos precargado, añada las bibliotecas al cartucho e introdúzcalo en el instrumento. El software del sistema acepta los parámetros del análisis e inicia la secuenciación con solo pulsar un botón.

Aplicaciones

El sistema MiSeq FGx ofrece capacidades en todas las moléculas biológicas y un número creciente de aplicaciones, incluyendo análisis de parentesco de corto y largo alcance. Las longitudes de lectura ajustables, las opciones de celda de flujo y la selección de modos de ejecución brindan una flexibilidad sin precedentes para adaptar la salida de datos a una gama cada vez mayor de necesidades de identificación humana. El sistema MiSeq FGx ofrece una capacidad mejorada para analizar ADN degradado, ADN de baja cantidad, mezclas complejas de ADN y otras muestras complejas que pueden complicar o desbaratar una investigación. Los amplicones de pequeño tamaño son ideales para la interrogación de ADN degradado, mientras que un gran número de marcadores, incluyendo muchos altamente polimórficos, mejoran la capacidad del sistema para discernir componentes menores de bajo nivel que la CE podría no detectar. Además, una sola ejecución de secuenciación interroga cientos de marcadores genéticos con relevancia forense, eliminando la necesidad de elegir entre kits STR basados ​​en la longitud de fragmentos o de realizar concesiones para adaptarse a muestras complejas.