Qiagen, 333390, Kit de eliminación de ARN personalizado QIAseq FastSelect

Incluye el kit de eliminación de ARN personalizado QIAseq FastSelect para 1536 muestras estándar

Características

- Especifique hasta 20.000 bases de ARN para su eliminación
- Estable durante al menos 18 meses cuando se almacena según las instrucciones.
- Solo un paso de pipeteo: combine el reactivo QIAseq FastSelect con ARN e incube
- Funciona con QIAGEN, Illumina, NEB, KAPA y otros kits de bibliotecas de secuenciación de ARN hebra.
- Funciona igualmente bien con ARN de alta calidad o altamente fragmentado.

Detalles del producto

Los kits de eliminación de ARN personalizados QIAseq FastSelect utilizan un método novedoso para eliminar ARN muy abundante y de bajo valor científico de sus bibliotecas de ARN-seq. Ahora puede diseñar sus propios conjuntos de QIAseq FastSelect personalizados para eliminar cualquier ARN que desee de su biblioteca de ARN-seq. Simplemente pegue las secuencias de ARN que desea eliminar en el generador personalizado de QIAseq FastSelect para generar un número de catálogo único para su conjunto de FastSelect personalizado.

Analice datos de ARN-seq con facilidad utilizando el Portal de análisis de ARN-seq integrado en GeneGlobe: una solución de análisis de datos intuitiva basada en la web creada para biólogos e incluida con este kit QIAseq.

Principio

La eliminación de transcripciones de ARN altamente expresadas, pero biológicamente poco importantes, aumenta la eficiencia de la NGS y permite un mayor rendimiento de las muestras con mayor sensibilidad. Además, la eliminación de especies de ARN no deseadas de muestras FFPE (fijadas en formalina e incluidas en parafina) y de muestras de ARN degradado es particularmente difícil y puede resultar en un rendimiento deficiente.

QIAseq FastSelect está diseñado para la eliminación rápida y eficiente de ARN no deseados del ARN total durante la preparación de bibliotecas de ARN-seq mediante NGS. QIAseq FastSelect se integra a la perfección con su flujo de trabajo de preparación de bibliotecas de ARN de cadena existente para la eliminación de ARN en un solo paso en línea de 14 minutos. Antes de la fragmentación térmica del ARN (opcional y dependiente del kit de preparación de la biblioteca y del tipo de muestra), el reactivo de eliminación QIAseq FastSelect se combina directamente con el ARN total y los tampones específicos para la preparación de la biblioteca. Tras la fragmentación, la temperatura de reacción se reduce gradualmente a temperatura ambiente y se completan los pasos restantes de la preparación de la biblioteca. No es necesario realizar ningún tipo de enriquecimiento en las muestras de ARN total. Los kits QIAseq FastSelect garantizan un alto rendimiento constante con cantidades de ARN que van desde tan solo 1 ng hasta 1 µg. QIAseq FastSelect se puede utilizar con ARN de muestras frescas, así como con ARN de muestras FFPE o ARN degradado, y ofrece una eliminación confiable de ARNr y una alta reproducibilidad en aplicaciones posteriores.

Procedimiento

La mayoría de las estrategias de eliminación o depleción de ARN asociadas con la construcción de bibliotecas de ARN-seq son estrategias de pretratamiento de muestras que implican la captura híbrida o la eliminación enzimática del ARN no deseado. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es compatible con los kits de preparación de bibliotecas de cadena QIAGEN, Illumina, KAPA y NEB y permite la eliminación completa del ARNr en un solo paso en línea de 14 minutos (véase la figura "Flujo de trabajo del kit QIAseq FastSelect"). Esto es considerablemente más rápido que los kits de depleción de ARN alternativos, que requieren protocolos de pretratamiento de más de 25 pasos y 2 horas de duración.

Simplemente añada el reactivo QIAseq FastSelect a la muestra de ARN, realice la fragmentación (si es necesario), enfríe la reacción gradualmente de 75 °C a 25 °C durante 14 minutos y, a continuación, complete los pasos restantes de preparación de la biblioteca. QIAseq FastSelect funciona con o sin fragmentación de ARN, lo que ofrece la flexibilidad de usar ARN de muestras FFPE o de ARN degradado, o ARN de alta calidad como parte de un flujo de trabajo de construcción de bibliotecas de ARN-seq estándar o FFPE.

Aplicaciones

QIAseq FastSelect permite la extracción rápida y fiable de ARN de muestras FFPE y de ARN fresco. Los kits QIAseq FastSelect están disponibles en diversos formatos y tamaños para adaptarse a sus aplicaciones específicas, como la resolución de problemas de extracción de ARN.