Qiagen, 333602, Panel de escaneo de ARN dirigido QIAseq (12)

Kit que contiene TODOS los reactivos (excepto los índices) para secuenciación de fusiones dirigidas; panel fijo para 12 muestras; menos de 100 fusiones

Características

- Cuantificación precisa de un gran número de genes de fusión
- Identificar nuevos socios de genes de fusión, sin necesidad de conocimiento previo del punto de interrupción
- Funciona con ARN de baja calidad, incluido ARN de FFPE y biopsia líquida.
- Requiere un aporte bajo de ARN, tan bajo como 15 ng de ARN no enriquecido
- Compatible con automatización

Detalles del producto

Los paneles QIAseq Targeted RNAscan son una solución completa, desde la muestra hasta la información, que aplica la estrategia de secuenciación digital de ARN basada en códigos de barras moleculares para cuantificar genes de fusión conocidos y nuevos. La secuenciación digital de ARN es un enfoque único que etiqueta los genes con códigos de barras moleculares antes de la amplificación, lo que evita los problemas de duplicados de PCR y el sesgo de la biblioteca. Además, el exclusivo enfoque de extensión de un solo cebador permite la detección de nuevos genes de fusión. El proceso de análisis de datos patentado permite realizar llamadas altamente fiables de transcripciones de fusión de baja abundancia e identificar nuevos genes de fusión.

Cada panel QIAseq Targeted RNAscan contiene todos los componentes necesarios para construir bibliotecas a partir de dianas enriquecidas. Los paneles son independientes de la plataforma y funcionan tanto en instrumentos Illumina como Ion Torrent. El diseño de cebadores se basa en la extensión de un solo cebador, donde cada diana se enriquece con un cebador específico y un cebador universal, una estrategia que reduce la cantidad de cebadores necesarios. Todos los cebadores necesarios para un panel se agrupan en un grupo de cebadores individual para reducir la manipulación de los paneles y el número de grupos necesarios para el enriquecimiento y la construcción de la biblioteca. Los índices específicos de la plataforma, incluidos en una caja independiente, permiten la multiplexación de hasta 384 muestras por secuenciación.

Actuación

- Precisión: la secuenciación digital innovadora (que incorpora códigos de barras moleculares) elimina la duplicación de PCR y el sesgo de amplificación para detectar con confianza fusiones conocidas y nuevas.
- Especificidad: La combinación única de nuestro algoritmo patentado de diseño de cebadores y las rigurosas pruebas de cada ensayo de cebadores garantizan una alta especificidad y resultados precisos.
Contenido: Los paneles RNAscan específicos de QIAseq ofrecen un alto grado de flexibilidad en la multiplexación de contenido y muestras. Se han desarrollado varios paneles catalogados para una amplia gama de aplicaciones. También se puede crear un panel personalizado para contenido específico o para ampliar el contenido de un panel catalogado existente. Se pueden multiplexar hasta 384 muestras utilizando los índices de QIAseq.
- Flexibilidad: Debido a que los paneles RNAscan dirigidos por QIAseq utilizan una única extensión de cebador, los cebadores pueden diseñarse para detectar fusiones conocidas basadas en puntos de interrupción caracterizados o para descubrir fusiones nuevas.

Aplicaciones

- FFPE
- Tejido fresco o congelado
- Líneas celulares

- Detección de fusiones genéticas conocidas basadas en puntos de ruptura bien caracterizados
- Descubrimiento de nuevas fusiones de genes utilizando diseños de cebadores basados ​​en exones o genes

Los paneles QIAseq Targeted RNAscan se pueden utilizar para detectar fusiones de genes conocidos y nuevos a partir de una amplia gama de tipos de muestras para numerosas aplicaciones.

Tipos de muestra:

Aplicaciones: