Qiagen, 333088, Kit de transcriptoma QIAseq UPX 3' (96)

Para el análisis de la expresión génica 3' de células o ARNm de 8 a 96 muestras a la vez; cada kit contiene solución de lisis celular, tampones, oligos y enzimas liofilizados en una placa de 96 pocillos que se puede separar fácilmente para procesar de 8 a 96 muestras en paralelo (este formato es ideal tanto para tamaños de muestra pequeños como grandes)
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Características

- Comience con 10 pg a 10 ng de ARN total aislado, lisados ​​celulares
- El etiquetado UPX permite entre 4608 y 18 432 muestras por carril de secuenciación individual
- Los UMI eliminan el sesgo de amplificación de la biblioteca para una expresión genética precisa
- Química mejorada con LNA para mayor precisión, especificidad y sensibilidad
- Incluye acceso al portal de análisis de ARN-seq para muestras humanas, de ratón y de rata.

Detalles del producto

Los kits de transcriptoma QIAseq UPX 3' permiten el análisis de expresión génica de alto rendimiento a partir de lisados ​​celulares y ARN total aislado. Cada kit contiene 96 o 384 bibliotecas, con formatos que incluyen placas multicapa de 96 pocillos o placas desechables de 384 pocillos con cebadores de transcripción inversa ya liofilizados en el fondo para facilitar su uso. Para generar bibliotecas de ARN-seq, simplemente añada células o hasta 10 ng de ARN total para reconstituir una reacción de transcripción inversa. Tras la síntesis de ADNc, combine cada placa en un solo tubo para completar la preparación de la biblioteca. El kit incluye todos los reactivos necesarios para comenzar con células (como reactivos de lisis) o ARN.

Analice datos de ARN-seq 3' con facilidad utilizando el Portal de análisis de ARN-seq integrado en GeneGlobe: una solución de análisis de datos intuitiva basada en la web creada para biólogos e incluida en los kits de transcriptoma QIAseq UPX 3'.

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Principio

Los kits de transcriptoma QIAseq UPX 3' permiten la secuenciación de secuenciación (NGS) de alto rendimiento, "de la muestra a la información", de ARN poliadenilados a partir de lisados ​​celulares o ARN aislado en instrumentos Illumina NGS. Están diseñados para la construcción de bibliotecas y el análisis de pellets celulares (hasta 100 células) o ARN purificado (de 10 pg a 10 ng). Los kits de transcriptoma QIAseq UPX 3' presentan una ventaja innovadora: durante la transcripción inversa, cada célula se etiqueta con un ID único (hasta 384 ID diferentes) y cada molécula de ARN se etiqueta con un Índice Molecular Único (UMI). Tras la transcripción inversa con intercambio de molde integrado, se pueden combinar todos los ADNc etiquetados individualmente, lo que permite realizar todos los pasos posteriores de la construcción de la biblioteca en un solo tubo. Esto evita la mezcla de muestras, ahorra tiempo considerablemente y reduce drásticamente los costes de preparación de la biblioteca. Durante la amplificación y la construcción de la biblioteca posteriores, se pueden asignar hasta 48 ID de muestra diferentes. La combinación de identificadores de células y de muestras permite secuenciar hasta 18 432 bibliotecas. El portal de análisis de ARN-seq integrado en GeneGlobe facilita el mapeo primario y el análisis de expresión diferencial.

Procedimiento

Flujo de trabajo innovador y optimizado

El kit de transcriptoma QIAseq UPX 3' define una nueva generación de tecnologías NGS de alto rendimiento en el flujo de trabajo Sample to Insight de QIAGEN. El ARN purificado o el ARN de lisados ​​celulares se somete primero a transcripción inversa y a cada molécula de ARN se le asigna un índice molecular único (UMI) y se le asignan identificadores específicos de pocillo (hasta 384 pocillos; identificadores de célula). Tras la transcripción inversa con intercambio de molde integrado, se combinan todos los ADNc, lo que permite simplificar la construcción de la biblioteca en un solo tubo. Durante la amplificación y la construcción de la biblioteca posteriores, se pueden asignar hasta 48 índices de biblioteca diferentes (identificadores de muestra). La combinación de identificadores de célula e identificadores de muestra permite secuenciar simultáneamente hasta 18.432 bibliotecas (véanse las figuras "Flujo de trabajo innovador y optimizado del kit de transcriptoma QIAseq UPX 3'" y "Flujo de trabajo del transcriptoma QIAseq UPX 3' Sample to Insight de QIAGEN").

Análisis conveniente de datos de GeneGlobe

El análisis de datos basado en la nube QIAseq UPX está disponible a través del Centro de análisis de datos GeneGlobe y proporciona alineaciones de lectura, UMI y demultiplexación de muestras, con análisis de expresión genética de bajo consumo.

Aplicaciones

- Aplicaciones de detección de alto rendimiento (por ejemplo, investigación toxicológica)
- Análisis de la expresión genética diferencial