Qiagen, 19092, Tubos de lisis de patógenos L

50 tubos de lisis de patógenos con perlas grandes, 1 vial de reactivo DX

Características

- Aislamiento de ADN bacteriano a partir de hisopos y fluidos corporales.
- Agotamiento efectivo del ADN del huésped
- Lisis celular mecánica y química optimizada
- Columnas ultralimpias para minimizar el riesgo de contaminación

Detalles del producto

Nuevo kit disponible: El kit QIAamp DNA Host-Free Microbiome ya está disponible. Aísla el ADN microbiano de tejidos, fluidos corporales e hisopos, y elimina eficazmente el ADN genómico del huésped.

El kit QIAamp DNA Microbiome es una solución específica para la purificación y el enriquecimiento del ADN del microbioma bacteriano a partir de hisopos y fluidos corporales. La eliminación eficaz del ADN del huésped durante el proceso de purificación maximiza la cobertura del ADN bacteriano en el análisis de secuenciación de nueva generación y permite el análisis del microbioma basado en el ADNr 16S de alta sensibilidad y estudios de secuenciación shotgun del metagenoma completo.

Actuación

El alto porcentaje de lecturas atribuidas al genoma del huésped en experimentos de secuenciación shotgun de metagenoma completo hace que el ensamblaje adecuado de conjuntos de datos microbianos requiera mucho tiempo y recursos, incluso con herramientas bioinformáticas sofisticadas. Al eliminar el ADN del huésped en una muestra, el kit QIAamp DNA Microbiome proporciona muestras con una composición bacteriana enriquecida para la secuenciación shotgun de metagenoma completo. Se realizó una comparación de lecturas de experimentos de secuenciación shotgun de metagenoma completo en ADN aislado de hisopos bucales humanos, donde las muestras se prepararon con el kit QIAamp DNA Microbiome o soluciones de otros 2 proveedores. La secuenciación de muestras preparadas con el kit QIAamp DNA Microbiome resultó en menos del 5% de lecturas humanas, una reducción significativa en comparación con más del 90% de lecturas con un kit que no incluye la eliminación de ADN del huésped y el 35% con un kit que sí la incluye. En un segundo experimento, las muestras se enriquecieron con bacterias cultivadas conocidas. El ADN bacteriano se recuperó con mayor representación en comparación con una solución sin eliminación del ADN del huésped (ver figura La eliminación efectiva del ADN del huésped mejora los resultados de la secuenciación shotgun del metagenoma completo).

Amplificación mejorada para la secuenciación del ADNr 16S

La secuenciación del ADNr 16S se utiliza habitualmente para determinar la composición relativa de la comunidad microbiana. El kit QIAamp DNA Microbiome permite la amplificación más eficiente de la región V4 del ADN purificado a partir de hisopos bucales, en comparación con otros tres kits de purificación (véase la figura "Amplificación y secuenciación eficientes del ADNr 16S"). Los resultados de la secuenciación de la región V4 amplificada de dos muestras purificadas con el kit QIAamp DNA Microbiome también muestran la composición bacteriana esperada, representativa del microbioma oral humano.

Aplicaciones

- Análisis de secuenciación del genoma completo
- Análisis del microbioma basado en ADNr 16S de alta sensibilidad
- Estudios de secuenciación metagenómica de escopeta

El kit de microbioma de ADN QIAamp purifica y enriquece el ADN del microbioma bacteriano de muestras mixtas para su uso en aplicaciones posteriores sensibles, como: