Qiagen, 335925, kit QIAseq FastSelect –5S/16S/23S (24)

Incluye 3 tubos de reactivo de eliminación de ARNr QIAseq FastSelect –5S/16S/23S, tampón de reacción, QIAseq Beads con tampón de unión de QIAseq Beads y agua libre de nucleasas suficiente para 24 muestras.

Características

- Eliminación de ARNr 5S/16S/23S panbacteriano de ARN fragmentado o de longitud completa para estudios de metatranscriptómica
- Nuevo mecanismo de eliminación de ARN que no implica captura híbrida ni digestión enzimática.
- Combinar con QIAseq FastSelect –rRNA HMR para la eliminación de ARN ribosómico de muestras humanas, de ratón y de rata para estudios de microbios hospedadores
- Compatible con los kits de preparación de bibliotecas de secuenciación de ARN de cadena QIAGEN, Illumina, NEB y KAPA
- El diseño in silico predice el bloqueo de >95% de todas las secuencias de bases de datos de ARNr 5S, 16S y 23S

Detalles del producto

Los kits QIAseq FastSelect –5S/16S/23S utilizan un novedoso método para eliminar el ARNr 5S/16S/23S bacteriano altamente abundante de su biblioteca de ARN-seq. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S fue diseñado específicamente para muestras microbianas comunitarias complejas de suelo, agua, heces y lodos, que albergan poblaciones bacterianas numerosas y diversas. La cobertura de ARNr que ofrece este kit se basa en secuencias SILVA 16S (casi 600.000 entradas), secuencias SILVA 23S (casi 170.000 entradas) y secuencias de bases de datos de ARNr 5S (más de 7200 entradas). El modelado in silico muestra una cobertura de más del 95 % de todas las secuencias de ARNr 5S, 16S y 23S conocidas.

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S se ha probado con los kits de bibliotecas de ARN-seq de QIAGEN, Illumina y NEB y es compatible con los principales métodos de preparación de bibliotecas de ARN-seq. Su sencillo protocolo de 14 minutos y la limpieza de microesferas se integran a la perfección con todos los kits comunes de bibliotecas de ARN-seq y pueden utilizarse con ARN fragmentado o de longitud completa (no fragmentado).

Para la eliminación de ARNr humano, de ratón, de rata y de otros mamíferos, consulte nuestros kits QIAseq FastSelect –rRNA HMR.

Además, consulte nuestros kits de biblioteca de ARN trenzado QIAseq para una preparación sólida de bibliotecas de ARN-seq.

Diseñe sus propios grupos QIAseq FastSelect personalizados para eliminar cualquier ARN que desee de su biblioteca de ARN-seq: eche un vistazo a nuestros kits de eliminación de ARN personalizados QIAseq FastSelect.

¿Quieres probar esta solución por primera vez? Solicita un kit de prueba para evaluarla.

Actuación

De acuerdo con el Sistema de gestión de calidad con certificación ISO de QIAGEN, cada lote del kit QIAseq FastSelect –5S/16S/23S se prueba según especificaciones predeterminadas para garantizar una calidad constante del producto.

Los kits QIAseq FastSelect –5S/16S/23S proporcionan una eliminación robusta de ARNr en diversos tipos de muestras. Consulte las figuras: QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: eliminación robusta de ARNr en muestras de la comunidad intestinal. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: eliminación robusta de ARNr en la comunidad bacteriana (28 cepas). QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: eliminación robusta de ARNr en la comunidad bacteriana: análisis de mapeo (28 cepas).

Los kits QIAseq FastSelect –5S/16S/23S ofrecen una eliminación de ARNr altamente eficiente y reproducible. Consulte las figuras: QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: eliminación robusta y reproducible de ARNr del microbioma intestinal. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: eliminación robusta y reproducible de ARNr del microbioma intestinal: resultados de expresión génica. Eliminación reproducible de ARNr de E. coli K12 con QIAseq FastSelect –5S/16S/23S. Eliminación reproducible de ARNr de E. coli K12 con QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: resultados de expresión génica. Eliminación reproducible de ARNr de E. coli K12 con QIAseq FastSelect –5S/16S/23S: resultados de expresión génica (100 ng, 1 µg).

Los kits QIAseq FastSelect –5S/16S/23S demostraron una eliminación de ARNr altamente eficiente y un rendimiento superior en comparación con métodos alternativos. Consulte las figuras: QIAseq FastSelect –5S/16S/23S frente a otros métodos: eliminación de ARNr. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S frente a otros métodos: lecturas de secuenciación. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S frente a otros métodos: lecturas totales asignadas a ARNr.

Los kits QIAseq FastSelect –5S/16S/23S son compatibles con una amplia gama de kits de bibliotecas de ARN-seq. Consulte las figuras: QIAseq FastSelect –5S/16S/23S es compatible con una amplia gama de kits de bibliotecas de ARN-seq, incluidos QIAGEN, Illumina y NEB. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S es compatible con una amplia gama de kits de bibliotecas de ARN-seq, incluidos QIAGEN, Illumina y NEB: detección de genes. QIAseq FastSelect –5S/16S/23S es compatible con una amplia gama de kits de bibliotecas de ARN-seq, incluidos QIAGEN, Illumina y NEB: expresión génica.

Principio

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S es un kit panbacteriano de eliminación de ARNr, utilizado tras la extracción de ARN bacteriano, diseñado para eliminar ARNr 5S, 16S y 23S de muestras de comunidades bacterianas complejas. Nuestro completo reactivo de eliminación de ARNr se ha diseñado utilizando secuencias de ARNr 16S (casi 600.000 entradas), 23S (casi 170.000 entradas) y 5S (más de 7200 entradas). El modelado in silico predice una eliminación de ARNr superior al 95 % de todas las secuencias de ARNr 5S, 16S y 23S conocidas.

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S admite cantidades de ARN desde tan solo 20 ng hasta 1 µg, con un rendimiento alto y constante, y es compatible con ARN de longitud completa de baja calidad, altamente fragmentado o de alta calidad. Dado que QIAseq FastSelect –5S/16S/23S no utiliza digestión enzimática ni procedimientos de captura híbrida, su flujo de trabajo rápido y sencillo permite una eliminación fiable del ARNr y una alta reproducibilidad en aplicaciones posteriores.

Procedimiento

La mayoría de las estrategias de eliminación o depleción de ARN asociadas con la construcción de bibliotecas de ARN-seq consisten en pretratamientos de muestras que incluyen la captura híbrida o la eliminación enzimática del ARN no deseado. Nuestro exclusivo procedimiento QIAseq FastSelect es significativamente más rápido y compatible con la mayoría de los kits de bibliotecas de ARN-seq. QIAGEN FastSelect –5S/16S/23S se ha probado con los kits de bibliotecas de ARN-seq de cadena QIAGEN, Illumina y NEB.

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S se integra a la perfección con la preparación de su biblioteca de ARN-seq, eliminando el ARN en un solo paso de 14 minutos, seguido de la limpieza de las microesferas (figura del flujo de trabajo de QIAseq FastSelect –5S/16S/23S). Antes de la fragmentación térmica del ARN (opcional y según el kit de preparación de la biblioteca y el tipo de muestra), el reactivo de eliminación QIAseq FastSelect –5S/16S/23S se combina directamente con el ARN total y el tampón de fragmentación. Tras la fragmentación opcional, la temperatura de reacción se reduce gradualmente de 75 °C a 25 °C durante 14 minutos, seguido de la limpieza de las microesferas. El ARN está listo para la transcripción inversa. Esto es considerablemente más rápido que otros métodos de eliminación de ARN, que requieren más de 25 pasos y aproximadamente 2 horas para completarse (figura Agotamiento de ARNr bacteriano: productos alternativos vs. QIAseq Fast Select –5S/16S/23S).

Aplicaciones

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S ofrece una eliminación rápida y confiable de ARNr para aislamientos bacterianos, así como para comunidades bacterianas complejas.