Qiagen, 335580, QIAseq ADN de metilo 8-Índice I

Caja que contiene índices, suficientes para procesar un total de 24 muestras, para indexar hasta un total de 8 muestras para ejecuciones de secuenciación del QIAseq Targeted Methyl Panel en plataformas Illumina

Características

- Sistema completo para pasar del ADN convertido con bisulfito a una biblioteca lista para secuenciar mediante un flujo de trabajo de un solo día
- Corrección de errores con índices moleculares únicos (UMI) para mejorar la sensibilidad del panel NGS
- El enfoque de tecnología de enriquecimiento QIAseq que aumenta la sensibilidad y supera los desafíos de focalización en comparación con otras tecnologías NGS
- Soluciones integradas de análisis Sample to Insight con QIAGEN GeneGlobe basado en la nube o software QIAGEN CLC Genomics Workbench instalado localmente

Detalles del producto

Los paneles de metilo dirigidos QIAseq ofrecen una solución de un solo día capaz de identificar miles de sitios CpG en el genoma. Al igual que los paneles de ADN dirigidos, las soluciones QIAseq se basan en la tecnología de enriquecimiento QIAseq, que proporciona una solución sensible y específica para detectar regiones en todo el genoma.

Para productos personalizados, consulte nuestros paneles personalizados de metilo dirigido QIAseq.

Actuación

Los paneles de metilo dirigidos QIAseq ofrecen una alta eficiencia de mapeo (figura Panel de metilo dirigido QIAseq: eficiencia de mapeo), alta reproducibilidad (figura Panel de metilo dirigido QIAseq: reproducibilidad del grado de metilación) y alta correlación con los métodos establecidos (figuras Panel de metilo dirigido QIAseq: alta correlación con los métodos establecidos y Panel de metilo dirigido QIAseq: estado de metilación del ADN FFPE: grado de metilación).

Principio

La epigenética describe el estudio de los cambios hereditarios en la función génica que ocurren sin cambios en la secuencia nuclear del ADN. Además del silenciamiento asociado al ARN y la modificación de histonas, un mecanismo epigenético importante en eucariotas de orden superior es la metilación del ADN. Los cambios epigenéticos desempeñan un papel crucial en la regulación de procesos celulares importantes, como la expresión génica y la diferenciación celular, y también se han identificado como factores clave en diversas enfermedades.

La metilación del ADN ocurre en los residuos de citosina, especialmente en las islas CpG, que son regiones ricas en GC. Generalmente se agrupan alrededor de la región reguladora de los genes y pueden afectar su regulación transcripcional. Se sabe que la metilación de las islas CpG inactiva la expresión génica y desempeña un papel importante en el desarrollo normal y patológico. La metilación de citosina también puede ocurrir en contenido sin CpG, como se describe en las células madre embrionarias.

Los paneles QIAseq Targeted Methyl permiten la secuenciación de nueva generación (NGS) dirigida, desde la muestra hasta la información, para analizar el grado de metilación del ADN. Esta solución altamente optimizada facilita la detección sensible de la metilación del ADN mediante índices moleculares únicos (UMI) integrados en células, tejidos y biofluidos. La cantidad de plantilla necesaria para una sola reacción de secuenciación QIAseq Targeted Methyl varía de 1 a 100 ng para ADNg fresco, de 10 a 200 ng para ADN FFPE o de 10 a 100 ng para ADNccf.

Procedimiento

Los QIAseq Targeted Methyl Panels emplean un flujo de trabajo optimizado (figura QIAseq Targeted Methyl Panel sequencing workflow) para generar bibliotecas enfocadas a partir de múltiples tipos de entrada, incluyendo muestras difíciles como FFPE y biopsia líquida (ccfDNA). Primero, se realiza la conversión de bisulfito del ADN aislado (producto recomendado: EpiTect Fast Bisulfite Kit), seguida de la reparación del extremo del ADN. Posteriormente, durante el enriquecimiento del objetivo, se agrega un índice molecular único (UMI) a la biblioteca de ADN. Los UMI son secuencias de código de barras únicas que permiten el análisis bioinformático para excluir duplicados y corregir errores en el estado de metilación de la muestra. Los QIAseq Targeted Methyl Panels utilizan la tecnología de enriquecimiento QIAseq, un método de PCR que utiliza un solo cebador específico del objetivo, con un cebador universal. Este enfoque aumenta la eficiencia del diseño, haciéndolo más sensible para muestras difíciles, al tiempo que maximiza la cobertura de las regiones de interés.

Aplicaciones

- Detección del estado de metilación en muestras FFPE
- Detección del estado de metilación a partir de biopsia líquida
- Detección de marcadores de metilación específicos de células y tejidos.