Qiagen, 333262, QIAseq FastSelect –Kit de moscas de ARNr (24)

Para 24 reacciones: reactivo de eliminación de ARNr citoplasmático y mitocondrial; compatible con moscas

Características

- Compatible con los kits de bibliotecas de secuenciación de ARN de cadena QIAGEN, Illumina, NEB y KAPA
- Reactivo único para muestras de Drosophila melanogaster (mosca)
- Eliminación de ARNr y/o globina de alto rendimiento en solo 14 minutos
- Solo un paso de pipeteo: combine el reactivo QIAseq FastSelect con ARN e incube
- No se requieren pasos de limpieza adicionales ni cambios en el protocolo de la biblioteca NGS

Detalles del producto

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly utilizan un método novedoso para eliminar ARN muy abundante y de bajo valor científico de las bibliotecas de ARN-seq. Los investigadores que utilizan ARN-seq para el análisis del transcriptoma completo pueden usar los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly para eliminar todos los ARNr anotados en RefSeq y Ensembl para la mosca Drosophila melanogaster. Dependiendo de la homología de la secuencia de ARNr, QIAseq FastSelect −rRNA Fly funcionará con otras especies de mosca (dependiendo de la homología de la secuencia de ARNr diana con D. melanogaster).

Analice datos de RNA-seq con facilidad utilizando el Portal de análisis de RNA-seq integrado en GeneGlobe: una solución de análisis de datos intuitiva basada en la web creada para biólogos e incluida con este kit QIAseq

Recomendamos usar los kits de biblioteca de ARN de cadena QIAseq para una preparación robusta de bibliotecas de secuenciación de ARN específicas de cadena para ARN de alta calidad y altamente fragmentado (FFPE). Los kits de biblioteca de ARN de cadena QIAseq utilizan un sistema de indexación dual (UDI) único que permite la multiplexación de hasta 384 muestras por carril de celda de flujo en los instrumentos Illumina NGS y mitiga los saltos de índice en las celdas de flujo Illumina NovaSeq y con patrón de Illumina. Diseñe sus propios grupos QIAseq FastSelect personalizados para eliminar cualquier ARN que desee de su biblioteca de secuenciación de ARN: consulte nuestros kits de eliminación de ARN personalizados QIAseq FastSelect.

¿Quieres probar el kit QIAseq FastSelect -rRNA Plant por primera vez? Solicita un kit de prueba para evaluarlo. >

Actuación

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly proporcionan una eliminación altamente eficiente de ARNr (figura Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly proporcionan una eliminación altamente eficiente de ARNr) y un mapeo de lectura consistente (figuras Mapeo de exones/intrones/intergénicos de QIAseq FastSelect –rRNA Fly, QIAseq FastSelect ‒rRNA Fly cambia drásticamente la asignación de lecturas de ARNr a genes y QIAseq FastSelect ‒rRNA Fly cambia drásticamente la asignación de lecturas de ARNr a genes: gráfico de barras).

Principio

La eliminación de transcripciones de ARN altamente expresadas, pero biológicamente poco importantes, aumenta la eficiencia de la NGS y permite un mayor rendimiento de las muestras con mayor sensibilidad. Además, la eliminación de especies de ARN no deseadas de muestras de ARN completas y fragmentadas puede ser especialmente compleja y puede resultar en un rendimiento deficiente.

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly están diseñados para la eliminación rápida y eficiente del ARN ribosómico de mosca citoplasmático y mitocondrial del ARN total durante la preparación de bibliotecas de ARN NGS. QIAseq FastSelect se integra a la perfección con su flujo de trabajo de preparación de bibliotecas de ARN de cadena existente para la eliminación del ARN en un solo paso en línea de 14 minutos. Antes de la fragmentación térmica del ARN (opcional y dependiente del kit de preparación de la biblioteca y del tipo de muestra), el reactivo de eliminación QIAseq FastSelect se combina directamente con el ARN total y los tampones específicos para la preparación de la biblioteca. Tras la fragmentación, la temperatura de reacción se reduce gradualmente a temperatura ambiente y se completan los pasos restantes de la preparación de la biblioteca. No es necesario realizar ningún tipo de enriquecimiento en las muestras de ARN total. Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly garantizan un alto rendimiento constante con cantidades de ARN que van desde tan solo 1 ng hasta 1 μg. QIAseq FastSelect se puede utilizar con ARN de muestras frescas de muchas especies de moscas (dependiendo de la homología de la secuencia de ARNr objetivo con D. melanogaster) y ofrece una eliminación confiable de ARNr y una alta reproducibilidad en aplicaciones posteriores.

Procedimiento

La mayoría de las estrategias de eliminación o depleción de ARN asociadas con la construcción de bibliotecas de ARN-seq son estrategias de pretratamiento de muestras que implican la captura híbrida o la eliminación enzimática del ARN no deseado. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es compatible con QIAGEN, Illumina, KAPA, NEB y otros kits de bibliotecas de ARN, y permite la eliminación completa del ARNr en un solo paso en línea de 14 minutos (véase la figura del flujo de trabajo del kit QIAseq FastSelect). Esto es considerablemente más rápido que los kits de depleción de ARN alternativos, que requieren protocolos de pretratamiento de más de 25 pasos y 2 horas de duración.

Simplemente añada el reactivo QIAseq FastSelect a la muestra de ARN, realice la fragmentación (si es necesario), enfríe la reacción gradualmente de 75 °C a 25 °C durante 14 minutos y, a continuación, complete los pasos restantes de preparación de la biblioteca. QIAseq FastSelect funciona con o sin fragmentación de ARN, lo que ofrece la flexibilidad de usar ARN fragmentado de muestras de mosca o ARN de alta calidad como parte de un flujo de trabajo estándar de construcción de bibliotecas de ARN-seq.

Aplicaciones

QIAseq FastSelect permite la extracción rápida y fiable de ARN de muestras de ARN completo o fragmentado de diversas especies de moscas (dependiendo de la homología de la secuencia de ARNr diana con D. melanogaster). Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Fly están disponibles en diversos formatos y tamaños para adaptarse a sus aplicaciones específicas.