Qiagen, 334315, QIAseq FastSelect –Kit de plantas de ARNr (24)

Incluye 3 tubos de reactivo QIAseq FastSelect para la eliminación de ARNr citoplasmático, mitocondrial y de cloroplasto; suficiente para 24 reacciones de muestras de plantas

Características

- Compatible con los kits de bibliotecas de secuenciación de ARN de cadena QIAGEN, Illumina, NEB y KAPA
- Reactivo único para hojas, tallos y raíces de plantas.
- Eliminación de ARNr de plantas citoplasmáticas, mitocondriales y de cloroplastos de alto rendimiento en solo 14 minutos
- Solo un paso de pipeteo: combine el reactivo QIAseq FastSelect con ARN e incube
- No se requieren pasos de limpieza adicionales ni cambios en el protocolo de la biblioteca NGS

Detalles del producto

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant utilizan un método novedoso para eliminar ARN muy abundante y de bajo valor científico de sus bibliotecas de ARN-seq. Los investigadores que utilizan ARN-seq para el análisis del transcriptoma completo pueden usar los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant para eliminar ARNr citoplasmático (5.8S, 18S y 25S), mitocondrial (5S, 18S y 26S) y cloroplástico (4.5S, 5S, 16S y 23S).

Analice datos de ARN-seq con facilidad utilizando el Portal de análisis de ARN-seq integrado en GeneGlobe: una solución de análisis de datos intuitiva basada en la web creada para biólogos e incluida con este kit QIAseq.

Recomendamos utilizar los kits de biblioteca de ARN trenzado QIAseq para una preparación robusta de bibliotecas de ARN-seq específicas de cada cadena, tanto para ARN de alta calidad como altamente fragmentado.

Diseñe sus propios grupos QIAseq FastSelect personalizados para eliminar cualquier ARN que desee de su biblioteca de ARN-seq: eche un vistazo a nuestros kits de eliminación de ARN personalizados QIAseq FastSelect.

¿Quieres probar el kit QIAseq FastSelect –rRNA Plant por primera vez? Solicita un kit de prueba para evaluarlo.

Actuación

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant demostraron una eliminación altamente eficiente de ARNr (figura Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant son ampliamente compatibles con diferentes plantas) y un rendimiento sólido (figura QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant mejora drásticamente la cantidad de genes detectados).

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant también brindan resultados de expresión genética reproducibles (figura Reproducibilidad de QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant) y un mapeo de lectura consistente con una variedad de plantas.

Ver figuras:

QIAseq FastSelect – Mapeo de exones, intrones e intergénicos de plantas con ARNr

QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant cambia drásticamente la asignación de lectura del ARNr a los genes: Arabidopsis

QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant cambia drásticamente la asignación de lectura del ARNr a los genes: maíz

QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant cambia drásticamente la asignación de lectura del ARNr a los genes: arroz

QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant cambia drásticamente la asignación de lectura del ARNr a los genes: soja

QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant cambia drásticamente la asignación de lectura del ARNr a los genes: algodón

QIAseq FastSelect ‒rRNA Plant cambia drásticamente la asignación de lectura del ARNr a los genes: gráfico de barras

Principio

La eliminación de transcripciones de ARN altamente expresadas, pero biológicamente poco importantes, aumenta la eficiencia de la NGS y permite un mayor rendimiento de las muestras con mayor sensibilidad. Además, la eliminación de especies de ARN no deseadas de muestras de ARN completas y fragmentadas puede ser especialmente compleja y puede resultar en un rendimiento deficiente.

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant están diseñados para la eliminación rápida y eficiente del ARNr vegetal presente en los ribosomas citoplasmáticos, mitocondriales y cloroplásticos del ARN total durante la preparación de bibliotecas de ARN NGS. QIAseq FastSelect se integra a la perfección con su flujo de trabajo de preparación de bibliotecas de ARN de cadena existente para la eliminación del ARN en un solo paso en línea de 14 minutos. Antes de la fragmentación térmica del ARN (opcional y dependiente del kit de preparación de la biblioteca y del tipo de muestra), el reactivo de eliminación QIAseq FastSelect se combina directamente con el ARN total y los tampones específicos para la preparación de la biblioteca. Tras la fragmentación, la temperatura de reacción se reduce gradualmente a temperatura ambiente y se completan los pasos restantes de la preparación de la biblioteca. No es necesario realizar ningún tipo de enriquecimiento en las muestras de ARN total. Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant garantizan un alto rendimiento constante con cantidades de ARN que van desde tan solo 1 ng hasta 1 μg. QIAseq FastSelect se puede utilizar con ARN de muestras frescas de muchas especies de plantas y ofrece una eliminación confiable de ARNr y una alta reproducibilidad en aplicaciones posteriores.

Procedimiento

La mayoría de las estrategias de eliminación o depleción de ARN asociadas con la construcción de bibliotecas de ARN-seq son estrategias de pretratamiento de muestras que implican la captura híbrida o la eliminación enzimática del ARN no deseado. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es compatible con los kits de preparación de bibliotecas de cadena QIAGEN, Illumina, KAPA y NEB y permite la eliminación completa del ARNr en un solo paso en línea de 14 minutos (figura del flujo de trabajo del kit QIAseq FastSelect). Esto es considerablemente más rápido que los kits de depleción de ARN alternativos, que requieren protocolos de pretratamiento de más de 25 pasos y 2 horas de duración.

Simplemente añada el reactivo QIAseq FastSelect a la muestra de ARN, realice la fragmentación (si es necesario), enfríe la reacción gradualmente de 75 °C a 25 °C durante 14 minutos y, a continuación, complete los pasos restantes de preparación de la biblioteca. QIAseq FastSelect funciona con o sin fragmentación de ARN, lo que ofrece la flexibilidad de usar ARN fragmentado de muestras vegetales o ARN de alta calidad como parte de un flujo de trabajo estándar de construcción de bibliotecas de ARN-seq.

Aplicaciones

QIAseq FastSelect permite la extracción rápida y fiable de ARN de muestras de ARN completo o fragmentado de diversas especies vegetales. Los kits QIAseq FastSelect –rRNA Plant están disponibles en diversos formatos y tamaños para adaptarse a sus aplicaciones específicas, como el análisis del transcriptoma completo.