Qiagen, 333979, QIAseq Multimodal HT CW 96 UDI

QIAseq Multimodal HT CW 96 UDI contiene indexación de ADN y ARN para 96 ​​muestras utilizando el flujo de trabajo combinado para enriquecimiento dirigido

Características

- Sistema completo para pasar de ácidos nucleicos totales a una biblioteca lista para secuenciación utilizando un flujo de trabajo de un solo día
- Corrección de errores con índices moleculares únicos (UMI) para mejorar la sensibilidad del panel NGS
- La tecnología de enriquecimiento QIAseq supera las limitaciones de los enfoques de amplicones tradicionales en cuanto al tamaño de los amplicones y la multiplexación de cebadores.
- Índices duales únicos (UDI) para reducir los saltos de índice de muestra
- Solución Sample to Insight para secuenciación consolidada y específica de ADN y ARN

Detalles del producto

Los paneles multimodales QIAseq se han desarrollado para el enriquecimiento y análisis consolidados de ADN y ARN. A diferencia de otros métodos disponibles, los paneles multimodales QIAseq no requieren dos flujos de trabajo separados para el análisis de ADN y ARN, lo que ahorra tiempo y conserva muestras de disponibilidad limitada.

Se pueden diseñar paneles personalizados para apuntar a regiones exónicas de genes, puntos calientes o SNP, regiones intrónicas y promotoras, fusiones de genes conocidas basadas en puntos de interrupción caracterizados o para descubrir fusiones novedosas.

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Principio

- Se requieren grandes cantidades de material de muestra para generar cantidades suficientes de ADN y ARN de entrada para múltiples flujos de trabajo
- Mayor complejidad al derivar información integrada de los resultados de diferentes enfoques técnicos, cada uno con su propio sesgo innato.
- Uso ineficiente de los recursos
- Largo tiempo de respuesta

Los recientes avances en la química, las plataformas y los procesos bioinformáticos de NGS permiten a los usuarios interrogar eficientemente muestras biológicas para detectar cambios en el ADN y el ARN. Sin embargo, otros enfoques disponibles requieren el uso de dos flujos de trabajo separados para preparar bibliotecas a partir de aislados de ADN y ARN separados. Las limitaciones de estos enfoques incluyen:

Para superar las limitaciones de los enfoques actuales, los paneles multimodales QIAseq parten de ácidos nucleicos totales (o ADN + ARN) y preparan bibliotecas de ADN y ARN específicas compatibles con Illumina y con UDI mediante un flujo de trabajo consolidado de un solo día. Además, los paneles multimodales QIAseq están diseñados para su uso con muestras biológicas de baja calidad y bajo rendimiento.

Procedimiento

Flujo de trabajo de los paneles multimodales QIAseq

El flujo de trabajo del Panel Multimodal QIAseq permite preparar bibliotecas listas para secuenciación en un solo día. El tamaño del inserto de la biblioteca es de aproximadamente 150 pb, lo que hace que los Paneles Multimodales QIAseq sean altamente compatibles con muestras de baja calidad, como las muestras FFPE.

Detección robusta de biomarcadores de ADN y ARN

Los paneles multimodales QIAseq permiten detectar biomarcadores de ADN y ARN de forma fiable mediante un flujo de trabajo consolidado a partir de ácidos nucleicos totales. La capacidad de los paneles multimodales QIAseq para detectar simultáneamente biomarcadores de ADN y ARN se ha comparado con dos flujos de trabajo independientes (QIAseq Targeted DNA Pro y QIAseq Targeted Fusion XP).

Aplicaciones

- Variantes de un solo nucleótido (SNV)
- Inserciones y eliminaciones (InDels)
- Variantes del número de copias (CNV)

- Fusiones
- Eventos de omisión de exones
- Niveles de expresión genética

Los paneles multimodales QIAseq se pueden utilizar para interrogar diferentes tipos de biomarcadores utilizando un flujo de trabajo consolidado a partir de ácidos nucleicos totales, que se pueden aislar mediante protocolos de aislamiento de muestras dedicados que se han desarrollado específicamente para los paneles multimodales QIAseq.

Del ADN:

Del ARN: