Qiagen, 334378, QIAseq FastSelect - Kit de globina (384)

Incluye 4 tubos de reactivo QIAseq FastSelect para la eliminación de ARNm de globina; suficiente para 384 reacciones de muestras humanas, de ratón y de rata

Características

- Compatible con los kits de bibliotecas de secuenciación de ARN de cadena QIAGEN, Illumina, NEB y KAPA
- Reactivo único para humanos, ratones, ratas y otras especies de mamíferos.
- Eliminación de ARNr y/o globina de alto rendimiento en solo 14 minutos
- Solo un paso de pipeteo: combine el reactivo QIAseq FastSelect con ARN e incube
- No se requieren pasos de limpieza adicionales ni cambios en el protocolo de la biblioteca NGS

Detalles del producto

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA HMR y QIAseq FastSelect –Globin utilizan un novedoso método para eliminar ARN muy abundante y de bajo valor científico de sus bibliotecas de ARN-seq. Los investigadores que utilizan ARN-seq para el análisis del transcriptoma completo pueden usar QIAseq FastSelect –rRNA HMR para eliminar ARNr citoplasmático y mitocondrial, mientras que los investigadores que empiezan con muestras de sangre pueden usar QIAseq FastSelect –rRNA/Globin para eliminar tanto ARNr como ARNm de globina. Para los investigadores que enriquecen ARNm de sangre y solo desean eliminar ARNm de globina, recomendamos QIAseq FastSelect –Globin. Los kits QIAseq FastSelect –rRNA HMR y QIAseq FastSelect –Globin eliminan más ARN no deseado y son un 30 % más rápidos que nuestros kits anteriores.

Analice datos de RNA-seq con facilidad utilizando el Portal de análisis de RNA-seq integrado en GeneGlobe: una solución de análisis de datos intuitiva basada en la web creada para biólogos e incluida con este kit QIAseq.

Recomendamos utilizar los kits de biblioteca de ARN trenzado QIAseq, kits de preparación de bibliotecas de ARN robustas y específicas de cada cadena, para muestras de alta calidad y altamente fragmentadas, como FFPE.

Diseñe sus propios grupos QIAseq FastSelect personalizados para eliminar cualquier ARN que desee de su biblioteca de ARN-seq: eche un vistazo a nuestros kits de eliminación de ARN personalizados QIAseq FastSelect.

¿Quieres probar el kit QIAseq FastSelect –rRNA/Globin por primera vez? Solicita un kit de prueba para evaluarlo.

Actuación

Los kits QIAseq FastSelect –rRNA HMR demostraron una eliminación altamente eficiente de ARNr y un rendimiento superior en comparación con nuestras versiones anteriores del kit y productos alternativos. Ver figuras: El kit QIAseq FastSelect –rRNA HMR elimina ARNr con 1 paso en 14 minutos. El kit QIAseq FastSelect –rRNA HMR tiene una cobertura completa para eliminar dianas de ARNr citoplasmático y mitocondrial. El kit QIAseq FastSelect –Globin tiene una cobertura completa para eliminar ARNm de globina adulta, fetal y embrionaria. El kit QIAseq FastSelect –rRNA HMR proporciona una mayor eliminación de ARNr que las versiones anteriores del kit. El kit QIAseq FastSelect –rRNA HMR muestra resultados de expresión génica comparables con las versiones anteriores del kit. El kit QIAseq FastSelect –rRNA HMR mantiene el perfil de expresión: detección de genes expresados ​​(RPKM >0,3). El kit QIAseq FastSelect–rRNA HMR mantiene el perfil de expresión: detección consistente de genes expresados ​​(RPKM >0,3).

Rendimiento robusto con una variedad de tipos de muestras, independientemente de la entrada de ARN

QIAseq FastSelect proporciona una eliminación confiable de ARNr, un mapeo de lectura consistente y resultados de expresión genética reproducibles con ARN extraído de varios tipos de muestras, incluido FFPE, y en un amplio rango de cantidades de entrada de ARN. Consulte las figuras: QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit es una solución única que elimina el ARNr mitocondrial y citoplasmático de muestras humanas, de ratón, de rata y de otros mamíferos QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit proporciona una distribución consistente del mapeo de lecturas entre réplicas QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit muestra resultados consistentes en un amplio rango de entrada de ARN: eliminación altamente eficiente y reproducible de ARNr y ARNm de globina, independientemente de la entrada de ARN QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit muestra resultados consistentes en un amplio rango de entrada de ARN: descomposición altamente consistente de lecturas mapeadas, independientemente de la entrada de ARN QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit muestra resultados consistentes en un amplio rango de entrada de ARN: resultados de expresión génica QIAseq FastSelect –rRNA HMR funciona con muestras de ARN degradado y FFPE QIAseq FastSelect –rRNA HMR funciona con muestras de ARN degradado y FFPE: la eliminación de ARNr conduce a un aumento Mapeo de exones QIAseq FastSelect –rRNA HMR funciona con muestras de ARN FFPE y degradado: resultados de expresión génica QIAseq FastSelect –rRNA HMR: rendimiento robusto con muestras de ARN FFPE QIAseq FastSelect –rRNA HMR: rendimiento robusto con muestras de ARN FFPE: resultados de expresión génica

Principio

Tras usar el kit de extracción de ARNm, la eliminación de transcripciones de ARN altamente expresadas, pero biológicamente poco importantes, aumenta la eficiencia de la NGS y permite un mayor rendimiento de las muestras con mayor sensibilidad. Además, la eliminación de especies de ARN no deseadas de muestras FFPE y de muestras de ARN degradado es especialmente compleja y puede resultar en un rendimiento deficiente.

QIAseq FastSelect está diseñado para la eliminación rápida y eficiente de ARNr citoplasmático y mitocondrial y/o ARNm de globina del ARN total durante la preparación de bibliotecas de ARN NGS. QIAseq FastSelect se integra a la perfección con su flujo de trabajo de preparación de bibliotecas de ARN de cadena existente para la eliminación de ARN en un solo paso en línea de 14 minutos. Antes de la fragmentación térmica del ARN (opcional y dependiente del kit de preparación de la biblioteca y del tipo de muestra), el reactivo de eliminación QIAseq FastSelect se combina directamente con el ARN total y los tampones específicos para la preparación de la biblioteca. Tras la fragmentación, la temperatura de reacción se reduce gradualmente a temperatura ambiente y se completan los pasos restantes de la preparación de la biblioteca. No es necesario realizar ningún tipo de enriquecimiento en las muestras de ARN total. Los kits QIAseq FastSelect –rRNA HMR y QIAseq FastSelect –Globin garantizan un alto rendimiento constante con cantidades de ARN que van desde tan solo 1 ng hasta 1 µg. QIAseq FastSelect se puede utilizar con ARN de muestras frescas, así como con ARN de muestras FFPE (fijadas con formalina e incluidas en parafina) o ARN degradado, y ofrece una eliminación confiable de ARNr y una alta reproducibilidad en aplicaciones posteriores.

Procedimiento

La mayoría de las estrategias de eliminación o depleción de ARN asociadas con la construcción de bibliotecas de ARN-seq son estrategias de pretratamiento de muestras que implican la captura híbrida o la eliminación enzimática del ARN no deseado. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es compatible con los kits de preparación de bibliotecas de cadena QIAGEN, Illumina, KAPA y NEB y permite la eliminación completa del ARNr en un solo paso en línea de 14 minutos (figura del flujo de trabajo del kit QIAseq FastSelect). Esto es considerablemente más rápido que los kits de depleción de ARN alternativos, que requieren protocolos de pretratamiento de más de 25 pasos y 2 horas de duración.

Simplemente añada el reactivo QIAseq FastSelect (eliminación de ARNr y/o eliminación de globina) a la muestra de ARN, realice la fragmentación (si es necesario), enfríe la reacción gradualmente de 75 °C a 25 °C durante 14 minutos y, a continuación, complete los pasos restantes de preparación de la biblioteca. QIAseq FastSelect funciona con o sin fragmentación de ARN, lo que ofrece la flexibilidad de utilizar ARN de muestras FFPE o de ARN degradado, o ARN de alta calidad como parte de un flujo de trabajo estándar de construcción de bibliotecas de ARN-seq.

Aplicaciones

QIAseq FastSelect permite la eliminación rápida y fiable de ARN de muestras FFPE y de fuentes de ARN de muestra fresca. Los kits QIAseq FastSelect –rRNA HMR y QIAseq FastSelect –Globin están disponibles en diversos formatos y tamaños para adaptarse a sus aplicaciones específicas.