Qiagen, 333275, kit de epidemiología QIAseq FastSelect (96)

Para 96 ​​reacciones: reactivo de eliminación de ARNr panbacteriano 5S/16S/23S; reactivo de eliminación de ARNr citoplasmático y mitocondrial para humanos, ratones y ratas

Características

- Compatible con los kits de bibliotecas de secuenciación de ARN de cadena QIAGEN, Illumina, NEB y KAPA
- Proporciona eliminación de ARNr 5S/16S/23S panbacteriano de ARN fragmentado o de longitud completa, y eliminación de ARNr citoplasmático y mitocondrial para humanos, ratones, ratas y especies relacionadas.
- Reactivos separados para bacterias y HMR (humanos, ratones y ratas) para mayor flexibilidad en aplicaciones de secuenciación simple o dual.
- El procedimiento simple funciona con los flujos de trabajo existentes para ahorrar tiempo

Detalles del producto

Los kits de epidemiología QIAseq FastSelect están diseñados para la construcción de bibliotecas de ARN-seq de "secuencia dual" o "huésped-patógeno". Los investigadores que utilizan los kits de epidemiología QIAseq FastSelect para la construcción de bibliotecas de ARN-seq eliminarán el ARNr bacteriano 5S/15S/23S y el ARN ribosómico citoplasmático y mitocondrial humano, de ratón y de rata. Los reactivos para la eliminación de ARNr bacteriano y HMR se suministran en tubos separados, lo que permite a los investigadores optimizar sus flujos de trabajo de ARN-seq para muestras de doble seq, bacterianas o HMR. Los kits de epidemiología QIAseq FastSelect utilizan un método novedoso para eliminar ARN muy abundante y de bajo valor científico de sus bibliotecas de ARN-seq. Se han probado con los kits de bibliotecas de ARN-seq de QIAGEN, Illumina, Roche/KAPA y NEB, y son compatibles con todos los métodos principales de preparación de bibliotecas de ARN-seq. El protocolo simple FastSelect de 14 minutos y la posterior limpieza basada en perlas se integra perfectamente con todos los kits de bibliotecas de ARN-seq comunes y se pueden usar en ARN fragmentado o de longitud completa (no fragmentado).

Analice datos de ARN-seq con facilidad utilizando el Portal de análisis de ARN-seq integrado en GeneGlobe: una solución de análisis de datos intuitiva basada en la web creada para biólogos e incluida con este kit QIAseq.

Recomendamos usar los kits de biblioteca de ARN de cadena QIAseq para una preparación rápida y robusta de bibliotecas de ARN-seq específicas de cadena, tanto para ARN de alta calidad como para ARN altamente fragmentado. Diseñe sus propios grupos QIAseq FastSelect personalizados para eliminar cualquier ARN que desee de su biblioteca de ARN-seq: consulte nuestros kits de eliminación de ARN personalizados QIAseq FastSelect.

¿Quieres probar el kit de epidemiología QIAseq FastSelect por primera vez? Solicita un kit de prueba para evaluarlo.

Principio

La eliminación de transcripciones de ARN altamente expresadas, pero biológicamente poco importantes, aumenta la eficiencia de la NGS y permite un mayor rendimiento de las muestras con mayor sensibilidad. Además, la eliminación de especies de ARN no deseadas de muestras de ARN completo y fragmentado puede ser especialmente compleja y resultar en un rendimiento subóptimo. Los kits de epidemiología QIAseq FastSelect son kits de eliminación de ARN ribosómico (ARNr) panbacteriano, diseñados para eliminar ARNr 5S, 16S y 23S, así como ARN ribosómico citoplasmático y mitocondrial humano, murino y de rata, de muestras complejas. Nuestro completo reactivo de eliminación de ARNr se ha diseñado utilizando secuencias de ARNr 16S (casi 600.000 entradas), 23S (casi 170.000 entradas) y 5S (más de 7200 entradas). El modelado in silico predice una eliminación de ARNr superior al 95 % de todas las secuencias de ARNr 5S, 16S y 23S conocidas. Los kits de epidemiología QIAseq FastSelect admiten cantidades de ARN desde tan solo 20 ng hasta 1 µg, con un alto rendimiento constante, y son compatibles con ARN de longitud completa de baja calidad, altamente fragmentado o de alta calidad. Dado que QIAseq FastSelect no utiliza digestión enzimática ni procedimientos de captura híbrida, su flujo de trabajo rápido y sencillo permite una eliminación fiable del ARNr y una alta reproducibilidad en aplicaciones posteriores. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es significativamente más rápido que los métodos existentes y los kits de epidemiología QIAseq FastSelect se han probado con los kits de bibliotecas de secuenciación de ARN de cadena QIAGEN, Illumina y NEB.

Procedimiento

La mayoría de las estrategias de eliminación o depleción de ARN asociadas con la construcción de bibliotecas de ARN-seq son estrategias de pretratamiento de muestras que implican la captura híbrida o la eliminación enzimática del ARN no deseado. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es compatible con QIAGEN, Illumina, KAPA, NEB y otros kits de bibliotecas de ARN y proporciona la eliminación completa del ARNr en un solo paso en línea de 14 minutos (consulte la figura "Flujo de trabajo del kit QIAseq FastSelect"). Esto es significativamente más rápido que los kits de depleción de ARN alternativos, que requieren protocolos de pretratamiento que implican más de 25 pasos y 2 horas para completarse (consulte la figura QIAseq FastSelect –5S/16S/23S frente a otros métodos: eliminación de ARNr). Los kits de epidemiología QIAseq FastSelect se integran a la perfección con su preparación existente de bibliotecas de ARN-seq, proporcionando la eliminación del ARN en un solo paso de 14 minutos, que es seguido por la limpieza de microesferas. Antes de la fragmentación térmica del ARN (opcional y dependiente del kit de preparación de la biblioteca y del tipo de muestra), QIAseq FastSelect se combina directamente con el ARN total y el tampón de fragmentación. Tras la fragmentación opcional, la temperatura de reacción se reduce gradualmente de 75 °C a 25 °C durante 14 minutos, seguido de una limpieza con microesferas. El ARN está entonces listo para la transcripción inversa.

Aplicaciones

QIAseq FastSelect permite la eliminación rápida y fiable de ARN de muestras de ARN completo o fragmentado de diversas especies. Los kits de epidemiología QIAseq FastSelect están disponibles en diversos formatos y tamaños para adaptarse a sus aplicaciones específicas.